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David Baker (bioquímico)

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David Baker

David Baker en 2013
Información personal
Nacimiento 6 de octubre de 1962 Ver y modificar los datos en Wikidata (62 años)
Seattle (Estados Unidos) Ver y modificar los datos en Wikidata
Nacionalidad Estadounidense
Familia
Cónyuge Hannele Ruohola-Baker Ver y modificar los datos en Wikidata
Educación
Educado en
Supervisor doctoral Randy Schekman Ver y modificar los datos en Wikidata
Información profesional
Ocupación Bioinformático, bioquímico, profesor universitario, académico, biólogo computacional y biochemistry teacher Ver y modificar los datos en Wikidata
Área Biología computacional, ingeniería molecular y protein design Ver y modificar los datos en Wikidata
Empleador
Miembro de
Sitio web sites.uw.edu/biochemistry/faculty/david-baker y www.bakerlab.org Ver y modificar los datos en Wikidata
Distinciones
  • Miembro de la Academia Estadounidense de las Artes y las Ciencias
  • Packard Fellowship for Science and Engineering (1994)
  • Overton Prize (2001)
  • Feynman Prize in Nanotechnology (2004)
  • Premio Nobel de Química (2024) Ver y modificar los datos en Wikidata
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David Baker (Seattle, Washington; 6 de octubre de 1962 [1]​) es un bioquímico y biólogo computacional estadounidense, conocido por ser pionero en métodos para diseñar proteínas y predecir sus estructuras tridimensionales. Actualmente, ocupa la cátedra de Bioquímica "Henrietta y Aubrey Davis" y es investigador del Instituto Médico Howard Hughes. Además, es profesor adjunto de ciencias genómicas, bioingeniería, ingeniería química, informática y física en la Universidad de Washington. En 2024, fue galardonado con el Premio Nobel de Química en 2024 por sus contribuciones al diseño computacional de proteínas junto a Demis Hassabis y John Jumper. [2]​ [3]​

Baker es miembro de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos y director del Instituto de Diseño de Proteínas de la Universidad de Washington. [4]​ Ha cofundado más de una docena de empresas de biotecnología y fue incluido en la lista de la revista Time que reúne a las 100 personas más influyentes en el ámbito de la salud en 2024. [5]​

Biografía

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Baker nació en Seattle, Washington, en una familia judía el 6 de octubre de 1962. Obtuvo su licenciatura en la Universidad de Harvard en 1984. Completó su doctorado en bioquímica en la Universidad de California, Berkeley, en 1989 en el laboratorio de Randy Schekman, donde trabajó en el transporte y tráfico de proteínas en levaduras. En 1993, completó su formación postdoctoral en biofísica con David Agard en la Universidad de California, San Francisco .

Baker se unió al Departamento de Bioquímica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington como profesor en 1993. Se convirtió en investigador del Instituto Médico Howard Hughes en 2000. [6]​ Baker fue elegido miembro de la Academia Estadounidense de las Artes y las Ciencias en 2009. [7]​ Está casado con Hannele Ruohola-Baker, otra bioquímica de la misma universidad. Tienen dos hijos.

Investigación

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Aunque es conocido principalmente por el desarrollo de métodos computacionales para predecir y diseñar estructuras y funciones de las proteínas, Baker mantiene un activo grupo de bioquímica experimental. [8]​ Es autor de más de 600 artículos científicos.

El grupo de Baker desarrolló el algoritmo Rosetta para la predicción de la estructura de proteínas ab initio, que se ha convertido en una herramienta para el diseño de proteínas, un proyecto de computación distribuida llamado Rosetta@Home, [9]​ [10]​ [11]​ y el juego de computadora Foldit . [12]​ [13]​ [14]​ Baker dirigió Rosetta Commons, un consorcio de laboratorios e investigadores que desarrollan software de predicción y diseño de estructuras biomoleculares. El grupo de Baker ha competido regularmente en el concurso de predicción de estructura CASP, especializándose en métodos ab initio, incluidas variantes asistidas manualmente y automatizadas del protocolo Rosetta. [15]​ [16]​

El grupo de Baker también es muy activo en el campo del diseño de proteínas, [17]​ [18]​ y es conocido por diseñar Top7, la primera proteína artificial con un nuevo pliegue. [19]​

Baker ha cofundado varias empresas de biotecnología, entre ellas Prospect Genomics, que fue adquirida por una subsidiaria de Eli Lilly en 2001, [20]​ Icosavax, que fue adquirida por AstraZeneca en 2023, [21]​ Sana Biotechnology, Lyell Immunotherapeutics y Xaira Therapeutics.

Premios

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Por su trabajo en plegamiento de proteínas, Baker ha recibido varios premios, entre ellos, el Premio Overton (2002), [22]​ el Premio Internacional Sackler de Biofísica (2008), [23]​ el Premio Wiley (2022) [24]​ y el Premio Fundación BBVA Fronteras del Conocimiento en la categoría "Biología y Biomedicina" (2022) [25]​

Por su trabajo en el diseño de proteínas, Baker recibió el Premio Newcomb Cleveland (2004), [26]​ el Premio Feynman en Nanotecnología (2004), [27]​ y el Premio Breakthrough en Ciencias de la Vida (2021). [28]​

En 2024, Baker recibió el Premio Nobel de Química. [29]​ [30]​

Referencias

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  1. ↑ Howes, Laura. «Protein wrangler, serial entrepreneur, and community builder». Chemical & Engineering News 97 (30). 
  2. ↑ «The Nobel Prize in Chemistry 2024». Nobel Media AB. Archivado desde el original el 9 de octubre de 2024. Consultado el 9 de octubre de 2024. 
  3. ↑ «Press release: The Nobel Prize in Chemistry 2024». NobelPrize.org (en inglés estadounidense). Archivado desde el original el 9 de octubre de 2024. Consultado el 9 de octubre de 2024. 
  4. ↑ «UW to Establish Institute for Protein Design» (en inglés estadounidense). University of Washington. Archivado desde el original el 15 de enero de 2019. Consultado el 14 de enero de 2019. 
  5. ↑ Henshall, Will (2 de mayo de 2024). «David Baker». Time (en inglés). Time Magazine. Archivado desde el original el 9 de octubre de 2024. Consultado el 30 de septiembre de 2024. 
  6. ↑ «David Baker, PhD». hhmi.org (en inglés). Howard Hughes Medical Institute. Consultado el 30 de septiembre de 2024. 
  7. ↑ «Book of Members, 1780-2010: Chapter B». American Academy of Arts and Sciences. Archivado desde el original el 8 de julio de 2018. Consultado el 5 de mayo de 2011. 
  8. ↑ Howes, Laura. «Protein wrangler, serial entrepreneur, and community builder». Chemical & Engineering News 97 (30). 
  9. ↑ Howes, Laura. «Protein wrangler, serial entrepreneur, and community builder». Chemical & Engineering News 97 (30). 
  10. ↑ Castillo, Oscar; Melin, Patricia, eds. (2018). Fuzzy Logic Augmentation of Neural and Optimization Algorithms: Theoretical Aspects and Real Applications. Springer. p. 455. ISBN 9783319710075. Consultado el 2 de agosto de 2018. 
  11. ↑ Bonneau, Richard; Ruczinski, Ingo; Tsai, Jerry; Baker, David (August 2002). «Contact order and ab initio protein structure prediction». Protein Science 11 (8): 1937-1944. PMC 2373674. PMID 12142448. doi:10.1110/ps.3790102. 
  12. ↑ Hand, E. (2010). «Citizen science: People power». Nature 466 (7307): 685-687. PMID 20686547. doi:10.1038/466685a. 
  13. ↑ Cooper, S.; Khatib, F.; Treuille, A.; Barbero, J.; Lee, J.; Beenen, M.; Leaver-Fay, A.; Baker, D. et al. (2010). «Predicting protein structures with a multiplayer online game». Nature 466 (7307): 756-760. Bibcode:2010Natur.466..756C. PMC 2956414. PMID 20686574. doi:10.1038/nature09304. 
  14. ↑ Marshall, Jessica (22 de enero de 2012). «Victory for crowdsourced biomolecule design». Nature Publishing Group. Archivado desde el original el 4 de febrero de 2024. Consultado el 30 de septiembre de 2024. 
  15. ↑ Dimaio, F.; Terwilliger, T. C.; Read, R. J.; Wlodawer, A.; Oberdorfer, G.; Wagner, U.; Valkov, E.; Alon, A. et al. (2011). «Improved molecular replacement by density- and energy-guided protein structure optimization». Nature 473 (7348): 540-3. Bibcode:2011Natur.473..540D. PMC 3365536. PMID 21532589. doi:10.1038/nature09964. 
  16. ↑ Qian, B.; Raman, S.; Das, R.; Bradley, P.; McCoy, A. J.; Read, R. J.; Baker, D. (2007). «High-resolution structure prediction and the crystallographic phase problem». Nature 450 (7167): 259-64. Bibcode:2007Natur.450..259Q. PMC 2504711. PMID 17934447. doi:10.1038/nature06249. 
  17. ↑ Howes, Laura. «Protein wrangler, serial entrepreneur, and community builder». Chemical & Engineering News 97 (30). 
  18. ↑ Zimmer, Carl (26 de diciembre de 2017). «Scientists Are Designing Artisanal Proteins for Your Body». The New York Times. Archivado desde el original el 2 de agosto de 2018. Consultado el 2 de agosto de 2018. 
  19. ↑ Kuhlman, Brian; Dantas, Gautam; Ireton, Gregory C.; Varani, Gabriele; Stoddard, Barry L.; Baker, David (21 de noviembre de 2003). «Design of a Novel Globular Protein Fold with Atomic-Level Accuracy». Science 302 (5649): 1364-1368. Bibcode:2003Sci...302.1364K. PMID 14631033. doi:10.1126/science.1089427. 
  20. ↑ Hamilton, David (2001). «Structural GenomiX to Acquire Research Firm Prospect Genomics». Archivado desde el original el 9 de octubre de 2024. Consultado el 15 de septiembre de 2024. 
  21. ↑ Soper, Taylor (12 de diciembre de 2023). «AstraZeneca will pay up to $1.1B to acquire Icosavax, a Univ. of Washington biotech spinout». GeekWire. Archivado desde el original el 15 de julio de 2024. Consultado el 1 de octubre de 2024. 
  22. ↑ «2002 Overton Prize Winner - David Baker». iscb.org. International Society for Computational Biology. Consultado el 30 de septiembre de 2024. 
  23. ↑ Leila Gray (24 de noviembre de 2008). «University of Washington biochemist David Baker to receive 2008 Sackler International Prize in Biophysics for discoveries in protein folding». University of Washington. Consultado el 29 de abril de 2013. 
  24. ↑ «The Wiley Prize in Biomedical Sciences». wiley.com. Archivado desde el original el 14 de marzo de 2023. Consultado el 30 de septiembre de 2024. 
  25. ↑ «BBVA Foundation Frontiers of Knowledge Award 2022». Archivado desde el original el 21 de septiembre de 2021. Consultado el 25 de enero de 2023. 
  26. ↑ «Newcomb Cleveland Prize Recipients». aaas.org. Archivado desde el original el 11 de diciembre de 2023. Consultado el 30 de septiembre de 2024. 
  27. ↑ «Winners of the 2004 Feynman Prizes in Nanotechnology». foresight.org. Archivado desde el original el 9 de octubre de 2024. Consultado el 30 de septiembre de 2024. 
  28. ↑ «Breakthrough Prize – Winners Of The 2021 Breakthrough Prizes In Life Sciences, Fundamental Physics And Mathematics Announced». breakthroughprize.org. Archivado desde el original el 26 de enero de 2021. Consultado el 13 de diciembre de 2021. 
  29. ↑ «The Nobel Prize in Chemistry 2024». Nobel Media AB. Archivado desde el original el 9 de octubre de 2024. Consultado el 9 de octubre de 2024. 
  30. ↑ «Press release: The Nobel Prize in Chemistry 2024». NobelPrize.org (en inglés estadounidense). Archivado desde el original el 9 de octubre de 2024. Consultado el 9 de octubre de 2024. 
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