Orthornavirae

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Orthornavirae
Taxonomía
Dominio: Riboviria
Reino: Orthornavirae
Filos

Orthornavirae es un reino viral introducido por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus para la clasificación de los virus que incluye la mayoría de los virus de ARN exceptuando la familia Polymycoviridae y los virus satélite de ARN los cuales todavía no se han incluido en analísis filogenéticos. Se divide en cinco filos Lenarviricota, Kitrinoviricota, Pisuviricota, Negarnaviricota y Duplornaviricota. Todos estos virus contienen una ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp) lo que supone que son un taxón monofilético.[1]​ Sin embargo otros estudios han demostrado que los virus de ARN son parafiléticos.[2]

Los virus de ARN se originaron durante el mundo de ARN o en protobiontes antes del último antepasado común universal.[3]​ Los virus de ARN tienen una gran importancia evolutiva ya que se ha sugerido que junto con los viroides son reliquias del antiguo mundo de ARN y que también pudieron preceder a los retroelementos de la vida celular.[4][5]​ Los virus de ARN probablemente llegaron a los eucariotas por medio de las arqueas y las proteobacterias hace más de 2300 millones de años, en el momento que sucedió la endosimbiosis seriada que involucró a una arquea y una proteobacteria las cuales darían origen a los eucariotas. Algunos de estos virus pasaron exitosamente y tuvieron una gran diversificación.[3][6]

Taxonomía

La taxonomía propuesta por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus es la siguiente:[7]

Filogenia

Los análisis de la ARN polimerasa y los genes que codifican proteínas para la cápside han dado la siguiente filogenia entre los virus de Orthornavirae:[9]

Orthornavirae
Lenarviricota

Leviviridae

Mitoviridae

Botourmiaviridae

Narnaviridae

Pisuviricota
Stelpaviricetes

Astroviridae

Potyviridae

Birnaviridae

Permutotetraviridae

Duplopiviricetes

Picobirnaviridae

Partitiviridae

Amalgaviridae

Hypoviridae

Pisoniviricetes
Picornavirales

Caliciviridae

Picornaviridae

Polycipiviridae

Secoviridae

Iflaviridae

Dicistroviridae

Marnaviridae

Soliniviridae

Sobelivirales

Alvernaviridae

Barnaviridae

Solemoviridae

Nidovirales

Mononiviridae

Abyssoviridae

Nanidovirinae

Nanidovirinae

Nanghoshaviridae

Ronidovirineae

Euroniviridae

Roniviridae

Mesnidovirineae

Medioniviridae

Mesoniviridae

Coronaviridae

Tobaniviridae

Arnidovirineae

Arteriviridae

Gresnaviridae

Cremegaviridae

Olifoviridae

Kitrinoviricota

Flaviviridae

Tolivirales

Carmotetraviridae

Tombusviridae

Luteoviridae

Nodamuvirales

Nodaviridae

Sinhaliviridae

Alsuviricetes
Tymovirales

Tymoviridae

Alphaflexiviridae

Betaflexiviridae

Deltaflexiviridae

Gamaflexiviridae

Martellivirales

Endornaviridae

Togaviridae

Bromoviridae

Closteroviridae

Virgaviridae

Kitaviridae

Mayoviridae

Hepelivirales

Hepeviridae

Matonaviridae

Benyviridae

Alphatetraviridae

Cystoviridae

Ghabrivirales

Totiviridae

Quadriviridae

Chrysoviridae

Megabirnaviridae

Reoviridae

Negarnaviricota
Polyploviricotina
Articulavirales

Amnoonviridae

Orthomyxoviridae

Bunyavirales

Phasmaviridae

Feriviridae

Jonviridae

Hantaviridae

Cruliviridae

Tospoviridae

Peribunyaviridae

Fimoviridae

Phenuiviridae

Leisbunyviridae

Nairoviridae

Wuepediviridae

Mypoviridae

Arenaviridae

Haploviricotina

Qinviridae

Aspiraviridae

Yueviridae

Monjiviricetes

Chuviridae

Mononegavirales

Rhabdoviridae

Artoviridae

Myomonaviridae

Lispiviridae

Nyamiviridae

Bornaviridae

Pneumoviridae

Xinmoviridae

Filoviridae

Sunviridae

Paramyxoviridae

Referencias

  1. Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18 de octubre de 2019). «Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for realm Riboviria» (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (en inglés). Consultado el 15 de mayo de 2020. 
  2. Arshan, Nasir; Caetano-Anollés, Gustavo (25 de septiembre de 2015). «A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution». Science Advances 1 (8): e1500527. Bibcode:2015SciA....1E0527N. PMC 4643759. PMID 26601271. doi:10.1126/sciadv.1500527. 
  3. a b Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin (2020). The LUCA and its complex virome. Nature.
  4. Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). A virocentric perspective on the evolution of life. Science Direct.
  5. Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). Virus World as an Evolutionary Network of Viruses and Capsidless Selfish Elements. Microbiology and Molecular Biology Reviews.
  6. Benjamin Bolduc, Daniel P Shaughnessy, Yuri I Wolf, Eugene V Koonin, Francisco F Roberto, Mark Young (2012). Identification of novel positive-strand RNA viruses by metagenomic analysis of archaea-dominated Yellowstone hot springs. National Library of Medicine.
  7. «Virus Taxonomy: 2018 Release» (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (en inglés). October 2018. Consultado el 13 octobre 2019. 
  8. a b Yuri I. Wolf, Sukrit Silas, Yongjie Wang, Shuang Wu, Michael Bocek, Darius Kazlauskas, Mart Krupovic, Andrew Fire, Valerian V. Dolja & Eugene V. Koonin (2020). Doubling of the known set of RNA viruses by metagenomic analysis of an aquatic virome. Nature.
  9. Yuri I. Wolf, Sukrit Silas, Yongjie Wang, Shuang Wu, Michael Bocek, Darius Kazlauskas, Mart Krupovic, Andrew Fire, Valerian V. Dolja & Eugene V. Koonin (2020). Doubling of the known set of RNA viruses by metagenomic analysis of an aquatic virome. Nature.