Las Elecciones estatales de Chiapas de 2006 se llevaron a cabo el domingo 20 de agosto de 2006, y en ellas fue renovado el titular del siguiente cargo de elección popular en el estado de Chiapas:
Gobernador de Chiapas. Titular del Poder Ejecutivo del estado, electo para un periodo de seis años no reelegibles en ningún caso. El candidato electo fue Juan Sabines Guerrero.
Ocho partidos políticos con registro en Chiapas estuvieron en posibilidades de participar en las elecciones, los candidatos registrados a Gobernador del Estado fueron:
Al cierre del Programa de Resultados Electorales Preliminares (PREP) la diferencia a favor de Juan Sabines Guerrero sobre José Antonio Aguilar Bodegas era de 0.22%, registrándose un porcentaje de 48.39% para Sabines y de 48.17% para Aguilar Bodegas, ambos se han declarado ganadores sobre la base de cifras propias, Aguilar Bodegas ha anunciado que impugnará la elección y Sabines se ha manifestado dispuesto a un recuento de votos [3].
El total de votos emitidos fue 1177710. Los votos nulos fueron 36570 y por candidatos no registrados 1519.
↑ abEl 10 de agosto de 2006 los candidatos del PAN y de Nueva Alianza declinaron en favor del candidato priista José Antonio Aguilar Bodegas al acusar al gobernador Pablo Salazar Mendiguchía de apoyar a Juan Sabines Guerreros.