4 de enero. Martín Cauteruccio extendió su vínculo con San Lorenzo hasta junio de 2019.[4]
5 de enero. Ramiro Arias fue presentado en Aldosivi. Jugaría a préstamo durante 18 meses.[5]
6 de enero. Brian Luciatti seguirá otros seis meses en Almagro.[6]
7 de enero. Mauro Matos extendió su vínculo con San Lorenzo hasta junio de 2017.[4]
7 de enero. Octavio Bilbao rescindió su contrato y fichó por Tiro Federal.[7]
8 de enero. Nike presentó en sociedad el modelo que lucirá el equipo en 2016. Parecido al del año anterior, se destacan las franjas más gruesas y la "pipa" roja.[8]
10 de enero. Ezequiel Montagna fue presentado en San Martín de San Juan. Jugaría a préstamo durante 18 meses, con cláusula de regreso a los 6 meses si es de ser necesario.[12]
12 de enero. Amistoso Disputa el primer partido por la Copa Ciudad de Mar del Plata contra Independiente, en Mar del Plata, donde se impondría el empate 1-1.[13]
15 de enero. El colombiano Pedro Franco se convirtió en el primer refuerzo y firmó su vínculo con San Lorenzo. El defensor jugará a préstamo por 6 meses sin cargo y con opción de compra por $1.800.000 de dólares.[14]
17 de enero. Amistoso Disputa el clásico contra Huracán, en Mar del Plata. El ciclón perdería 3-1.[15]
19 de enero. El juvenil Marcos Senesi, firmó su primer contrato con San Lorenzo que lo vincula al club hasta junio de 2019.
20 de enero. Nicolás Navarro se convirtió en el segundo refuerzo y firmó su vínculo con San Lorenzo hasta junio de 2018. El jugador llegó libre de Gimnasia de La Plata.[17]
25 de enero. Fernando Belluschi se convirtió en el tercer refuerzo y firmó su vínculo con San Lorenzo hasta junio de 2017. El jugador llegó libre de Cruz Azul.[22]
26 de enero. Paulo Díaz llegó a la Argentina para ponerse a las órdenes de Pablo Guede, pero la compra no terminó de cerrarse debido a que Palestino le exige a Colo-Colo el 25% del 50% que se le vendió a San Lorenzo en 1 millón de dólares.[23] El 10 de febrero se resuelve su situación y firma contrato por tres años.[24]
26 de enero. Amistoso Disputa el segundo partido por la Copa Ciudad de Mar del Plata contra River Plate, en Mar del Plata. El ciclón perdería 3-2.[25]
28 de enero. Ezequiel Cerutti se convirtió en el cuarto refuerzo y firmó su vínculo con San Lorenzo hasta junio de 2020. El jugador llegó a cambio de 3 millones de dólares proveniente de Estudiantes de La Plata.[26] Se encontraba entrenado con el equipo desde el 21 de enero.
2 de febrero. Marcos Angeleri se convirtió en el quinto refuerzo y firmó su vínculo con San Lorenzo hasta junio de 2018. El jugador llegó libre proveniente del Málaga CF.[27]
10 de febrero. Supercopa Argentina 2015 San Lorenzo disputa la Supercopa como resompensa de haber salido subcampeón del Toneo local del 2015. La disputa frente a Boca Juniors, el cual fue campeón de dicho torneo y de la Copa Argentina. El resultado final fue 4-0 para San Lorenzo. Fernando Belluschi puso al final del primer tiempo el 1-0, un doblete de Pablo Barrientos, el primero después de una gran asistencia de Belluschi y otro desde un tiro libre de larga distancia. El gol que coronaría la goleada y la obtención del título lo haría Nicolás Blandi.
26 de febrero. La camiseta de San Lorenzo homenaje al Papa Francisco está presente en el Museo de la FIFA.[30][31] La camiseta que estará en el museo se utilizó el 16 de marzo de 2013, tres días después que se designara al sumo pontífice. Fue ante Colón, en Santa Fe y terminó con triunfo por 1-0.[32]
9 de marzo. Fecha 3 Segunda fase Juega su tercer partido de la Copa Libertadores 2016 frente a Grêmio en el Arena do Grêmio. Fue empate 1-1. El ciclón jugó mejor y dominó la pelota a lo largo de todo el partido, pero no logró superar al conjunto local. Gremio abrió la cuenta con un tiro libre de Fred, que llegó en el mejor momento del Ciclón en el encuentro. Sin embargo, dominando la tenencia de balón y con paciencia al momento de buscar los espacios, los dirigidos por Pablo Guede insistieron en la búsqueda del empate, que finalmente llegó a los 32 minutos de la primera etapa, tras un cabezazo de Martín Cauteruccio que Marcelo Grohe terminó metiendo en contra. San Lorenzo se hizo dueño de la pelota a lo largo de la segunda etapa, intentando encontrar el camino para marcar su segundo tanto. Sin embargo no logró la efectividad deseada para quedarse con el triunfo. Jugó mejor, pero no alcanzó.
15 de marzo. Fecha 4 Segunda fase Juega su cuarto partido de la Copa Libertadores 2016 frente a Grêmio en el Estadio Pedro Bidegain. Fue empate 1-1. El ciclón comenzó ganando el partido con un penal de Néstor Ortigoza a los 4 minutos de juego. A lo largo de la primera etapa tuvo las chances de convertir nuevamente, pero le faltó la efectividad en los últimos metros. En la segunda etapa, el Ciclón buscó mantener la posesión de la pelota para controlar el juego. Sobre el final, cuando dominaba el encuentro en todos los sectores del campo, Gremio logró la paridad en los pies de Lincoln.
20 de marzo. Fecha 8 Se enfrenta a Quilmes en el Estadio Centenario Dr. José Luis Meiszner por el Campeonato de Primera División 2016. Fue derrota 0-3. En un encuentro que comenzó siendo de ida y vuelta, pero el local logró pasar al frente con un tanto de Ezequiel Rescaldani de penal, tras una mano de Ezequiel Cerutti en el área. A partir de allí, el cervecero se replegó atrás y cortó los avances del Ciclón con faltas sobre sus generadores de juego. Así, neutralizó la ofensiva del conjunto comandado por Pablo Guede, para irse al descanso ganando por la mínima. En la segunda etapa, San Lorenzo buscó el empate desde los primeros minutos, pero no encontró la efectividad deseada en los últimos metros. El anfitrión, aprovechó un contraataque para convertir el 2-0 con un remate de cabeza de Matías Orihuela tras un centro de Sebastián Romero. Minutos más tarde, marcó el tercer tanto con un cabezazo de Rescaldani. El Ciclón, no encontró los caminos para descontar y pasar al frente en el encuentro, por lo que terminó cayendo en el Sur.
3 de abril. Fecha 9 Se enfrenta a Belgrano en el Estadio Pedro Bidegain por el Campeonato de Primera División 2016. Fue victoria para el Ciclón por 3-2. San Lorenzo se plantaba mejor en el campo de juego, pero no lograba concretar el último toque. Belgrano, en dos llegadas, logró ponerse 2-0 con dos goles de Sebastián Luna. Pero el equipo comandado por Pablo Guede, gracias a los goles de Sebastián Blanco y Ezequiel Cerutti, logró irse al descanso con un empate. En la segunda mitad, el Ciclón dominó los hilos del partido y a los 12 minutos, Fernando Belluschi sacó un potente remate, que tras un desvío se metió en el arco defendido por Juan Carlos Olave. A partir de allí, San Lorenzo se impuso para terminar quedándose con el triunfo y cortar una racha de 8 partidos sin conocer la victoria.
8 de abril. Fecha 10 Se enfrenta a Godoy Cruz en el Estadio Malvinas Argentinas por el Campeonato de Primera División 2016. Fue victoria para el Ciclón por 1-0. El juego, en definitiva, se hizo bastante trabado y, adaptándose a la situación del campo, ambos equipos privilegiaron los ataques directos en lugar de la tenencia de la pelota. En ese panorama, el visitante mereció algo más, con Sebastián Blanco como hombre más peligroso hasta su salida, por Martín Cauteruccio. Esa superioridad que había insinuado San Lorenzo se trasladó a la red tras una gran recuperación de Néstor Ortigoza, un buen desborde de Emmanuel Mas y el gol de Martín Cauteruccio, que apareció a la salida de un tiro libre donde más cómodo se siente: en el área.
12 de abril. Fecha 5 Segunda fase Juega su quinto partido de la Copa Libertadores 2016 frente a Toluca en el Estadio Nemesio Díez. Fue derrota 2-1. San Lorenzo lo ganaba con gol de Nicolás Blandi, pero sobre el final no aguantó el esfuerzo que implica jugar en la altura y con dos goles de Fernando Uribe el local lo dio vuelta, con este resultado el Ciclón quedó afuera de la Copa Libertadores.
17 de abril. Fecha 11 Se enfrenta a Rosario Central en el Estadio Pedro Bidegain por el Campeonato de Primera División 2016. Fue victoria para San Lorenzo por 2-1. El partido empezó mal para el Ciclón, ya que no jugaba bien y además el árbitro cobraba un penal polémico para Rosario Central, que Marco Rubén cambiaría por gol. En el primer tiempo no le salía nada a San Lorenzo y en uno de sus peores momentos, tras una corrida de Ezequiel Cerutti y un gran centro de este a la cabeza de Matías Caruzzo, el Ciclón encontraría un empate impensado por como se estaban dando las cosas. El segundo tiempo hubo un cambio rotundo en la forma de jugar del equipo de Pablo Guede, tal fue así, que tras una serie de rebotes, Franco Mussis encontró un rebote fuera del área y con un tremendo bombazo de zurda puso el 2 a 1 para San Lorenzo. El resto del partido fue un amplio dominio de los locales y así terminaría el encuentro.
19 de abril. Fecha 6 Segunda fase Juega su sexto partido de la Copa Libertadores 2016 frente a Liga de Quito en el Estadio Pedro Bidegain. Fue empate 1-1. El Ciclón finalizó su participación en la Copa en un partido repleto de suplentes y haciendo debutar a varias promesas del club. José Cevallos pondría el 1-0 para los ecuatorianos, pero Ezequiel Ávila pondría el empate a diez minutos del final tras una gran asistencia de Leandro Romagnoli.
23 de abril. Fecha 12 Se enfrenta a Huracán en el Estadio Pedro Bidegain por el Campeonato de Primera División 2016. Fue victoria para el Ciclón por 1-0. El clásico fue intenso. Huracán arrancó mejor, mucho mejor que el Ciclón: a los 30 segundos Mariano González dio el primer aviso cuando los jugadores de San Lorenzo aún se acomodaban en el cancha. El Globo impuso su juego. Creó las mejores chances de peligro. González se lo volvió a perder porque su tiro dio en el travesaño. El Globo bajó la intensidad y el Ciclón fue ganando metros e imponiendo autoridad. Y de repente, Néstor Ortigoza lo habilitó al Pablo Barrientos y este asistió a Nicolás Blandi para sellar el 1-0. El partido salió de sus parámetros y empezó a ser golpe por golpe. Una mano zonza de Mauro Bogado, de la cual debió haber visto su segunda amarilla y no fue así, derivó en el penal que falló Ortigoza (es el segundo que erra en 34 ejecutados). Ramón Ábila casi lo iguala con una tremenda media vuelta y sobre el final, Matías Caruzzo tocó de atrás a Ábila en el área y era penal. Pero el juez dejó seguir y así terminó el clásico.
30 de abril. Fecha 13 Se enfrenta a Independiente en el Estadio Libertadores de América por el Campeonato de Primera División 2016. Fue victoria para el Ciclón por 1-0. Independiente dominó y tuvo las mejores situaciones. Sin embargo, en el arco de enfrente, Sebastián Torrico fue el héroe de San Lorenzo. Independiente no había aprovechado sus chances y lo pagó caro en el arranque del segundo tiempo, cuando una gran jugada colectiva terminó en el gol de Nicolás Blandi para el 1-0 en Avellaneda.
7 de mayo. Fecha 14 Se enfrenta a River Plate en el Estadio Pedro Bidegain por el Campeonato de Primera División 2016. Fue victoria para el Ciclón por 2-1. Con ataques directos, con transiciones rápidas, aprovechando la velocidad tremenda de Ezequiel Cerutti, imparable para el sector izquierdo de la defensa de River. En el primer tiempo todo fue de San Lorenzo, fue Nicolás Blandi, tras una gran corrida por la banda izquierda de Emanuel Mas, el que encontró la llave con un derechazo seco contra el palo para poner el 1-0. El segundo llegó por derecha, donde trepó Julio Buffarini, extendió para Fernando Belluschi, que otra vez entendió qué pedía la jugada y metió la pelota al medio para la diagonal de Sebastián Blanco. El ex hombre de Lanús la dejó pasar con clase, y nuevamente Blandi apareció y definió sin dudar. El descuento de Lucas Alario, ya con el tiempo cumplido, ni siquiera alcanzó a preocupar al elenco azulgrana.
22 de mayo. Fecha 16 Se enfrenta a Banfield en el Estadio Pedro Bidegain por el Campeonato de Primera División 2016. Fue empate por 1-1. A contramano de lo que se esperaba, el duelo comenzó con un desarrollo parejo, en el cual la visita salió a jugar de igual a igual ante un rival que se jugaba la chance de terminar primero en la Zona. Los dirigidos por Julio Falcioni eran más claros en sus intenciones y enfrente tenían a un San Lorenzo que no encontraba claridad ni llegaba con peligro al área, pero al que el empate le alcanzaba para lograr su objetivo por las buenas noticias que llegaban desde San Juan. San Martín le ganaba a Godoy Cruz y le permitía a los de Pablo Guede clasificarse a la final. Pero "El Ciclón" no la pasa bien en su estadio y Banfield comenzaba a merodear con peligro el arco custodiado por Sebastián Torrico. El arquero se lució en dos ocasiones para evitar la caída de su valla, primero ante un remate de Walter Erviti, tras habilitación en el área de Silva, y luego al tapar un cabezazo de Giovanni Simeone casi sobre la línea. A los 26 minutos, "El Taladro" iba a conseguir la merecida ventaja tras capitalizar una salida en falso del elenco local. A Santiago Silva le quedó la pelota en el área y definió para decretar el 1-0 que ponía en suspenso el sueño de final de San Lorenzo. Los hinchas se impacientaban por la caída que los dejaba afuera de la definición y, con sus cánticos, empujaban al equipo hacia adelante. Fue así que, cuando se extinguía la primera etapa, Sebastián Blanco tuvo revancha: superó la débil marca de Alexis Soto y definió cruzado para marcar el empate. Los de Guede, que sufrieron la prematura baja de Néstor Ortigoza por lesión, salieron a jugar la segunda parte con mayor confianza. Banfield esperaba parado en su campo de juego e intentaba salir del asedio con alguna contra eventual. Pudo ganarlo "El Ciclón", sin embargo Claudio Pérez salvó sobre la línea y favoreció la paridad final. San Lorenzo, al que se le cortó una racha de siete victorias en fila, jugaría la final del torneo el domingo 29 de mayo ante Lanús, en el Estadio Monumental.
22 de mayo. Néstor Ortigoza sufrió un desgarro de 25 mm. en el bíceps femoral. Tendrá aproximadamente 6 semanas de recuperación, perdiéndose la oportunidad de jugar la final contra Lanús y la Copa América Centenario.[33][34]
29 de mayo. Final Juega la final del Campeonato de Primera División 2016 contra Lanús en el Estadio Antonio Vespucio Liberti. El Ciclón perdió el partido por 4-0, siendo claramente superado por su rival. Abrió la cuenta Oscar Benítez a los 18 minutos del primer tiempo. Ya en la segunda parte, Pablo Guede realizó cambios ofensivos para ir a buscar el empate, pero así también quedando expuesto ante los contraataques del equipo granate. Con una gran efectividad y buen juego logró cerrar el partido con goles de Miguel Almirón, José Sand y Lautaro Acosta. El equipo de Boedo termina perdiendo el título. Para la siguiente temporada tiene asegurada su participación en los dos torneos continentales: la Copa Sudamericana 2016 y la Copa Libertadores 2017.
Matías Lammens
Copa Libertadores
Néstor Ortigoza (2 goles)
= Partido disputado; 
= Partido suspendido; 
Cesión saliente; 
Cesión entrante / Regresa tras cesión; 
= Fichaje; 
= Traspaso; 
= Jugador Lesionado; 
= Jugador retirado.
Fabricio Pedrozo fue presentado en Crucero del Norte. Jugaría a préstamo durante 6 meses.[1]
Es presentado oficialmente Pablo Guede como director técnico en reemplazo del saliente Edgardo Bauza.[2]
Octavio Bilbao rescindió su contrato y fichó por Tiro Federal.[7]
Disputa el primer partido por la Copa Ciudad de Mar del Plata contra Independiente, en Mar del Plata, donde se impondría el empate 1-1.[13].JPG)
Néstor Ortigoza sufrió un desgarro de 25 mm. en el bíceps femoral. Tendrá aproximadamente 6 semanas de recuperación, perdiéndose la oportunidad de jugar la final contra Lanús y la Copa América Centenario.[33][34]
Dexter.com.ar
Actualizado al último partido jugado el: 29 de mayo de 2016.
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A una amarilla de ser suspendido por acumulación
Suspendido la próxima fecha
Málaga
Pedro Franco
Beşiktaş
Paulo Díaz
Cruz Azul
Talleres (RE)
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Belgrano
Rosario Central
Grêmio
Liga de Quito
Jonhatan Fuentes
11' (pen.)
)
: 1 punto. 
: 2 puntos. 
: 4 puntos.