Protein Data Bank

De Wikipedia, la enciclopedia libre
Ir a la navegación Ir a la búsqueda
Ejemplos de estructuras de proteínas de la PDB

El Protein Data Bank (PDB) (Banco de Datos de Proteínas)[1]​ es una base de datos de la [Estructura terciaria de las proteínas|estructura tridimensional de las proteínas]] y ácidos nucleicos. Estos datos, generalmente obtenidos mediante cristalografía de rayos X o resonancia magnética nuclear, son enviados por biólogos y bioquímicos de todo el mundo. Están bajo el dominio público y pueden ser usados libremente.[2]​ El PDB está supervisado por una organización llamada Worldwide Protein Data Bank (wwPDB).

Historia[editar]

Fundado en 1971 por los doctores Edgar Meyer y Walter Hamilton del Brookhaven National Laboratory, la gestión fue transferida en 1988 al Research Collaboratory for Structural Bionformatics (RCSB). La Universidad Rutgers es la sede principal y esta actualmente dirigido por Helen M. Berman.[3]

El Worldwide Protein Data Bank (wwPDB) consiste en organizaciones que actúan como centros de depositado, procesado y distribución de los datos PDB. Los miembros fundadores son PDBe (Europa), RCSB PDB (EE. UU.), y PDBj (Japón). El grupo BMRB (EE. UU) se unió al wwPDB en 2006. La misión del wwPDB es la de mantener un único archivo Protein Data Bank de datos de estructuras macromoleculares disponible gratuita y públicamente para la comunidad global.

Crecimiento[editar]

Cuando se fundó, el PDB contenía tan solo 7 estructuras de proteínas. Desde entonces ha experimentado un crecimiento aproximadamente exponencial en el número de estructuras y nada parece indicar que el ritmo vaya a decaer.

El ritmo de crecimiento del PDB ha sido analizado en profundidad en diversos estudios.[4]

Véase también[editar]

Referencias[editar]

  1. «Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data». Nucleic Acids Research 47 (Database issue): D520-D528. 8 de enero de 2019. ISSN 0305-1048. PMC 6324056. PMID 30357364. doi:10.1093/nar/gky949. Consultado el 27 de abril de 2021. 
  2. «wwPDB: Worldwide Protein Data Bank». www.wwpdb.org. Consultado el 26 de abril de 2021. 
  3. «Helen M. Berman». Rutgers Chemistry and Chemical Biology Department. Archivado desde el original el 4 de julio de 2008. 
  4. «Protein Data Bank». www.ehu.eus. Consultado el 26 de abril de 2021. 

Enlaces externos[editar]