Estructura terciaria de las proteínas

Estructura terciaria de la mioglobina

La estructura terciaria de las proteínas se forma sobre la disposición de la estructura secundaria de un polipéptido al plegarse sobre sí misma originando una conformación globular, la cual se mantiene estable debido a la existencia de enlaces entre los radicales R de los aminoácidos. Entre estos enlaces aparecen los puentes disulfuro entre los radicales de aminoácidos que tienen azufre (cisteína) y otras fuerzas hidrófobas.

Las dos posibles estructuras terciarias son la estructura globular y la estructura fibrilar. La estructura globular tiene forma de "ovillo", es soluble, y es típica de las hormonas o los enzimas. La estructura fibrosa se caracteriza por dar a la proteína forma de filamento y ser insoluble; ejemplos de proteínas con esta estructura son la alfa o la beta-queratina y el colágeno.

Ubicación tridimensional[editar]

File:3EBX butoxin.png

Representación 3D a partir de los datos en coordenadas.

La estructura terciaria de una proteína es la distribución tridimensional de todos los átomos que constituyen la proteína.
Se puede afirmar que de la estructura terciaria derivan las propiedades biológicas de estas, puesto que la disposición en el espacio de los diferentes grupos funcionales de la proteína, condiciona su capacidad de interacción con otros grupos y ligandos. De esta manera, la estructura primaria (secuencia de aminoácidos) de la proteína determina la estructura terciaria

Representación esquemática en diagrama de cintas de la Triosa fosfato isomerasa, dibujada por Jane Richardson.

La estructura terciaria de una proteína está generalmente conformada por varios tramos con estructuras secundarias distintas.
En cuanto a los niveles de la estructura de las proteínas, en la estructura terciaria generalmente los aminoácidos apolares se sitúan hacia el interior de la proteína y los polares hacia el exterior, de manera que puedan interactuar con el agua circundante. En el caso de proteínas integrales de membrana, los aminoácidos hidrofóbicos quedan expuestos en el interior de la bicapa lipídica. Por tanto, este tipo de estructura es la que les da a las proteínas sus particularidades fisicoquímicas, como la polaridad o apolaridad de la molécula. ^[1]

Fuerzas que estabilizan la estructura terciaria[editar]

La estructura terciaria de las proteínas está afianzada por cuatro clases de interacciones: enlaces puentes disulfuro entre Cys, puentes de hidrógeno entre cadenas laterales, interacciones iónicas, interacciones de van der Waals, y el efecto hidrófobo (exclusión de las moléculas de agua evitando su contacto con los residuos hidrófobos, que quedan empaquetados en el interior de la estructura)y, recientemente se ha descubierto, como consecuencia de las investigaciones en materia de anatomía molecular, una estrecha relación entre las interacciones entre las regiones hidrofóbicas de las cadenas alifáticas radicales de las proteínas. Las interacciones entre las cadenas laterales de los residuos de la proteína dirigen al polipéptido para constituir una estructura compacta...

Predicción de la estructura[editar]

La estructura de una proteína conocida, se describe mediante un conjunto de coordenadas cartesianas 3D, donde cada coordenada (x, y, z) representa la posición de un átomo.
La Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction (CASP), ha mostrado progreso significativo en la predicción de estructuras.
El software impulsado por IA, llamado AlphaFold, "ve" los algoritmos que un humano no ve. Parte del resultado es cuánto ve: con suficientes datos de secuencia de proteínas (entrada de datos) y de estructura de proteínas (salida de datos), este modelo de IA profundo puede "aprender" una solución.^[2]