Diferencia entre revisiones de «Genoma de la leucemia linfática crónica»

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La secuenciación del genoma de la LLC ha sido llevada a cabo por el ''Proyecto español para la secuenciación del genoma de la LlC'' -con la participación de más de 60 investigadores de diversas instituciones investigadoras y sanitarias- dirigidos por [[Elías Campo]] y [[Carlos López Otín]] dentro del ''Proyecto Internacional del Genoma del Cáncer'' ([[International Cancer Genome Consortium]]).<ref>[http://www.icgc.org/icgc/cgp/64/530/826 ICG - Consortium CLL]</ref><ref>[http://www.icgc.org/ International Cancer Genome ConsortiumConsorcio Internacional del Genoma del Cáncer ICGC]</ref>
La secuenciación del genoma de la LLC ha sido llevada a cabo por el ''Proyecto español para la secuenciación del genoma de la LlC'' -con la participación de más de 60 investigadores de diversas instituciones investigadoras y sanitarias- dirigidos por [[Elías Campo]] y [[Carlos López Otín]] dentro del ''Proyecto Internacional del Genoma del Cáncer'' ([[International Cancer Genome Consortium]]).<ref>[http://www.icgc.org/icgc/cgp/64/530/826 ICG - Consortium CLL]</ref><ref>[http://www.icgc.org/ International Cancer Genome ConsortiumConsorcio Internacional del Genoma del Cáncer ICGC]</ref>

En 2018 el estudio publicado en 'Nature Medicine', ''The reference epigenome and regulatory chromatin landscape of chronic lymphocytic leukemia con descifra cómo funciona el genoma de la leucemia'', explica las alteraciones en el funcionamiento normal del ADN en la leucemia linfática crónica. Estas alteraciones en el epigenoma, unas 500, permiten entender los mecanismos moleculares y facilitar dianas para posibles reversiones.<ref name=epigenome_chronic_lymphocytic_leukemia_2018>{{cita publicación|apellidos1=Beekman|nombre1=Renée|apellidos2=Chapaprieta|nombre2=Vicente|apellidos3=...|nombre3=....|apellidos4=Martin_Subero|nombre4=José I.|título=The reference epigenome and regulatory chromatin landscape of chronic lymphocytic leukemia|publicación=Nature Medicine|fecha=21 de mayo de 2018|doi=10.1038/s41591-018-0028-4|url=https://www.nature.com/articles/s41591-018-0028-4|fechaacceso=22 de mayo de 2018}}</ref>


== Proyecto Internacional de Genoma del Cáncer - ICGC ==
== Proyecto Internacional de Genoma del Cáncer - ICGC ==
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;Instituciones británicas
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* [[Wellcome Trust Sanger Institute]] - [[Reino Unido]] - Sanger Institute, Genome Projects
* [[Wellcome Trust Sanger Institute]] - [[Reino Unido]] - Sanger Institute, Genome Projects


== Epigenoma de la Leucemia Linfática crónica ==
En 2018 el estudio realizado en [[IDIBAPS]] (Instituto de Investigacioens Biomédicas August Pi i Suñer) publicado en 'Nature Medicine', ''[https://www.nature.com/articles/s41591-018-0028-4 The reference epigenome and regulatory chromatin landscape of chronic lymphocytic leukemia con descifra cómo funciona el genoma de la leucemia]'', explica las alteraciones en el funcionamiento normal del ADN en la leucemia linfática crónica. Estas alteraciones en el [[epigenoma]], unas 500, permiten entender los mecanismos moleculares y facilitar dianas para posibles reversiones.
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Según el investigador Martín-Subero los cambios epigenéticos pueden revertirse por lo que podrían modificarse los cambios provocados por la enfermedad. Aunque se desconocen los desencadenantes ambientales, si se desarrollan, se pueden usar fármacos para eliminar directamente las marcas epigenéticas que provoa la leucemia linfática crónica. Estas técnicas son muy incipientes por lo que se tardará en hallar los medicamentos adecuados. En 2017 se detectó un la forma de inhibir una proterína llamada NFAT que paraba el crecimiento celular en células afectadas por leucemia, pero era todavía un estudio de laboratorio.<ref>[http://www.publico.es/ciencias/descifran-funciona-genoma-leucemia-frecuente.html Descifran cómo funciona el genoma de la leucemia más frecuente]</ref>



== Referencias ==
== Referencias ==

Revisión del 05:27 22 may 2018

Un linfocito sano visto mediante microscopio electrónico de barrido. En la leucemia linfática crónica los linfocitos dejan de cumplir su función inmunitaria.

El genoma de la leucemia linfática crónica, de manera completa en 4 pacientes, fue secuenciado por primera vez en el año 2010 y publicado en la revista Nature el 5 de mayo de 2011.[1]​[2]​ La secuenciación del genoma completo de la leucemia linfática crónica permite conocer los genes mutados -en relación con los genes normales de células no modificadas que afectan a los distintos enfermos-, y establecer cuales son comunes o frecuentes lo que permitirá diseñar tratamientos específicos para cada paciente.[3]​

La secuenciación del genoma de la LLC ha sido llevada a cabo por el Proyecto español para la secuenciación del genoma de la LlC -con la participación de más de 60 investigadores de diversas instituciones investigadoras y sanitarias- dirigidos por Elías Campo y Carlos López Otín dentro del Proyecto Internacional del Genoma del Cáncer (International Cancer Genome Consortium).[4]​[5]​

En 2018 el estudio publicado en 'Nature Medicine', The reference epigenome and regulatory chromatin landscape of chronic lymphocytic leukemia con descifra cómo funciona el genoma de la leucemia, explica las alteraciones en el funcionamiento normal del ADN en la leucemia linfática crónica. Estas alteraciones en el epigenoma, unas 500, permiten entender los mecanismos moleculares y facilitar dianas para posibles reversiones.[6]​

Proyecto Internacional de Genoma del Cáncer - ICGC

El Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer (ICGC) es el encargado de organizar y coordinar un gran número de proyectos de investigación que tienen el objetivo común de esclarecer exhaustivamente los cambios genéticos presentes en muchos de los cánceres que afectan a personas en todo el mundo.

El objetivo principal es generar bases de datos globales de carácter público y abierto accesibles a investigadores, médicos y otros especialistas sobre las anomalías genómicas (mutaciones somáticas, expresión anormal de genes, modificaciones epigenéticas) en los tumores de 50 tipos diferentes de cáncer o subtipos de cáncer que son de gran importancia clínica y social en todo el mundo. Los datos se pondrán a disposición de toda la comunidad investigadora con la mayor rapidez posible, y con restricciones mínimas, para acelerar la investigación sobre las causas y el control del cáncer. El ICGC pretende facilitar la comunicación entre los miembros y proporciona un espacio para la coordinación con el objetivo de maximizar la eficiencia entre los científicos que trabajan para entender, tratar y prevenir estas enfermedades.[7]​

Proyecto genoma de la LLC (2009 - 2012)

Frote sanguíneo mostrando linfocitos (morados) en una LLC.

Dentro del proyecto mundial para la secuenciación del genoma del cáncer gestionado por el Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer (ICGC) España es la encargada de la secuencia genómica de la leucemia linfática crónica[8]​ a través del Proyecto genoma Leucemia linfática crónica - España. El objetivo es secuenciar el genoma en numerosos pacientes y poder establecer las homogeneidades, las variabilidades y, en su caso, un diagnóstico más personalizado y eficaz.[9]​ El 15 de abril de 2010 fueron publicados en Nature los avances de los primeros resultados de los primeros 5 genomas completos de pacientes con LLC.[10]​[11]​

Organismos participantes

El organismo director y financiero es el Instituto de Salud Carlos III (organismo público dependiente del Ministerio de Ciencia e Innovación de España).[12]​ La dirección científica del proyecto corre a cargo del Dr. Elías Campo y del Dr. Carlos López Otín.[13]​[14]​ Dos de las instituciones que participan y que tienen más tradición y reconocimiento en LLC son el Hospital Clínico y Provincial de Barcelona y el Hospital clínico de Salamanca. También participan la Universidad de Oviedo, el Centro de Regulación Genómica de Barcelona, el Instituto Catalán de Oncología, la Universidad de Deusto, el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, el Banco Nacional de ADN y la Universidad de Barcelona, con el apoyo técnico para la investigación de la Red Temática en Investigación Cooperativa en Cáncer (RTICC).[15]​

Publicación en Nature del genoma de la LLC el 5 junio de 2011

El 5 de junio de 2011 fue publicado en la revista Nature el artículo -remitido en diciembre de 2010-[16]​ fruto del trabajo del equipo español responsable del genoma de la LLC[8]​ y miembro del International Cancer Genome Consortium.[1]​[2]​[17]​

Contenido de la publicación en Nature

Icono del genoma humano

En el artículo Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia (Secuenciación completa del genoma de la leucemia linfática crónica con identificación de las mutaciones recurrentes) puede leerse:[1]​

La leucemia linfocítica crónica (LLC), la leucemia más frecuente en adultos en los países occidentales, es una enfermedad heterogénea con diagnóstico y evolución clínica variable. Se pueden distinguir dos subtipos moleculares principales, caracterizados, respectivamente, por un número alto o bajo de hipermutaciones somáticas en la región variable de los genes implicados en la inmunoglobulina. Los cambios moleculares que conducen a la patogénesis de la enfermedad son aún poco conocidos. La publicación presenta la realización de la secuenciación del genoma completo de cuatro casos de leucemia linfática crónica (LLC o CLL) así como la identificación de 46 mutaciones somáticas que pueden afectar la función del gen. Un análisis más detallado de estas mutaciones en 363 pacientes con LLC ha identificado cuatro genes que están mutados de manera recurrente: notch 1 (NOTCH1), exportina 1 (XPO1), diferenciación mieloide del gen de respuesta primaria 88 (MYD88) y Kelch-like 6 (KLHL6). Las mutaciones en MYD88 y KLHL6 predominan en los casos de LLC con los genes de inmunoglobulina mutado, mientras que las mutaciones NOTCH1 y XPO1 se detectaron principalmente en pacientes con inmunoglobulinas sin mutación. Los patrones de mutación somática, con el apoyo de los análisis funcionales y clínicos, indican claramente que las mutaciones recurrentes NOTCH1, MYD88 y XPO1 son cambios oncogénicos que contribuyen a la evolución clínica de la enfermedad. Hasta donde sabemos, este es el primer análisis exhaustivo de la LLC que combina la secuenciación del genoma completo de características clínicas y los resultados clínicos. Es destacable la utilidad de este enfoque para la identificación de mutaciones clínicamente relevantes en el cáncer.[1]​

Autores

Instituciones

Instituciones españolas
Instituciones británicas


Epigenoma de la Leucemia Linfática crónica

En 2018 el estudio realizado en IDIBAPS (Instituto de Investigacioens Biomédicas August Pi i Suñer) publicado en 'Nature Medicine', The reference epigenome and regulatory chromatin landscape of chronic lymphocytic leukemia con descifra cómo funciona el genoma de la leucemia, explica las alteraciones en el funcionamiento normal del ADN en la leucemia linfática crónica. Estas alteraciones en el epigenoma, unas 500, permiten entender los mecanismos moleculares y facilitar dianas para posibles reversiones. [6]​

Según el investigador Martín-Subero los cambios epigenéticos pueden revertirse por lo que podrían modificarse los cambios provocados por la enfermedad. Aunque se desconocen los desencadenantes ambientales, si se desarrollan, se pueden usar fármacos para eliminar directamente las marcas epigenéticas que provoa la leucemia linfática crónica. Estas técnicas son muy incipientes por lo que se tardará en hallar los medicamentos adecuados. En 2017 se detectó un la forma de inhibir una proterína llamada NFAT que paraba el crecimiento celular en células afectadas por leucemia, pero era todavía un estudio de laboratorio.[23]​


Referencias

  1. ↑ a b c d Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia, Nature (2011) doi:10.1038/nature10113 5 de junio de 2011,
  2. ↑ a b CLL Genome, Ministerio de Ciencia e Innovación, España
  3. ↑ España pone cerco al tipo de leucemia más común. Un consorcio de 60 investigadores secuencia por primera vez el genoma de cuatro enfermos con la variante crónica de cáncer sanguíneo más frecuente en países desarrollados. Señalan cuatro genes que podrían causar la dolencia, 5/6/2011, Nuño Domínguez - Público (España)
  4. ↑ ICG - Consortium CLL
  5. ↑ International Cancer Genome ConsortiumConsorcio Internacional del Genoma del Cáncer ICGC
  6. ↑ a b Beekman, Renée; Chapaprieta, Vicente; ..., ....; Martin_Subero, José I. (21 de mayo de 2018). «The reference epigenome and regulatory chromatin landscape of chronic lymphocytic leukemia». Nature Medicine. doi:10.1038/s41591-018-0028-4. Consultado el 22 de mayo de 2018. 
  7. ↑ About ICGC - Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer
  8. ↑ a b Chronic Lymphocytic Leukemia - CLL with mutated and unmutated IgVH
  9. ↑ Secuenciado el primer genoma de un español, 14/4/2010, Público, España
  10. ↑ Los primeros cinco genomas de leucemia linfática crónica, El País, 14/4/2010
  11. ↑ Spain - Chronic Lymphocytic Leukemia - CLL with mutated and unmutated IgVH, en ICGC
  12. ↑ a b Ciencia e Innovación financia con 10 M€ a científicos españoles para una importante investigación sobre leucemia
  13. ↑ Scientific Directors: Dr. Elías Campo and Dr. Carlos López-Otín - Genome Project CLL
  14. ↑ Noticia Genoma LLC - Elías Campo y Carlos López Otín, en Hospital Clínic de Barcelona
  15. ↑ Investigadores españoles comienzan a secuenciar el genoma de la leucemia, HC
  16. ↑ Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia (Secuenciación completa del genoma de la leucemia linfática crónica con identificación de las mutaciones recurrentes)
  17. ↑ España pone cerco al tipo de leucemia más común, 5/6/2011 Público (España)
  18. ↑ dentifying Structural Rearrangements via Local Assembly of Next-Generation Sequence Data, 2010, videoconferencia, Wellcome Trust Sanger Institute
  19. ↑ a b Oncomorfologia funcional humana i experimental, IDIBPAS
  20. ↑ CNAG -UB, Universidad de Barclona
  21. ↑ CNAG - Centro Nacional de Análisis Genómico, Barcelona
  22. ↑ CNIO - Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas
  23. ↑ Descifran cómo funciona el genoma de la leucemia más frecuente

Véase también

Enlaces externos

Artículo en Nature
Páginas web de ICGC e ICGC-CLL-España
Otras páginas
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