Diferencia entre revisiones de «Ritmo reproductivo básico»

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Revisión del 17:39 1 may 2020

Valores de R0 para enfermedades infecciosas bien conocidas[1]
Enfermedad Transmisión R0
Sarampión Aérea 12–18[2]
Varicela Aérea 10–12[3]
Tos ferina Gotículas aerotransportadas 5,5[4]
Rubéola Gotículas aerotransportadas 5–7
Paperas Gotículas aerotransportadas 4–7
Viruela Gotículas aerotransportadas 3,5–6[5]
SARS Gotículas aerotransportadas 2–5[6]
VIH/SIDA Contacto sexual 2–5
Difteria Saliva 1,7–4,3[7]
Ébola Contacto con fluidos corporales 1,5-2,5[8]
COVID-19 Gotículas aerotransportadas 1,4–5,7[9][10][11][12]
Influenza
(pandemia de 1918)
Gotículas aerotransportadas 1,4–2,8[13]

En epidemiología, el número básico de reproducción (a veces llamado ritmo básico de reproducción, ratio reproductiva básica y denotadas por R0, r sub-cero) de una infección es el número promedio de casos nuevos que genera un caso dado a lo largo de un período infeccioso.[14]

Esta métrica es útil debido a que ayuda a determinar cuando una enfermedad infecciosa puede dar lugar a un brote epidémico serio. Las raíces del concepto reproductivo básico se remonta al trabajo de Alfred Lotka, Ronald Ross y otros, aunque su primera aplicación moderna se debe a George MacDonald en 1952, que construyó modelos epidemiológicos de la propagación de la malaria.

Cuando

R0 < 1

la infección muere tras un largo período. Pero si

R0 > 1

la infección puede llegar a propagarse ampliamente entre una población.

Generalmente, cuanto más grande R0 es tanto más difícil será controlar la epidemia. Por ejemplo, los modelos simples, la proporción de la población que necesita estar vacunada para prevenir la propagación sostenida de la infección viene dada por 1 - 1/R0. El ritmo reproductivo básico se ve afectado por muchos factores, entre ellos la duración del periodo infeccioso de un organismo, y el número de personas susceptibles dentro de la población y con los que los pacientes afectados entran en contacto.

Métodos de estimación

Durante una epidemia, generalmente se conoce el número de infecciones diagnosticadas a lo largo del tiempo . En las primeras etapas de una epidemia, el crecimiento es exponencial, con una tasa de crecimiento logarítmico:

Para el crecimiento exponencial, puede interpretarse como el número acumulado de diagnósticos (incluidos los individuos que se han recuperado) o el número actual de pacientes diagnosticados; La tasa de crecimiento logarítmico es la misma para cualquiera de las dos definiciones. Para estimar , se necesita hacer suposiciones en cuanto al tiempo entre la infección y su diagnóstico y así mismo en cuanto al tiempo entre la infección y el comienzo de la infección.

En todo crecimiento exponencial, está relacionado con el tiempo de duplicación de la siguiente manera:

.

Modelo simple

Si un individuo, después de infectarse, infecta exactamente a individuos nuevos solo después de que haya transcurrido exactamente un tiempo (el intervalo de serie), entonces el número de individuos infecciosos crece en función del tiempo:

ó:

En este caso,

o .

Por ejemplo, con y , encontraríamos .

Si depende del tiempo:

mostrando que puede ser importante mantener debajo de 0, promediado en el tiempo, para evitar un crecimiento exponencial.

Período infeccioso latente, aislamiento después del diagnóstico

En este modelo, una infección individual tiene las siguientes etapas:

  1. Expuesto: un individuo está infectado, pero no tiene síntomas y todavía no infecta a otros. La duración promedio del estado expuesto es .
  2. Latente infeccioso: un individuo está infectado, no tiene síntomas, pero infecta a otros. La duración promedio del estado infeccioso latente es . El individuo infecta a otros individuos durante este período.
  3. Aislamiento después del diagnóstico: se toman medidas para prevenir futuras infecciones, por ejemplo aislando al paciente.

Este es un modelo SEIR[15]​, por tanto R 0 se puede escribir en de la siguiente forma [16]​:

Este método de estimación se ha aplicado a COVID-19 y SARS. Se deduce de la ecuación diferencial para el número de individuos expuestos y el número de individuos infecciosos latentes ,


El valor propio más grande de esta matriz es precisamente la tasa de crecimiento logarítmico , que puede resolverse para .

En el caso especial , este modelo da como resultado , que es diferente del modelo simple anterior (). Por ejemplo, con los mismos valores y , encontraríamos , en lugar de . La diferencia se debe a una sutil diferencia en el modelo de crecimiento subyacente; la ecuación matricial anterior supone que los pacientes recién infectados pueden comenzar a transmitir la enfermedad directamente después de infectarse; el tiempo es el tiempo promedio. Esta diferencia ilustra que un valor estimado del número de reproducción depende del modelo matemático subyacente; Si el número de reproducción se estima a partir de un modelo en particular, se debe utilizar el mismo modelo para las predicciones sobre el futuro.

Limitaciones de R0

Cuando R0 se calcula a partir de modelos epidemiológicos, particularmente en los basados en ecuaciones diferenciales deterministas, lo que usualmente se denomina R0 es, solamente un umbral, no un número promedio de infecciones secundaria. Existen diversos métodos para estimar dicho umbral a partir de un modelo matemático, pero pocos de ellos proporicionan el verdadero valor de R0. La situación se hace especialmente problemática en el caso en que existe vectores intermediarios entre los portadores, como sucede en el caso de la malaria.

Lo que esos umbrales representan es si un brote se extingue por sí mismo(si R0 < 1) o si por el contrario se vuelve endémico (si R0 > 1), pero en general no puede comparar diferentes tipos de brotes. Por tanto, los valores comparados de R0 deben ser tomados con precaución, especialmente si los valores se han calculado a partir de modelos matemáticos, que sólo constituyen una aproximación al contagio de la enfermedad.


Otros usos

R0 se usa también como una medida de éxito reproductivo individual en ecología de poblaciones.[17]​ Representa el número medio de descendientes creados sobre el período vital por un individuo (bajo condiciones ideales).

Para modelos epidemiológicos simples, R0 puede ser calculado, dado que la tasa de decaimiento sea bien conocida. En este caso, la tasa de decaimiento ("tasa de mortalidad" usualmente 1/d) proporciona la vida media de un indiviudo. Cuando se multiplica el promedio de descendientes por individuo y por paso de tiempo ("tasa de natalidad" b), esto proporciona R0 = b / d. Para modelos más complicados, que tienen tasas de crecimiento variables (e.g. a causa de la autolimitación), se debería la tasa máxima de crecimiento.

En la cultura popular

En la película de 2011 Contagio, una película de suspense sobre un desastre médico ficticio, se presentan cálculos de R0 para reflejar la progresión de una infección fatal de origen vírico de casos de estudio de una pandemia.

Véase también

Referencias

  1. Salvo indicación contraria, los valores de R0 provienen de: CDC; OMS, History and Epidemiology of Global Smallpox Eradication, Smallpox: Disease, Prevention, and Intervention, archivado desde el original el 15 de julio de 2007 .
  2. Guerra, Fiona M.; Bolotin, Shelly; Lim, Gillian; Heffernan, Jane; Deeks, Shelley L.; Li, Ye; Crowcroft, Natasha S. (1 de diciembre de 2017). «The basic reproduction number (R0) of measles: a systematic review». The Lancet Infectious Diseases (en inglés) 17 (12): e420-e428. ISSN 1473-3099. doi:10.1016/S1473-3099(17)30307-9. Consultado el 18 de marzo de 2020. 
  3. Ireland's Health Services. Health Care Worker Information. Consultado el 27 de marzo de 2020. 
  4. «Incidence and reproduction numbers of pertussis: estimates from serological and social contact data in five European countries.». PLOS Med. 7 (6): e1000291. 2010. PMC 2889930. PMID 20585374. doi:10.1371/journal.pmed.1000291.  Parámetro desconocido |vauthors= ignorado (ayuda)
  5. Gani, Raymond; Leach, Steve (December 2001). «Transmission potential of smallpox in contemporary populations». Nature (en inglés) 414 (6865): 748-751. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/414748a. Consultado el 18 de marzo de 2020. 
  6. Wallinga J, Teunis P (2004). «Different epidemic curves for severe acute respiratory syndrome reveal similar impacts of control measures». Am. J. Epidemiol. 160 (6): 509-16. PMID 15353409. doi:10.1093/aje/kwh255. Archivado desde el original el 6 de octubre de 2007. 
  7. Truelove, Shaun A.; Keegan, Lindsay T.; Moss, William J.; Chaisson, Lelia H.; Macher, Emilie; Azman, Andrew S.; Lessler, Justin. «Clinical and Epidemiological Aspects of Diphtheria: A Systematic Review and Pooled Analysis». Clinical Infectious Diseases (en inglés). doi:10.1093/cid/ciz808. Consultado el 18 de marzo de 2020. 
  8. Calculo del ritmo reproductivo básico (Ro) para el Brote del Virus Ebola 2014, archivado desde el original el |urlarchivo= requiere |fechaarchivo= (ayuda), consultado el 23 de noviembre de 2015 .
  9. «Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia». The New England Journal of Medicine 382 (13): 1199-1207. January 2020. PMC 7121484. PMID 31995857. doi:10.1056/NEJMoa2001316.  Parámetro desconocido |vauthors= ignorado (ayuda); Parámetro desconocido |doi-access= ignorado (ayuda)
  10. Riou, Julien; Althaus, Christian L. (2020). «Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020». Eurosurveillance 25 (4). PMC 7001239. PMID 32019669. doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058. 
  11. Wu, Joseph T.; Leung, Kathy; Bushman, Mary; Kishore, Nishant; Niehus, Rene; de Salazar, Pablo M.; Cowling, Benjamin J.; Lipsitch, Marc et al. (19 March 2020). «Estimating clinical severity of COVID-19 from the transmission dynamics in Wuhan, China». Nature Medicine (en inglés) 26 (4): 506-510. ISSN 1546-170X. PMID 32284616. doi:10.1038/s41591-020-0822-7.  Parámetro desconocido |doi-access= ignorado (ayuda);
  12. Sanche, Steven; Lin, Yen Ting; Xu, Chonggang; Romero-Severson, Ethan; Hengartner, Nick; Ke, Ruian (7 April 2020). «High Contagiousness and Rapid Spread of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2». Emerging Infectious Diseases 26 (7). PMID 32255761. doi:10.3201/eid2607.200282. Consultado el 9 April 2020. 
  13. Mills CE, Robins JM, Lipsitch M (2004). «Transmissibility of 1918 pandemic influenza». Nature 432 (7019): 904-6. PMID 15602562. doi:10.1038/nature03063. Archivado desde el original el 6 de septiembre de 2006. 
  14. Christophe Fraser; Christl A. Donnelly, Simon Cauchemez et al. (19 de junio de 2009). «Pandemic Potential of a Strain of Influenza A (H1N1): Early Findings». Science 324 (5934): 1557-1561. PMC 3735127. PMID 19433588. doi:10.1126/science.1176062.  Free text
  15. «modelos compartimentales en epidemiología - Compartmental models in epidemiology - qwe.wiki». es.qwe.wiki. Consultado el 1 de mayo de 2020. 
  16. Lipsitch, Marc; Cohen, Ted; Cooper, Ben; Robins, James M.; Ma, Stefan; James, Lyn; Gopalakrishna, Gowri; Chew, Suok Kai; Tan, Chorh Chuan; Samore, Matthew H.; Fisman, David (20 de junio de 2003). «Dinámica de transmisión y control del síndrome respiratorio agudo severo». Science 300 (5627): 1966-1970. Bibcode:... 300.1966L 2003Sci ... 300.1966L. ISSN 0036-8075. PMC 2760158. PMID 12766207. doi:10.1126 / science.1086616 |doi= incorrecto (ayuda). 
  17. de Boer, Rob J. Theoretical Biology. Consultado el 13 de noviembre de 2007. 

Bibliografía