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Diferencia entre revisiones de «Biota (taxonomía)»

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El [[Origen de la vida|origen de los seres vivos]] es todavía un tema no resuelto, los fósiles más antiguos que se conocen son los [[estromatolitos]] de [[Groenlandia]] con una antigüedad de hasta 3700 millones de años y los de [[Australia]] de hace 3500 millones de años, ambos pertenecientes a [[bacteria]]s,<ref>Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend, Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas, Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures, Nature (2016).</ref> basado en la secuencia de [[ADN]] y [[ARN]] de las bacterias, se cree que el último [[LUCA]] se desarrolló hace 4.100 millones de años, LUCA a su vez procedía de formas acelulares conocidas como [[protobionte]]s que probablemente hayan surgido y vivido durante el [[Hádico]] época en la que aparecieron las primeras [[Biomolécula|biomoléculas orgánicas]].<ref>Bell, E. A., Boehnke, P., Harrison, T. M., & Mao, W. L. (2015). [http://www.pnas.org/content/112/47/14518.full Potentially biogenic carbon preserved in a 4.1 billion-year-old zircon]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 112(47), 14518-14521.</ref> Además según [[Cavalier-Smith]] cada dominio celular ha tenido como antepasado un grupo de otro dominio: de un grupo de [[bacteria]]s evolucionaron las [[arqueas]] y posteriormente de un grupo de arqueas evolucionaron los [[eucariotas]] [[protista]]s y de estos últimos los [[animales]], [[plantas]] y [[hongos]], lo que indica que todos los dominios y reinos celulares son de hecho [[parafilético]]s con respecto a otros dominios y reinos.<ref>Thomas Cavalier-Smith (2006), [http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=1586193 Rooting the tree of life by transition analyses], Biol Direct. 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19.</ref>
El [[Origen de la vida|origen de los seres vivos]] es todavía un tema no resuelto, los fósiles más antiguos que se conocen son los [[estromatolitos]] de [[Groenlandia]] con una antigüedad de hasta 3700 millones de años y los de [[Australia]] de hace 3500 millones de años, ambos pertenecientes a [[bacteria]]s,<ref>Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend, Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas, Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures, Nature (2016).</ref> basado en la secuencia de [[ADN]] y [[ARN]] de las bacterias, se cree que el último [[LUCA]] se desarrolló hace 4.100 millones de años, LUCA a su vez procedía de formas acelulares conocidas como [[protobionte]]s que probablemente hayan surgido y vivido durante el [[Hádico]] época en la que aparecieron las primeras [[Biomolécula|biomoléculas orgánicas]].<ref>Bell, E. A., Boehnke, P., Harrison, T. M., & Mao, W. L. (2015). [http://www.pnas.org/content/112/47/14518.full Potentially biogenic carbon preserved in a 4.1 billion-year-old zircon]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 112(47), 14518-14521.</ref> Además según [[Cavalier-Smith]] cada dominio celular ha tenido como antepasado un grupo de otro dominio: de un grupo de [[bacteria]]s evolucionaron las [[arqueas]] y posteriormente de un grupo de arqueas evolucionaron los [[eucariotas]] [[protista]]s y de estos últimos los [[animales]], [[plantas]] y [[hongos]], lo que indica que todos los dominios y reinos celulares son de hecho [[parafilético]]s con respecto a otros dominios y reinos.<ref>Thomas Cavalier-Smith (2006), [http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?artid=1586193 Rooting the tree of life by transition analyses], Biol Direct. 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19.</ref>


El origen de los virus y los agentes subvirales es un tema incierto ya que no fosilizan y los restos de [[ADN]] o [[ARN]] de virus fósiles han sido encontrados especialmente en [[fósil]]es de seres vivos que fueron infectados por estos virus,<ref> https://www.nationalgeographic.com/science/phenomena/2010/11/18/i-am-virus-animal-genomes-contain-more-fossil-viruses-than-ever-expected/ </ref> basado en la secuencia de ADN y ARN de virus estiman que estos [[Agente infeccioso|agentes infecciosos]] son más antiguos que los seres vivos y que surgieron antes que el último [[LUCA]], las teorías sobre su origen son controvertidas, es posible que se hayan originado junto con los primeros protobiontes durante el [[Hádico]] época en la que aparecieron las primeras biomoléculas orgánicas, aunque también algunos parecen haberse desarrollado a partir de organismos celulares que hayan perdido dicha característica.<ref>Nasir, A., & Caetano-Anollés, G. (2015). [http://advances.sciencemag.org/content/1/8/e1500527.full A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution]. Science advances, 1(8), e1500527.</ref> Mientras que el origen de los [[nanobio]]s y [[nanobacteria]]s es desconocido y pudieron haber surgido hace poco.
El origen de los virus y los agentes subvirales es un tema incierto ya que no fosilizan y los restos de [[ADN]] o [[ARN]] de virus fósiles han sido encontrados especialmente en los [[genoma]]s de seres vivos que fueron infectados por estos virus,<ref> https://www.nationalgeographic.com/science/phenomena/2010/11/18/i-am-virus-animal-genomes-contain-more-fossil-viruses-than-ever-expected/ </ref><ref>{{cita publicación|apellido=Weiss|nombre=RA|título=The discovery of endogenous retroviruses.|publicación=Retrovirology|fecha=2006 Oct 3|volumen=3|páginas=67|pmid=17018135|doi=10.1186/1742-4690-3-67|pmc=1617120}}</ref> basado en la secuencia de ADN y ARN de virus estiman que estos [[Agente infeccioso|agentes infecciosos]] son más antiguos que los seres vivos y que surgieron antes que el último [[LUCA]], las teorías sobre su origen son controvertidas, es posible que se hayan originado junto con los primeros protobiontes durante el [[Hádico]] época en la que aparecieron las primeras biomoléculas orgánicas, aunque también algunos parecen haberse desarrollado a partir de organismos celulares que hayan perdido dicha característica.<ref>Nasir, A., & Caetano-Anollés, G. (2015). [http://advances.sciencemag.org/content/1/8/e1500527.full A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution]. Science advances, 1(8), e1500527.</ref> Mientras que el origen de los [[nanobio]]s y [[nanobacteria]]s es desconocido y pudieron haber surgido hace poco.


Para el origen de los seres vivos universales y virus a partir de compuestos inorgánicos y la formación posterior de sus estructuras se han propuesto numerosas hipótesis, teorías y experimentos como la [[hipótesis del mundo de ARN]], [[hipótesis del mundo de HAP]], [[teoría del mundo de hierro-sulfuro]] y el [[experimento de Miller y Urey]]. <ref>Robertson, M. P., & Joyce, G. F. (2012). [http://cshperspectives.cshlp.org/content/4/5/a003608.long The origins of the RNA world]. Cold Spring Harbor perspectives in biology, 4(5), a003608.</ref>
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A continuación se muestra la edad geológica de cada grupo tomando en cuenta los fósiles más antiguos y la estimación de su aparición según los [[Reloj molecular|relojes moleculares]]:
A continuación se muestra la edad geológica de cada grupo tomando en cuenta los fósiles más antiguos y la estimación de su aparición según los [[Reloj molecular|relojes moleculares]]:

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Los relojes moleculares estiman la aparición de [[LUCA]] entre unos 4100-4200 millones de años.
Los relojes moleculares estiman la aparición de [[LUCA]] entre unos 4100-4200 millones de años.



Revisión del 17:10 6 abr 2020

 
Biota
Rango temporal: 4400–0 Ma HádicoReciente[1]


Taxonomía
(sin rango) Biota
Superdominios, dominios, reinos y otras divisiones

En taxonomía, el nombre Biota o imperio Biota,[3]​ es usado a veces para referirse al grupo taxonómico superior al superdominio que reúne a todos los organismos relacionados con la vida. Todos los representantes de este clado están compuesto por biomoléculas orgánicas y se relacionan con los otros organismos ya sea de manera perjudicial o beneficiosa. Se contraponen a las formas inorgánicas (Mineralia). No debe confundirse con el término "biota" usado en Ecología, donde indica el conjunto de especies presentes en una región geográfica.

Biota deriva del griego «βίος» bíos = vida, y son sus sinónimos Vitae, Eobionti, Terrabiota[4]​ y Bionta.[5]

El concepto incluye tanto a los organismos celulares o seres vivos universales como a los organismos no celulares (como los virus). No hay un acuerdo sobre si se debe denominar "ser vivo" únicamente a los celulares o a todas las entidades biológicas.

En todo caso, se usa a veces la división en dos grandes superdominios o linajes radicalmente diferentes:[4]

Recientemente se han propuesto nuevos linajes de vida a Nanobio y Nanobacteria que están compuestos de nanoorganismos aún por definir, los estudios han afirmado que su estructura y morfología es similar a la de otros organismos celulares procariotas y que poseen algunas características que definen la vida como la composición orgánica, un tipo de membrana plasmática, reproducción, crecimiento, metabolismo o intercambio de energía, homeostasis, respuestas al cambio ambiental, etc.

Biota no es necesariamente un clado ni es sinónimo de ser vivo o vida, ya que incluye a los acelulares y otras formas donde no hay consenso de si son realmente seres vivos.

Origen

Árbol de la vida, nótese que se excluye a los Acytota.
Posible evolución de Archaea y Eukarya a partir de bacterias.
Filogenia eucariota.
Filogenia viral.

El origen de los seres vivos es todavía un tema no resuelto, los fósiles más antiguos que se conocen son los estromatolitos de Groenlandia con una antigüedad de hasta 3700 millones de años y los de Australia de hace 3500 millones de años, ambos pertenecientes a bacterias,[6]​ basado en la secuencia de ADN y ARN de las bacterias, se cree que el último LUCA se desarrolló hace 4.100 millones de años, LUCA a su vez procedía de formas acelulares conocidas como protobiontes que probablemente hayan surgido y vivido durante el Hádico época en la que aparecieron las primeras biomoléculas orgánicas.[7]​ Además según Cavalier-Smith cada dominio celular ha tenido como antepasado un grupo de otro dominio: de un grupo de bacterias evolucionaron las arqueas y posteriormente de un grupo de arqueas evolucionaron los eucariotas protistas y de estos últimos los animales, plantas y hongos, lo que indica que todos los dominios y reinos celulares son de hecho parafiléticos con respecto a otros dominios y reinos.[8]

El origen de los virus y los agentes subvirales es un tema incierto ya que no fosilizan y los restos de ADN o ARN de virus fósiles han sido encontrados especialmente en los genomas de seres vivos que fueron infectados por estos virus,[9][10]​ basado en la secuencia de ADN y ARN de virus estiman que estos agentes infecciosos son más antiguos que los seres vivos y que surgieron antes que el último LUCA, las teorías sobre su origen son controvertidas, es posible que se hayan originado junto con los primeros protobiontes durante el Hádico época en la que aparecieron las primeras biomoléculas orgánicas, aunque también algunos parecen haberse desarrollado a partir de organismos celulares que hayan perdido dicha característica.[11]​ Mientras que el origen de los nanobios y nanobacterias es desconocido y pudieron haber surgido hace poco.

Para el origen de los seres vivos universales y virus a partir de compuestos inorgánicos y la formación posterior de sus estructuras se han propuesto numerosas hipótesis, teorías y experimentos como la hipótesis del mundo de ARN, hipótesis del mundo de HAP, teoría del mundo de hierro-sulfuro y el experimento de Miller y Urey. [12]

Composición y funciones compartidas

Proteínas.

Virus y agentes subvirales

Ácidos nucleicos.

Tanto los seres vivos universales como los acelulares están compuestos por:

En el caso de los seres vivos universales habría que añadir la posesión de células.

Las funciones de la vida que comparten los virus con los organismos celulares son:[13][14]

  1. Evolución: evolucionan por selección natural ya que desarrollan estrategias que le permiten infectar un organismo, un ejemplo es el virus de la gripe que se hace resistente a las vacunas.
  2. Relación: responden a estímulos, por su modo de vida parasitario similar al de otros organismos y ser su estrategia de supervivencia.
  3. Homeostasis: tienen cierta sensibilidad a temperaturas elevadas o altas lo que puede describirse como homeostasis, pero otros dicen que los virus no son homeostáticos.

Las siguientes funciones, los virus las cumplen pero deben realizarlas dentro una célula, no se consideran propias, por ello se les cuestiona que cumplan estas funciones:

  1. Reproducción: se reproducen creando varias copias de sí mismo sólo cuando están dentro la célula.
  2. Metabolismo: Pueden intercambiar energía y codificar proteínas, lípidos solo cuando ingresan a la célula.

Sin embargo el hecho de no compartir estas funciones se cuestiona ya que ciertas bacterias son incapaces de realizar estas dos funciones. Por ejemplo bacterias como Rickettsia y Chlamydia sólo pueden reproducirse y producir su metabolismo dentro de células, a pesar de no cumplir con ello son considerados seres vivos. Lo mismo sucede al observar la etapa de endospora en algunas bacterias donde presentan un metabolismo inactivo y se pierde el ritmo homeostático, a pesar de ello también se consideran seres vivos.

Las únicas funciones que no cumplen los virus son el desarrollo, la nutrición y llevar a cabo la organización celular.

El hecho de cumplir ciertas funciones de la vida y otras no hace que se los describa como entidades semivivientes o formas transicionales entre células y moléculas orgánicas.

El descubrimiento de los virus que son fundamentalmente diferentes de los organismos celulares (al ser entidades acelulares) tiene implicaciones en el origen de la vida ya que respalda la hipótesis de que la vida pudo haber comenzado con moléculas orgánicas de autoensamblaje. Por ello los hipotéticos protobiontes fueron entidades acelulares similares a virus que dieron origen a la primera célula, a pesar de ello tampoco están considerados seres vivos.[15]

Nanobios y nanobacterias

Los nanobios y nanobacterias son estructuras microscópicas, probablemente nanoorganismos que se han propuesto como formas de vida debido a que su morfología es similar a la de otros organismos. Por ejemplo las nanobacterias se asemejan a bacterias pequeñas, mientras que los nanobios tienen una apariencia similar a las actinobacterias y algunos tipos de hongos. Estudios científicos afirman haber detectado posible ADN y ARN de nanobios y nanobacterias, así como otras biomoléculas y un tipo de membrana plasmática que protege el material genético, esto indicaría que son un tipo de células desconocidas o posibles bacterias pequeñas. En los cultivos científicos las colonias de nanobios y nanobacterias crecieron a temperatura ambiente, teniendo una reproducción autónoma a diferencia de los virus.[16][17][18][19]​ Por tanto cumplirían:

  • Composición orgánica: poseen material genético y otras posibles biomoléculas.
  • Organización celular: Se ha descubierto una membrana plasmática que protege el material genético de la estructura de los nanobios y nanobacterias, pero también una posible pared celular en las nanobacterias.
  • Reproducción: Se reproducen asexualmente, sin ayuda externa.
  • Metabolismo: Intercambian energía con el ambiente y posiblemente al estar compuesto por una membrana plasmática puedan codificar y sintetizar proteínas, lípidos y glúcidos igual que otros microorganismos, sin ayuda externa.
  • Desarrollo: las colonias crecieron y los diferentes nanobios y nanobacterias mostraron diferentes tamaños de nanómetros.
  • Homeostasis: crecieron a temperatura ambiente, lo que implica que pueden tener sensibilidad a ciertas temperaturas.
  • Relación: probablemente respondan a los cambios ambientales y otros estímulos.

Aun así no sea confirmado si evolucionan o de que modo se nutren, pero lo que si se sabe es que son posibles organismos celulares o seres vivos. A pesar de ello a menudo no se consideran seres vivos porque son demasiados pequeños para almacenar un genoma estable o porque están en contacto con compuestos inorgánicos. Sin embargo el tamaño no se ha definido como un atributo para definir la vida por tanto es controvesial. Las nanobacterias se propusieron clasificarse como un género Nanobacterium dentro el filo Proteobacteria, pero se ha sugerido que su relación con ese filo se deba a una posible transferencia horizontal de genes.[17]​ Mientras que la relación de los nanobios es incierta y podrían representar un nuevo dominio, si es que realmente existen.

Filogenia

Existen varias teorías que proponen relacionar a los seres acelulares con los celulares. La hipótesis del mundo de ARN por ejemplo postula que las moléculas de ARN fueron las entidades biológicas precursoras de la vida. Otra teoría relaciona a los virus gigantes de ADN con las primeras células[20]

Biota (concepto amplio)

Virus ARN (Riboviria) ?

Virus ADN (Deoxyviria) ?

Girus (NCLDV) ?

Protobionte (†) ?

Cytota

Bacteria

ArchaeaEukaryota

Edad geológica de cada grupo

A continuación se muestra la edad geológica de cada grupo tomando en cuenta los fósiles más antiguos y la estimación de su aparición según los relojes moleculares:

Grupo Fósil más antiguo Período Reloj molecular Período
Animalia 665 Ma[21] Criogénico 650–850 Ma[22] CriogénicoTónico
Fungi 1000 Ma[23] Mesoproterozoico 1060–1100 Ma[24] Mesoproterozoico
Plantae 1200 Ma[25] Mesoproterozoico 1400–1757 Ma[24] MesoproterozoicoPaleoproterozoico
Protista 1630 Ma[26] Paleoproterozoico 1866–2000 Ma[27] Paleoproterozoico
Archaea 3500 Ma[28] Arcaico 3500–3800 Ma[27] Arcaico
Bacteria 3700 Ma[29] Arcaico 3800–4100 Ma[27] ArcaicoHádico
Acytota (?) 300 Ma[30] Carbonífero 4000–4400 Ma[1][31] Hádico

Los relojes moleculares estiman la aparición de LUCA entre unos 4100-4200 millones de años.

Referencias

  1. a b (en inglés) Steenhuysen, Julie (20 de mayo de 2009). «Study turns back clock on origins of life on Earth». Reuters. Consultado el 27 de septiembre de 2014. 
  2. Gorbalenya, Alexander E.; Krupovic, Mart; Siddell, Stuart; Varsani, Arvind; Kuhn, Jens H. (15 de octubre de 2018). «Riboviria: establishing a single taxon that comprises RNA viruses at the basal rank of virus taxonomy» (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (en inglés). Consultado el 9 de marzo de 2019. 
  3. Bernard Pelletier 2015, Empire Biota: Taxonomy and Evolution. Lulu.com, 2016 ISBN 1329799984, 9781329799981
  4. a b Vitae BioLib
  5. WALTON, Lee Barker: "Studies Concerning Organisms Occurring in Water Supplies With Particular Reference to Those Founded in Ohio" in Ohio Biological Survey Bulletin, 24 (1930), pp. 1–86.
  6. Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend, Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas, Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures, Nature (2016).
  7. Bell, E. A., Boehnke, P., Harrison, T. M., & Mao, W. L. (2015). Potentially biogenic carbon preserved in a 4.1 billion-year-old zircon. Proceedings of the National Academy of Sciences, 112(47), 14518-14521.
  8. Thomas Cavalier-Smith (2006), Rooting the tree of life by transition analyses, Biol Direct. 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19.
  9. https://www.nationalgeographic.com/science/phenomena/2010/11/18/i-am-virus-animal-genomes-contain-more-fossil-viruses-than-ever-expected/
  10. Weiss, RA (2006 Oct 3). «The discovery of endogenous retroviruses.». Retrovirology 3: 67. PMC 1617120. PMID 17018135. doi:10.1186/1742-4690-3-67. 
  11. Nasir, A., & Caetano-Anollés, G. (2015). A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution. Science advances, 1(8), e1500527.
  12. Robertson, M. P., & Joyce, G. F. (2012). The origins of the RNA world. Cold Spring Harbor perspectives in biology, 4(5), a003608.
  13. Kango, Naveen (2013). Textbook of Microbiology. I. K. International. p. 128. ISBN 9380026447. 
  14. Dupre, John (2012). Processes of Life: Essays in the Philosophy of Biology. OUP Oxford, 2012. p. 214. ISBN 0199691983. 
  15. Koonin, E.V.; Senkevich, T.G.; Dolja, V.V. (2006). «The ancient Virus World and evolution of cells». Biology Direct 1: 29. PMC 1594570. PMID 16984643. doi:10.1186/1745-6150-1-29. 
  16. Artículo de revisión en PNAS
  17. a b Kajander O. E. & Ciftcioglu, C. 1998. Nanobacteria: an alternative mechanism for pathogenic intra-and extracellular calcification and stone formation. Proceedings of the National Academy of Science, 95: 8274–8279.
  18. Ransom, Barbara Leigh; Wainwright, Sonya. Recent Advances and Issues in the Geological Sciences. Greenwood Publishing Group, 2002, p. 56. ISBN 1573563560.
  19. Diminutas formas de vida, El País
  20. Giant viruses coexisted with the cellular ancestors and represent a distinct supergroup along with superkingdoms Archaea, Bacteria and Eukarya BMC
  21. Maloof, Adam C.; Rose, Catherine V.; Beach, Robert; Samuels, Bradley M.; Calmet, Claire C.; Erwin, Douglas H.; Poirier, Gerald R.; Yao, Nan et al. (17 de agosto de 2010). «Possible animal-body fossils in pre-Marinoan limestones from South Australia». Nature Geoscience 3 (9): 653-659. Bibcode:2010NatGe...3..653M. doi:10.1038/ngeo934. 
  22. The origin of animals: Can molecular clocks and the fossil record be reconciled?
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  26. Butterfield, N. J. (2015). Early evolution of the Eukaryota. Palaeontology, 58(1), 5-17.
  27. a b c Error en la cita: Etiqueta <ref> no válida; no se ha definido el contenido de las referencias llamadas boenigk2015
  28. Error en la cita: Etiqueta <ref> no válida; no se ha definido el contenido de las referencias llamadas altermann
  29. Error en la cita: Etiqueta <ref> no válida; no se ha definido el contenido de las referencias llamadas nutman2016
  30. https://www.elconfidencial.com/tecnologia/2014-10-19/virus_264212/
  31. Holmes, Bob (2012) "First Glimpse at the birth of DNA" (New Scientist April 12, 2012)

Enlaces externos

  • Biota (Systema Naturae 2000, en inglés)
  • Vitae (BioLib, en inglés)
  • Biota (Taxonomicon, en inglés)