Anexo:Linajes y subvariantes del SARS-CoV-2
Variantes y subvariantes del SARS-CoV-2 | ||
---|---|---|
Parte de los linajes del SARS-CoV-2 | ||
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Agente patógeno | ||
Patógeno | SARS-CoV-2 | |
Tipo de patógeno | Virus | |
Enfermedad causada | COVID-19 | |
Datos históricos | ||
Inicio | Noviembre de 2019 | |
Lugar de inicio |
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Nivel del contagio | Brote epidémico | |
Lugares afectados | 260 | |
A continuación se muestra un sumario de variantes que son monitoreadas por la OMS en tiempo real, y también el historial de variantes con importancia anteriormente en circulación[1].
Variantes de gran consecuencia (VHC) circulantes o anteriores[editar]
Hasta el momento no han existido variantes que hayan alcanzado está categoría[2].
Variantes preocupantes (VOC) circulantes o anteriores[editar]
Variante preocupante (o VOC, por sus siglas en inglés) para el SARS-CoV-2 (que causa el COVID-19) es una categoría utilizada para las variantes del virus donde las mutaciones en su receptor RBD (Receptor Binding Domain) de la proteína de la espícula aumentan sustancialmente la afinidad de unión en el complejo RBD-hACE2, y que se relacionan con una rápida propagación de los contagios entre humanos[3]. Actualmente no hay variantes consideradas de preocupación por la OMS[4].
Descubrimiento | Categoría máxima alcanzada | Denominaciones | Linaje | Cambios | Notas y referencias | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Posible origen | Primera detección | Muestra más temprana documentada | Denominación de la OMS | Denominaciones científicas | Denominaciones populares | Mutaciones notables | Transmisibilidad | Severidad | Inmunogenicidad | Antigenicidad | |||
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Octubre de 2020 | VOC | Alfa α | B.1.1.7 / 20B / 501Y.V1 / GR | Británica | B.1 | N501Y 69–70del P681H | ![]() |
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[5] |
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Diciembre de 2020 | VOC | Beta ϐ | B.1.351 / 501.V2 / 20C / 501Y.V2 / GH | Sudafricana | B.1 | N501Y K417N E484K |
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Sin evidencia contundente | ![]() |
Evidencia de ser menos detectable | [5] |
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Enero 2021 | VOC | Gamma γ | B.1.1.248 | Brasileña / Amazónica | B.1 | N501Y E484K |
Evidencia de una mayor transmisibilidad | ![]() |
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Evidencia de ser menos detectable | [5] |
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Octubre de 2020 | VOC | Delta δ | B.1.617.2 | India | B.1.617 | E484Q L425R |
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[5] |
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Mayo de 2021 | VOC | Delta plus δ+ | AY | Plus | B.1.617.2 | E484Q L425R |
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Sin evidencia contundente | ![]() |
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[6] |
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Noviembre de 2021 | VOC | Ómicron ο | B.1.1.529 | Botsuanesa | B.1 | R346K, L452X, F486V | ![]() |
Sin evidencia contudente | ![]() |
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[7] |
Linajes ómicron[editar]
Descubrimiento | Categoría máxima alcanzada | Denominaciones | Linaje | Cambios | Notas y referencias | |||||||
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Posible origen | Primera detección | Muestra más temprana | Denominaciones científicas | Denominaciones populares | Mutaciones notables | Transmisibilidad | Severidad | Inmunogenicidad | Antigenicidad | |||
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Diciembre de 2021 | VOC | BA.2 / B.1.1.529.2 | Sigilosa / Furtiva | B.1.1.529 | T19I, L24del, P25del, P26del, A27S, V2113G, T376A, R3408S | ![]() |
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[8] |
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Diciembre de 2021 | VOC | BA.3 / B.1.1.529.3 | B.1.1.529 | R3408S | Sin evidencia contudente de la reducción de la transmisibilidad | ![]() |
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[8] | |
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Enero de 2022 | VOC | BA.4 / B.1.1.529.4 | Variantes bestia | B.1.1.529 | L452R, F486V | ![]() |
Sin evidencia contudente | ![]() |
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[8] |
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Febrero de 2022 | VOC | BA.5 / B.1.1.529.5 | B.1.1.529 | L452R, F486V | ![]() |
Sin evidencia contudente | ![]() |
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[8] |
Subvariantes ómicron[editar]
El profesor de biología canadiense Ryan Gregory, de la Universidad de Guelph, es quien ha asignado denominaciones memorables mitológicas a las nuevas subvariantes de ómicron, con la intención de informar al público de una manera más comprensible. Lo anterior ha funcionado, puesto que ha tenido difusión en los medios masivos de comunicación, además de Gregory otros han contribuido a los sobrenombres [9] [10] [11] [12] .
Descubrimiento | Categoría máxima alcanzada | Denominaciones | Linaje | Cambios | Notas y referencias | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Posible origen | Primera detección | Muestra más temprana | Denominaciones científicas | Denominaciones populares | Mutaciones notables | Transmisibilidad | Severidad | Inmunogenicidad | Antigenicidad | |||
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Diciembre de 2021 | VOC | BA.1.1 | BA.1 | R346K | ![]() |
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Posiblemente más propenso a mutaciones y menos detectable | [8] | |
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Enero de 2022 | VOC | BA.2.10.1.1 / BJ.1 | Argos | BA.2 | S:V83A, H146Q, Q183E, V213E, G339H | Sin evidencia | Sin evidencia | Sin evidencia | Sin evidencia | [13] [14] |
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Junio 2022 | VOC | BA.2.75 | Centauro | BA.2 | G446S, R493Q | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[15] [16] |
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Junio 2022 | VOC | BA.2.75.2 | Quirón | BA.2.75 | R493Q, G446S, W152R, K147E | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[17] [18] |
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Septiembre 2022 | VOC | BA.2.75.2.3.1 / CA.3.1 | BA.2.75.3.1 | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[19] [20] | ||
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Octubre 2022 | VOC | BA.2.75.3.1.1.1 / BM.1.1.1 | Mimas | BA.2.75.3.1 | S:L5F, ORF1b:T1050I, ORF1a:S167G | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[21] [22] |
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Noviembre 2022 | VOC | BA.2.75.3.4.1.1.1.1 / CH.1.1 | Ortro | BA.2.75 | P681R | ![]() |
Posiblemente de mayor gravedad | ![]() |
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[23] [24] [25] |
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Noviembre 2022 | VOC | BA.2.75.4.2.1 / BR.2.1 | Cerastes | BA.2.75 | ORF8:S67F | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[26] [27] |
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Septiembre 2022 | VOC | BA.2.75.5.1 / BN.1 | Hidra | BA.2.75 | S:490S | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[28] [29] [30] |
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Junio 2022 | VOC | BA.2.75.6 | Dictis | BA.2.75 | F486S | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[31] |
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Agosto 2022 | VOC | XBB | Grifo / Pesadilla | BA.2 | R346T | ![]() |
Sin evidencia | ![]() |
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[32] [33] |
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Agosto 2022 | VOC | XBB.1 | Hipogrifo | XBB | R346T | ![]() |
Sin evidencia | ![]() |
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[34] [35] |
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Noviembre 2022 | VOC | XBB.1.5 | Kraken | XBB.1 | F486P | ![]() |
Sin evidencia | ![]() |
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[36] [37] |
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Enero 2023 | VOC | XBB.1.9.1 / FL | Hiperión | XBB.1 | ORF1b:V1092F
N:T362I |
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Evidencia de aumento en hospitalizaciones | ![]() |
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[38] [39] |
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Enero 2023 | VOC | XBB.1.16 | Arturo | XBB.1 | ORF1a:P926H, ORF1a: F3677L, S:A27S, S:G142D, S:H146Q, S:E180V, S:V213E, S:G252V, S:E484A, S:F486P, S:F486L, S:T547I, ORF3a:V13L, ORF8:G8 | ![]() |
Evidencia de aumento en hospitalizaciones | ![]() |
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[40] [41] |
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Febrero 2023 | VOC | XBB.1.16.1.1 / FU.1 | XBB.1.16 | F3677L | ![]() |
Evidencia de aumento en hospitalizaciones | ![]() |
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[42] [43] | |
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Noviembre 2022 | VOC | XBB.1.22 | Bellatrix | XBB.1 | P486 | ![]() |
Evidencia de aumento en hospitalizaciones | ![]() |
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[44] [45] |
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Enero 2023 | VOC | XBB.2.3 | Acrux | XBB.2 | ![]() |
Evidencia de aumento en hospitalizaciones | ![]() |
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[46] [47] | |
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Agosto 2022 | VOC | BA.2.3.20 | Basilisco | BA.2.3 | M153T, N164K, H245N, G257D, K444R, N450D, L452M, N460K, E484R, R493Q | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
Sin evidencia | [48] [49] |
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Enero 2022 | VOC | BA.4.1.9 | Cetus | BA.4 | S:346T, S:K444R | Sin evidencia | Sin evidencia | Sin evidencia | Sin evidencia | [50] [51] |
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Mayo 2022 | VOC | BA.4.6 | Atenea | BA.4 | R346T | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[52] [53] |
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Abril 2022 | VOC | BA.5.1 | Esfinge | BA.5 | S: R346T | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[54] [55] |
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Agosto 2022 | VOC | BA.5.1.25 / DJ.1 | BA.5 | S:K444N, S:N460K | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[56] [57] | |
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Julio 2022 | VOC | BA.5.2 | Tritón | BA.5 | ORF1b: T1050 | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
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[58] [59] |
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Mayo 2022 | VOC | BA.5.2.1.5.1 / BF.5.1 | Gojira | BA.5 | ORF1a:
I2873V, ORF1b: S1273L |
Sin evidencia | Sin evidencia contundente | ![]() |
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[60] |
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Julio 2022 | VOC | BF.7 | Minotauro | BA.5 | R346T | ![]() |
Sin evidencia | ![]() |
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[61] [62] [63] |
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Septiembre 2022 | VOC | BF.7.14 | BA.5 | C1243F, S:T883I | ![]() |
Posiblemente de mayor gravedad | ![]() |
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[64] [65] | |
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Mayo 2022 | VOC | BF.11 | Pitón | BA.5 | S11 | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
Sin evidencia | [66] |
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Septiembre 2022 | VOC | BA.5.2.48 | BA.5 | C1243F | Posiblemente más transmisible | Posiblemente de mayor gravedad | ![]() |
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[67] [68] | |
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Enero 2022 | VOC | BA.5.3 | Minos | BA.5 | C28724T/ N:P151S | Sin evidencia | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
[69] [70] |
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Agosto 2022 | VOC | BA.5.3.1.1.1.1.1 / BQ.1 | Tifón | BA.5 | S:N460K, S:L452R, S:F486V | ![]() |
Sin evidencia | ![]() |
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[71] [72] |
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Julio 2022 | VOC | BQ.1.1 | Cerbero / Perro del infierno | BA.5 | S:N460K, S:L452R, S:F486V | ![]() |
Sin evidencia | ![]() |
![]() |
[73] [74] |
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Julio 2022 | VOC | BA.5.6.2.1 / BW.1 | Xibalbá | BA.5 | S:L452R, S:F486V | ![]() |
Sin evidencia | ![]() |
Sin evidencia | [75] [76] |
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Octubre 2022 | VOC | XBF | Bythos (Ictiocentauro) | BA.5 | ORF1a:
K120N, S:F486P, E:T11A |
Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
Sin evidencia | [77] [78] |
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Marzo 2022 | VOC | XE | X | Sin evidencia | Sin evidencia | ![]() |
Sin evidencia | [79] [80] |
Variantes de interés (VOI) circulantes o anteriores[editar]
Una variante emergente puede haber sido etiquetada como "variante de interés".[81] Durante o después de una evaluación más completa como una "variante de interés", la variante generalmente se asigna a un linaje en el sistema de nomenclatura PANGOLIN[82] y a clados en los sistemas Nextstrain[83] y GISAID.[84] Tras una actualización de criterios de clasificación de la OMS, ya no se asignan letras griegas para las variantes de interés.
Descubrimiento | Categoría máxima alcanzada | Denominaciones | Linaje | Cambios | Notas y referencias | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Posible origen | Primera detección | Muestra más temprana documentada | Denominación de la OMS | Denominaciones científicas | Denominaciones populares | Mutaciones notables | Transmisibilidad | Severidad | Inmunogenicidad | Antigenicidad | |||
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Marzo de 2020 | VOI | Épsilon ε | B.1.427 / B.1.429 | Californiana | B.1 | L452R, S13I,
W152C¨ |
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Sin evidencia de cambio | ![]() |
Sin evidencia de ser menos detectable | [5] |
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Abril de 2020 | VOI | Zeta ζ | P.2 | Carioca | P | E484K,
D614G, V1176F |
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[5] |
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Diciembre de 2020 | VOI | Eta η | B.1.525 | Nigeriana | B.1 | E484K
F888L |
Sin evidencia contundente | Sin evidencia contundente | Sin evidencia contundente | Sin evidencia contundente | [5] |
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Enero 2021 | VOI | Theta θ | P.3 | Filipina | P | E484K, N501Y, D614G, P681H,
E1092K, H1101Y, V1176F, K2Q |
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[5] |
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Noviembre de 2020 | VOI | Iota ι | B.1.526 | Neoyorkina | B.1 | E484K,
S477N |
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Sin evidencia contundente | ![]() |
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[5] |
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Octubre de 2020 | VOI | Kappa κ | B.1.617.1 | Pakistaní | B.1.617 | E484Q L425R |
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Sin evidencia de una mayor mortalidad | ![]() |
Sin evidencia contudente | [5] |
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Diciembre de 2020 | VOI | Lambda λ | C.37 | Peruana / Andina | C | G75V, T76I, Δ246-252, L452Q, F490S, D614G, T859N | ![]() |
Sin evidencia contudente | ![]() |
Sin evidencia contudente | [5] |
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Enero 2021 | VOI | Mu μ | B.1.621 | Colombiana | B.1 | T95I, Y144S, Y145N, R346K, E484K, N501Y, D614G, P681H, D950N, Y144S, Y145N, 256I, N257Q, P258, T95I, Y144S, Y145N, R346K, E484K, N501Y, D614G, P681H, D950N | ![]() |
Sin evidencia contudente | ![]() |
Sin evidencia contudente | [5] |
Variantes bajo seguimiento (VUM) circulantes o anteriores[editar]
Descubrimiento | Categoría máxima alcanzada | Denominaciones | Linaje | Cambios | Notas y referencias | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Posible origen | Primera detección | Muestra más temprana documentada | Denominaciones científicas | Denominaciones populares | Mutaciones notables | Transmisibilidad | Severidad | Inmunogenicidad | Antigenicidad | |||
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![]() |
Mayo 2021 | VUM | AV.1 / B.1.1.482.1 | Senegalesa | B.1 | ![]() |
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[85] [86] | |
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Mayo 2021 | VUM | AT.1/ B.1.1.370.1 | Rusa | B.1 | ![]() |
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[87] [88] | |
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Enero 2021 | VUM | R.1 | Tokiota | R | ![]() |
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[89] [90] | |
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Noviembre 2020 | VUM | B.1.466.2 | Indonesia | B.1 | ![]() |
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[91] [92] | |
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Noviembre 2020 | VUM | B.1.1.519 | Tapatía | B.1 | ![]() |
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[93] [94] | |
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Noviembre de 2020 | VUM | ΔFVI-spike Cluster V | Danesa | B.1 | Y453F 69-70deltaHV¨ | ![]() |
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(† Erradicada por el humano) [95] |
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Enero 2021 | VUM | C.36.3 | Sudamericana | C | ![]() |
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[96] [97] | |
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Noviembre 2020 | VUM | B.1.214.2 | Belga | B.1 | ![]() |
Sin evidencia contundente | ![]() |
Sin evidencia contundente | [98] [99] | |
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Mayo 2020 | VUM | B.1.1.523 | Moscovita | B.1 | ![]() |
Evidencia de mayor mortalidad | ![]() |
Sin evidencia contundente | [100] [101] | |
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Mayo 2020 | VUM | B.1.619 | Lituana | B.1 | ![]() |
Sin evidencia contundente | Evidencia de evasión | Sin evidencia contundente | [102] [103] | |
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Noviembre 2020 | VUM | B.1.620 | Sudcoreana | B.1 | ![]() |
Sin evidencia contundente | Evidencia de evasión | Sin evidencia contundente | [104] [103] | |
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Marzo 2021 | VUM | B.1.630 | Dominicana | B.1 | E484Q | ![]() |
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[105] [106] |
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Diciembre 2020 o enero 2021 | VUM | B.1.1.318 | Africana | B.1 | E484K, Y144del, P681H | ![]() |
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Sin evidencia contundente | ![]() |
[107] [108] |
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![]() |
Mayo 2021 | VUM | C.1.2 | Suazi | C | N501Y | ![]() |
Sin evidencia contundente | ![]() |
Sin evidencia contundente | [109] [110] |
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Septiembre de 2021 | VUM | B.1.640.1 / B.1.X | Congoleña | B.1.640 | ![]() |
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Sin evidencia contundente | [111] [112] | |
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Noviembre de 2021 | VUI | B.1.640.2 / IHU | Francesa | B.1.640 | ![]() |
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Sin evidencia contundente | [113] | |
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Febrero de 2022 | VUM | XD y XF | Deltacron | B.1.617.2 x B.1.529 | ![]() |
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Sin evidencia contundente | [114] [115] [116] | |
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Septiembre de 2022 | VUM | XAY.2 | AY.45 x BA.4/5 | Sin evidencia contundente | Sin evidencia contundente | Sin evidencia contundente | Sin evidencia contundente | [117] [118] |
Variantes adicionales[editar]
Otras variantes registradas:
Wuhan, Hubei, China (2019) Virus ancestral[119].
Nigeria (2020) B.1.1.207[120].
Nueva York, Estados Unidos (enero 2022) Linajes crípticos [121].
Variantes descartadas:
Vietnam (2021) XC / Híbrida alfa x delta: Reclasificada[122].
Chipre (2022) Deltacron: Error de laboratorio[123].
Se pueden encontrar más variantes en rastreadores como PANGO y GISAID.
Enlaces externos[editar]
Véase también[editar]
Referencias[editar]
- ↑ «Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2». WHO. Consultado el 19 de enero de 2023.
- ↑ «Clasificaciones y definiciones de las variantes del SARS-CoV-2». CDC. Consultado el 19 de enero de 2023.
- ↑ Shahhosseini, Nariman; Babuadze, George (Giorgi); Wong, Gary; Kobinger, Gary P. (May 2021). «Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern». Microorganisms (en inglés) 9 (5): 926. PMC 8146828. PMID 33925854. doi:10.3390/microorganisms9050926.
- ↑ «Declaración sobre la actualización de las definiciones de trabajo y del sistema de seguimiento de las variantes preocupantes y las variantes de interés del SARS-CoV-2». OMS. 16 de marzo de 2023. Consultado el 26 de mayo de 2023.
- ↑ a b c d e f g h i j k l «Estas son todas las variantes de la covid hasta ahora: de la delta a la lambda». Heraldo de Aragón. 1 de julio de 2021. Consultado el 19 de enero de 2023.
- ↑ «Delta plus: la nueva mutación del coronavirus que está causando un número creciente de infecciones en Reino Unido». BBC. 21 de octubre de 2021. Consultado el 19 de enero de 2023.
- ↑ «"Ómicron, la inquietante variante multimutante del coronavirus"». DW. Noviembre de 2021. Consultado el 19 de enero de 2023.
- ↑ a b c d e «Omicron variant (B.1.1.529) and its sublineages: What do we know so far amid the emergence of recombinant variants of SARS-CoV-2?». National Library of Medicine PubMed Central (en inglés). Octubre 2022. Consultado el 5 de enero de 2023.
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