En la temporada 1991-92, tras lograr el título de campeón de liga y superar la promoción de ascenso el equipo arlequinado logró su primer ascenso a Tercera División, permaneciendo 5 temporadas en la categoría.
Entre los años 1997 y 2003 el C. D. Varea jugó en la Preferente riojana, logrando regresar a la Tercera División tras superar la promoción de ascenso en la temporada 2002-03. En la nueva etapa en categorías nacionales el club de Varea se convirtió en un clásico de los puestos de cabeza culminando su progresión con el campeonato liguero de la temporada 2008-09. La guinda final de la temporada fue la consecución el 31 de mayo de 2009 del ascenso a Segunda B.[1] Días más tarde el equipo fue vendido al empresario Félix Revuelta y los socios del club aprobaron el cambio de nombre a U. D. Logroñés.[2]
En agosto de 2009 se fundó el actual Club Deportivo Varea y empezó a competir en Regional Preferente, consiguiendo el ascenso a la Tercera División, donde ha permanecido desde entonces. Entre las temporadas 2011-12 y 2014-15 el C.D. Varea disputó los play-off de ascenso a Segunda B, siendo en las dos últimas ocasiones con el privilegio de ser campeón de liga.
Adrián Gallego
Tercera Federación 2023-24 (Grupo XVI)
:Ascenso de categoría
:Descenso de categoría
U. D. Somozas
Cultural y Deportiva Leonesa
U. D. Las Palmas
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Levante U. D.
Datos: Q9197384