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El grupo de proteínas transportadoras de membrana del transportador de soluto (SLC) incluye más de 400 miembros organizados en 66 familias. [1]​ [2]​ La mayoría de los miembros del grupo SLC se encuentran en la membrana celular. El sistema de nomenclatura de genes SLC fue propuesto originalmente por el Comité de nomenclatura de genes HUGO (HGNC) y es la base para los nombres oficiales de HGNC de los genes que codifican estos transportadores. En la base de datos TCDB se puede encontrar una clasificación más general de transportadores transmembrana.

Los solutos que son transportados por los diversos miembros del grupo SLC son extremadamente diversos e incluyen moléculas orgánicas cargadas y no cargadas, así como iones inorgánicos y amoníaco.

Como es típico de las proteínas integrales de membrana, las SLC contienen una serie de hélices alfa transmembrana hidrofóbicas conectadas entre sí por bucles hidrofílicos intra y extracelulares. Dependiendo del SLC, estos transportadores son funcionales como monómeros u homo- o hetero-oligómeros obligados. Muchas familias de SLC son miembros de la superfamilia de facilitadores principales.

Alcance

Por convención del sistema de nomenclatura, los miembros dentro de una familia SLC individual tienen más del 20-25% de identidad de secuencia entre sí. Por el contrario, la homología entre familias SLC es muy baja o inexistente. [3]​ Por lo tanto, el criterio para la inclusión de una familia en el grupo SLC no es la relación evolutiva con otras familias SLC, sino más bien funcional (es decir, una proteína de membrana integral que transporta un soluto).

El grupo SLC incluye ejemplos de proteínas de transporte que son:

La serie SLC no incluye miembros de familias de proteínas de transporte que hayan sido clasificadas previamente por otros sistemas de nomenclatura ampliamente aceptados, incluidos:

Distribución subcelular

La mayoría de los miembros del grupo SLC están ubicados en la membrana celular, pero algunos miembros están ubicados en las mitocondrias (el más notable es la familia SLC 25) u otros orgánulos intracelulares.

Sistema de nomenclatura

Los nombres de los miembros individuales de SLC tienen el siguiente formato: [4]​

donde:

  • SLC es el nombre raíz (del inglés SoLute Carrier)
  • n = un número entero que representa una familia (por ejemplo, 1-52)
  • X = una sola letra (A, B, C, ...) que denota una subfamilia
  • m = un número entero que representa a un miembro individual de la familia (isoforma).

Por ejemplo, SLC1A1 es la primera isoforma de la subfamilia A de la familia 1 de SLC.

Una excepción ocurre con la familia SLC 21 [5]​ (los transportadores de polipéptidos transportadores de aniones orgánicos), que por razones históricas tienen nombres en el formato SLCOnXm donde n = número de familia, X = letra de subfamilia y m = número de miembro.

Mientras que el HGNC solo asigna nomenclatura a los genes humanos, por convención los ortólogos de vertebrados de estos genes adoptan la misma nomenclatura. Para los roedores, el caso de los símbolos difiere del de otros vertebrados por el uso del título, es decir Slc1a1 indica el ortólogo de roedor del gen SLC1A1 humano.

Familias

Las siguientes familias se nombran bajo SLC: [6]​

  1. transportador de glutamato y aminoácidos neutros de alta afinidad[7]​
  2. facilitative GLUT transporter[8]​
  3. heavy subunits of heterodimeric amino acid transporters[9]​
  4. bicarbonate transporter[10]​
    • (SLC4A1, SLC4A2, SLC4A3, SLC4A4, SLC4A5, SLC4A6, SLC4A7, SLC4A8, SLC4A9, SLC4A10, SLC4A11)
  5. sodium glucose cotransporter[11]​
    • (SLC5A1, SLC5A2, SLC5A3, SLC5A4, SLC5A5, SLC5A6, SLC5A7, SLC5A8, SLC5A9, SLC5A10, SLC5A11, SLC5A12)
  6. sodium- and chloride-dependent sodium:neurotransmitter symporters[12]​
    • (SLC6A1, SLC6A2, SLC6A3, SLC6A4, SLC6A5, SLC6A6, SLC6A7, SLC6A8, SLC6A9, SLC6A10, SLC6A11, SLC6A12, SLC6A13, SLC6A14, SLC6A15, SLC6A16, SLC6A17, SLC6A18, SLC6A19, SLC6A20)
  7. transportador de aminoácidos catiónicos/asociado a glicoproteína[13]​
  8. Na+/Ca2+ exchanger[14]​
    • (SLC8A1, SLC8A2, SLC8A3)
  9. Na+/H+ exchanger[15]​
    • (SLC9A1, SLC9A2, SLC9A3, SLC9A4, SLC9A5, SLC9A6, SLC9A7, SLC9A8, SLC9A9, SLC9A10, SLC9A11, SLC9B1, SLC9B2)
  10. sodium bile salt cotransport[16]​
    • (SLC10A1, SLC10A2, SLC10A3, SLC10A4, SLC10A5, SLC10A6, SLC10A7)
  11. proton coupled metal ion transporter[17]​
    • (SLC11A1, SLC11A2)
  12. electroneutral cation-Cl cotransporter[18]​
  13. Na+-sulfate/carboxylate cotransporter[19]​
    • (SLC13A1, SLC13A2, SLC13A3, SLC13A4, SLC13A5)
  14. urea transporter[20]​
    • (SLC14A1, SLC14A2)
  15. proton oligopeptide cotransporter[21]​
    • (SLC15A1, SLC15A2, SLC15A3, SLC15A4)
  16. Transportador de monocarboxilato[22]​
    • (SLC16A1, SLC16A2, SLC16A3, SLC16A4, SLC16A5, SLC16A6, SLC16A7, SLC16A8, SLC16A9, SLC16A10, SLC16A11, SLC16A12, SLC16A13, SLC16A14)
  17. vesicular glutamate transporter[23]​
    • (SLC17A1, SLC17A2, SLC17A3, SLC17A4, SLC17A5, SLC17A6, SLC17A7, SLC17A8, SLC17A9)
  18. vesicular amine transporter[24]​
    • (SLC18A1, SLC18A2, SLC18A3)
  19. transportador folato/tiamina[25]​
  20. cotransportador type III Na+-phosphate [26]​
    • (SLC20A1, SLC20A2)
  21. organic anion transporting[27]​
    • subfamilia 1 (SLCO1A2, SLCO1B1, SLCO1B3, SLCO1C1)
    • subfamilia 2 (SLCO2A1, SLCO2B1)
    • subfamilia 3 (SLCO3A1)
    • subfamilia 4 (SLCO4A1, SLCO4C1)
    • subfamilia 5 (SLCO5A1)
    • subfamilia 6 (SLCO6A1)
  22. organic cation/anion/zwitterion transporter[28]​
    • (SLC22A1, SLC22A2, SLC22A3, SLC22A4, SLC22A5, SLC22A6, SLC22A7, SLC22A8, SLC22A9, SLC22A10, SLC22A11, SLC22A12, SLC22A13, SLC22A14, SLC22A15, SLC22A16, SLC22A17, SLC22A18, SLC22A18AS, SLC22A19, SLC22A20, SLC22A23, SLC22A24, SLC22A25, SLC22A31)
  23. Na+-dependent ascorbic acid transporter[29]​
    • (SLC23A1, SLC23A2, SLC23A3, SLC23A4)
  24. Na+/(Ca2+-K+) exchanger[30]​
    • (SLC24A1, SLC24A2, SLC24A3, SLC24A4, SLC24A5, SLC24A6)
  25. mitochondrial carrier[31]​
    • (SLC25A1, SLC25A2, SLC25A3, SLC25A4, SLC25A5, SLC25A6, UCP1(SLC25A7), UCP2(SLC25A8), UCP3(SLC25A9), SLC25A10, SLC25A11, SLC25A12, SLC25A13, SLC25A14, SLC25A15, SLC25A16, SLC25A17, SLC25A18, SLC25A19, SLC25A20, SLC25A21, SLC25A22, SLC25A23, SLC25A24, SLC25A25, SLC25A26, SLC25A27, SLC25A28, SLC25A29, SLC25A30, SLC25A31, SLC25A32, SLC25A33, SLC25A34, SLC25A35, SLC25A36, SLC25A37, SLC25A38, SLC25A39, SLC25A40, SLC25A41, SLC25A42, SLC25A43, SLC25A44, SLC25A45, SLC25A46), SLC25A47, SLC25A48, MTCH1(SLC25A49), MTCH2(SLC25A50), SLC25A51, SLC25A52, SLC25A53
  26. multifunctional anion exchanger[32]​
    • (SLC26A1, SLC26A2, SLC26A3, SLC26A4, SLC26A5, SLC26A6, SLC26A7, SLC26A8, SLC26A9, SLC26A10, SLC26A11)
  27. fatty acid transport proteins[33]​
  28. Na+-coupled nucleoside transport[34]​
    • (SLC28A1, SLC28A2, SLC28A3)
  29. facilitative nucleoside transporter[35]​
    • (SLC29A1, SLC29A2, SLC29A3, SLC29A4)
  30. zinc transporter[36]​
    • (SLC30A1, SLC30A2, SLC30A3, SLC30A4, SLC30A5, SLC30A6, SLC30A7, SLC30A8, SLC30A9, SLC30A10)
  31. Trasnportadores de cobre[37]​
    • (SLC31A1, SLC31A2)
  32. vesicular inhibitory amino acid transporter[38]​
  33. Transportador de Acetil-CoA[39]​
    • (SLC33A1)
  34. type II Na+-phosphate cotransporter[40]​
    • (SLC34A1, SLC34A2, SLC34A3)
  35. nucleotide-sugar transporter[41]​
    • subfamilia A (SLC35A1, SLC35A2, SLC35A3, SLC35A4, SLC35A5)
    • subfamilia B (SLC35B1, SLC35B2, SLC35B3, SLC35B4)
    • subfamilia C (SLC35C1, SLC35C2)
    • subfamilia D (SLC35D1, SLC35D2, SLC35D3)
    • subfamilia E (SLC35E1, SLC35E2A, SLC35E2B, SLC35E3, SLC35E4)
    • subfamilia F (SLC35F1, SLC35F2, SLC35F3, SLC35F4, SLC35F5)
    • subfamilia G (SLC35G1, SLC35G3, SLC35G4, SLC35G5, SLC35G6)
  36. proton-coupled amino acid transporter[42]​
    • (SLC36A1, SLC36A2, SLC36A3, SLC36A4)
  37. sugar-phosphate/phosphate exchanger[43]​
    • (SLC37A1, SLC37A2, SLC37A3, SLC37A4)
  38. System A & N, sodium-coupled neutral amino acid transporter[44]​
    • (SLC38A1, SLC38A2, SLC38A3, SLC38A4, SLC38A5, SLC38A6, SLC38A7, SLC38A8, SLC38A9, SLC38A10, SLC38A11)
  39. metal ion transporter[45]​
    • (SLC39A1, SLC39A2, SLC39A3, SLC39A4, SLC39A5, SLC39A6, SLC39A7, SLC39A8, SLC39A9, SLC39A10, SLC39A11, SLC39A12, SLC39A13, SLC39A14)
  40. basolateral iron transporter[46]​
    • (SLC40A1)
  41. MgtE-like magnesium transporter
    • (SLC41A1, SLC41A2, SLC41A3)
  42. Ammonia transporter[47]​[48]​
  43. Na+-independent, system-L like amino acid transporter
    • (SLC43A1, SLC43A2, SLC43A3)
  44. Choline-like transporter
    • (SLC44A1, SLC44A2, SLC44A3, SLC44A4, SLC44A5)
  45. Putative sugar transporter
    • (SLC45A1, SLC45A2, SLC45A3, SLC45A4)
  46. Folate transporter
    • (SLC46A1, SLC46A2, SLC46A3)
  47. multidrug and toxin extrusion
    • (SLC47A1, SLC47A2)
  48. Heme transporter family
    • (SLC48A1)
  49. Heme transporter
    • (FLVCR1(SLC49A1), FLVCR2(SLC49A2), SLC49A3, SLC49A4)
  50. Sugar efflux transporters of the SWEET family
    • (SLC50A1)
  51. Transporters of steroid-derived molecules
    • (SLC51A, SLC51B)
  52. Riboflavin transporter family RFVT/SLC52
    • (SLC52A1, SLC52A2, SLC52A3)
  53. portadores de fosfato
    • (XPR1(SLC53A1)
  54. Portadores de piruvato mitocondrial
    • (MPC1(SLC54A1), MPC2(SLC54A2), MPC1L(SLC54A3))
  55. Mitochondrial cation/proton exchangers
    • (LETM1(SLC54A1), LETM2(SLC54A2), LETMD1(SLC54A3))
  56. Sideroflexinas
    • (SFXN1(SLC56A1), SFXN2(SLC56A2), SFXN3(SLC56A3), SFXN4(SLC56A4), SFXN5(SLC56A5))
  57. Familia de transportadores de magnesio tipo NiPA
    • (NIPA1(SLC57A1), NIPA2(SLC57A2), NIPAL1(SLC57A3), NIPAL2(SLC57A4), NIPAL3(SLC57A5), NIPAL4(SLC57A6))
  58. Familia de transportadores de magnesio tipo MagT
    • (MAGT1(SLC58A1), TUSC3(SLC58A2))
  59. Familia de simportadores de lisofosfatidilcolina dependientes de sodio
    • (MFSD2A(SLC59A1), MFSD2B(SLC59A2))
  60. Transportadores de glucosa
    • (MFSD4A(SLC60A1), MFSD4B(SLC60A2))
  61. Familia de transportadores de molibdato
    • (MFSD5(SLC61A1))
  62. Transportadores de pirofosfato
    • (ANKH(SLC62A1))
  63. Transportadores de esfingosina-fosfato
    • (SPNS1(SLC63A1), SPNS2(SLC63A2), SPNS3(SLC63A3))
  64. Intercambiadores Golgi Ca2+/H+
    • (TMEM165(SLC64A1))
  65. Transportadores de colesterol tipo NPC
  66. Exportadores de aminoácidos catiónicos
    • (SLC66A1, SLC66A2, SLC66A3, CTNS(SLC66A4), MPDU(SLC66A5))

SLC putativos

Los SLC putativos, también llamados SLC atípicos, son proteínas transportadoras facilitadoras o activas secundarias novedosas y plausibles que comparten antecedentes ancestrales con los SLC conocidos. [2]​ [49]​ Sin embargo, los SLC atípicos de tipo MFS pueden subdividirse en 15 familias putativas de transportadores MFS (AMTF). [49]​

Todos los SLC putativos son transportadores SLC plausibles. Algunos son solo "atípicos" cuando se trata de su nomenclatura; los genes tienen una asignación de SLC pero como un alias, y han conservado su símbolo de gen "no SLC" ya asignado como el símbolo aprobado.

Aquí se enumeran algunos SLC putativos: OCA2, CLN3, TMEM104, SPNS1, SPNS2, SPNS3, SV2A, SV2B, SV2C, SVOP, SVOPL, MFSD1, [50]​ MFSD2A, MFSD2B, MFSD3, [50]​ MFSD4A, [51]​ MFSD4B, MFSD5, [52]​ MFSD6, MFSD6L, MFSD8, MFSD9, [51]​ MFSD10, MFSD11, [52]​ MFSD12, MFSD13A, MFSD14A, [53]​ MFSD14B, [53]​ UNC93A [54]​ [55]​ y UNC93B1.

Referencias

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