Orthornavirae
Orthornavirae | ||
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Taxonomía | ||
Dominio: | Riboviria | |
Reino: | Orthornavirae | |
Filos | ||
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Orthornavirae es un reino viral introducido por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus para la clasificación de los virus que incluye la mayoría de los virus de ARN exceptuando la familia Polymycoviridae y los virus satélite de ARN los cuales todavía no se han incluido en analísis filogenéticos. Se divide en cinco filos Lenarviricota, Kitrinoviricota, Pisuviricota, Negarnaviricota y Duplornaviricota. Todos estos virus contienen una ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp) lo que supone que son un taxón monofilético.[1] Sin embargo otros estudios han demostrado que los virus de ARN son parafiléticos.[2]
Los virus de ARN se originaron durante el mundo de ARN o en protobiontes antes del último antepasado común universal.[3] Los virus de ARN tienen una gran importancia evolutiva ya que se ha sugerido que junto con los viroides son reliquias del antiguo mundo de ARN y que también pudieron preceder a los retroelementos de la vida celular.[4][5] Los virus de ARN probablemente llegaron a los eucariotas por medio de las arqueas y las proteobacterias hace más de 2300 millones de años, en el momento que sucedió la endosimbiosis seriada que involucró a una arquea y una proteobacteria las cuales darían origen a los eucariotas. Algunos de estos virus pasaron exitosamente y tuvieron una gran diversificación.[3][6]
Taxonomía
La taxonomía propuesta por el Comité Internacional de Taxonomía de Virus es la siguiente:[7]
- Reino Orthornavirae
- Filo Duplornaviricota
- Orden Ghabrivirales
- Familia Chrysoviridae
- Familia Megabirnaviridae
- Familia Quadriviridae
- Familia Totiviridae
- Familia Cystoviridae
- Familia Reoviridae
- Orden Ghabrivirales
- Filo Negarnaviricota
- Subfilo Haploviricotina
- Familia Qinviridae
- Familia Aspiriviridae
- Familia Yueviridae
- Clase Monjiviricetes
- Familia Chuviridae
- Orden Mononegavirales
- Familia Artoviridae
- Familia Bornaviridae
- Familia Filoviridae
- Familia Lispiviridae
- Familia Mymonaviridae
- Familia Nyamiviridae
- Familia Paramyxoviridae
- Familia Pneumoviridae
- Familia Rhabdoviridae
- Familia Sunviridae
- Familia Xinmoviridae
- Subfilo Polyploviricotina
- Clase Ellioviricetes
- Orden Bunyavirales
- Familia Arenaviridae
- Familia Cruliviridae
- Familia Fimoviridae
- Familia Hantaviridae
- Familia Leishbunyviridae
- Familia Mypoviridae
- Familia Nairoviridae
- Familia Peribunyaviridae
- Familia Phasmaviridae
- Familia Phenuiviridae
- Familia Tospoviridae
- Familia Wupedeviridae
- Orden Bunyavirales
- Clase Insthoviricetes
- Orden Articulavirales
- Familia Amnoonviridae
- Familia Orthomyxoviridae
- Orden Articulavirales
- Clase Ellioviricetes
- Subfilo Haploviricotina
- Filo Lenarviricota
- Familia Botourmiaviridae
- Familia Leviviridae
- Familia Narnaviridae
- Familia Mitoviridae
- Filo Kitrinoviricota
- Familia Flaviviridae
- Orden Nodamuvirales
- Familia Nodaviridae
- Familia Sinhaliviridae
- Orden Tolivirales
- Familia Carmotetraviridae
- Familia Tombusviridae
- Familia Luteoviridae
- Clase Alsuviricetes
- Orden Hepelivirales
- Familia Alphatetraviridae
- Familia Benyviridae
- Familia Hepeviridae
- Familia Matonaviridae
- Orden Martellivirales
- Familia Bromoviridae
- Familia Closteroviridae
- Familia Endornaviridae
- Familia Kitaviridae
- Familia Mayoraviridae
- Familia Togaviridae
- Familia Virgaviridae
- Orden Tymovirales
- Familia Alphaflexiviridae
- Familia Betaflexiviridae
- Familia Deltaflexiviridae
- Familia Gammaflexiviridae
- Familia Tymoviridae
- Orden Hepelivirales
- Filo Pisuviricota
- Clase Stelpaviricetes
- Familia Astroviridae
- Familia Potyviridae
- Clase Pisoniviricetes
- Orden Nidovirales
- Familia Coronaviridae
- Familia Mononiviridae
- Familia Tobaniviridae
- Suborden Adnidovirinae
- Familia Abyssoviridae
- Familia Arteriviridae
- Familia Cremegaviridae
- Familia Gresnaviridae
- Familia Olfoviridae
- Suborden Nanivirinae
- Familia Nanghosviridae
- Familia Nanhypoviridae
- Suborden Mesnidovirinae
- Familia Medioniviridae
- Familia Mesoniviridae
- Suborden Runidovirinae
- Familia Euroniviridae
- Familia Roniviridae
- Orden Picornavirales
- Familia Caliciviridae
- Familia Dicistroviridae
- Familia Iflaviridae
- Familia Marnaviridae
- Familia Picornaviridae
- Familia Polycipiviridae
- Familia Secoviridae
- Familia Solinviviridae
- Orden Sobelivirales
- Familia Alvernaviridae
- Familia Barnaviridae
- Familia Solemoviridae
- Orden Nidovirales
- Clase Duplopiviricetes
- Orden Durnavirales
- Familia Amalgaviridae
- Familia Hypoviridae
- Familia Partitiviridae
- Familia Picobirnaviridae
- Orden Durnavirales
- Familia Birnaviridae[8]
- Familia Permutotetraviridae[8]
- Clase Stelpaviricetes
- Filo Duplornaviricota
Filogenia
Los análisis de la ARN polimerasa y los genes que codifican proteínas para la cápside han dado la siguiente filogenia entre los virus de Orthornavirae:[9]
Referencias
- ↑ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH (18 de octubre de 2019). «Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for realm Riboviria» (docx). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (en inglés). Consultado el 15 de mayo de 2020.
- ↑ Arshan, Nasir; Caetano-Anollés, Gustavo (25 de septiembre de 2015). «A phylogenomic data-driven exploration of viral origins and evolution». Science Advances 1 (8): e1500527. Bibcode:2015SciA....1E0527N. PMC 4643759. PMID 26601271. doi:10.1126/sciadv.1500527.
- ↑ a b Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin (2020). The LUCA and its complex virome. Nature.
- ↑ Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). A virocentric perspective on the evolution of life. Science Direct.
- ↑ Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). Virus World as an Evolutionary Network of Viruses and Capsidless Selfish Elements. Microbiology and Molecular Biology Reviews.
- ↑ Benjamin Bolduc, Daniel P Shaughnessy, Yuri I Wolf, Eugene V Koonin, Francisco F Roberto, Mark Young (2012). Identification of novel positive-strand RNA viruses by metagenomic analysis of archaea-dominated Yellowstone hot springs. National Library of Medicine.
- ↑ «Virus Taxonomy: 2018 Release» (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (en inglés). October 2018. Consultado el 13 octobre 2019.
- ↑ Yuri I. Wolf, Sukrit Silas, Yongjie Wang, Shuang Wu, Michael Bocek, Darius Kazlauskas, Mart Krupovic, Andrew Fire, Valerian V. Dolja & Eugene V. Koonin (2020). Doubling of the known set of RNA viruses by metagenomic analysis of an aquatic virome. Nature.