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Secretoma

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El secretoma es el conjunto de proteínas, consecuencia de la expresión génica de un organismo, que es secretado al espacio extracelular. En humanos, este subconjunto del proteoma abarca un 13-20% de todas las proteínas, incluyendo citoquinas, factores de crecimiento, matrices extracelulares proteínas y reguladoras, y receptores de cabaña.

El secretoma de un tejido concreto puede ser medido por espectrometría de masa y su análisis constituye un tipo de proteómica conocida como secretómica.

Etimología

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El término secretoma fue acuñado por Tjalsma y otros en 2004 para indicar todos los factores que constituyen la vía secretoria de una célula.[1]​ En 2010, esta definición del secretoma fue revisada para incluir solo proteínas segregadas al espacio extracelular.[2]​ Conceptos relacionados incluyen el matrisoma, el cual es el subconjunto del secretoma que incluye proteínas de matrices extracelulares y sus proteínas asociadas;[3]​ el receptoma, el cual incluye todos receptores de membrana,[4]​ y el adenoma, el cual incluye todas las proteínas implicadas en adhesión de células.[5]​[6]​

Ómica es un neologismo que en Biología Molecular se utiliza como sufijo para referirse al estudio de la totalidad o del conjunto de algo, como proteínas: proteomica o secretomica.

Cuantificación

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Las proteínas segregadas en humanos forman el 13–20% del proteoma entero e incluyen factores de crecimiento, quimiocinas, citoquinas, moléculas de adhesión, proteasas y receptores de cabaña.[2]​ Genes de proteína humanos (39%, 19613 genes[7]​) están pronosticados para tener tanto un péptido de señal y por lo menos una región transmembranal que sugiere un activo transporte de la proteína correspondiente fuera de la célula (secreción) o localizar uno de los numerosos sistemas de membrana en la célula.[8]​ Hay una variedad vasta de metodologías disponibles para estudiar secretomas de células vegetales, células animales, células madre y células cancerígenas.[9]​

Véase también

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Referencias

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  1. ↑ Tjalsma, H.; Antelmann, H.; Jongbloed, J.D.H.; Braun, P. G.; Darmon, E.; Dorenbos, R.; Dubois, J.-Y.F.; Westers, H. et al. (8 de junio de 2004). «Proteomics of Protein Secretion by Bacillus subtilis: Separating the "Secrets" of the Secretome». Microbiology and Molecular Biology Reviews 68 (2): 207-233. PMC 419921. PMID 15187182. doi:10.1128/MMBR.68.2.207-233.2004. 
  2. ↑ a b Agrawal GK.; Jwa NS.; Lebrun MH.; Job D.; Rakwal R. (February 2010). «Plant secretome: unlocking secrets of the secreted proteins». Proteomics 10 (4): 799-827. PMID 19953550. doi:10.1002/pmic.200900514. 
  3. ↑ Hynes, R. O.; Naba, A. (21 de septiembre de 2011). «Overview of the Matrisome--An Inventory of Extracellular Matrix Constituents and Functions». Cold Spring Harbor Perspectives in Biology 4 (1): a004903. PMC 3249625. PMID 21937732. doi:10.1101/cshperspect.a004903. 
  4. ↑ Ben-Shlomo, I.; Yu Hsu, S.; Rauch, R.; Kowalski, H. W.; Hsueh, A. J. W. (17 de junio de 2003). «Signaling Receptome: A Genomic and Evolutionary Perspective of Plasma Membrane Receptors Involved in Signal Transduction». Science Signaling 2003 (187): re9. PMID 12815191. doi:10.1126/stke.2003.187.re9. 
  5. ↑ Zaidel-Bar, Ronen; Itzkovitz, Shalev; Ma'ayan, Avi; Iyengar, Ravi; Geiger, Benjamin (August 2007). «Functional atlas of the integrin adhesome». Nature Cell Biology 9 (8): 858-867. PMC 2735470. PMID 17671451. doi:10.1038/ncb0807-858. 
  6. ↑ Horton, Edward R.; Byron, Adam; Askari, Janet A.; Ng, Daniel H. J.; Millon-Frémillon, Angélique; Robertson, Joseph; Koper, Ewa J.; Paul, Nikki R. et al. (19 de octubre de 2015). «Definition of a consensus integrin adhesome and its dynamics during adhesion complex assembly and disassembly». Nature Cell Biology 17 (12): 1577-1587. PMC 4663675. PMID 26479319. doi:10.1038/ncb3257. 
  7. ↑ «Proteomics. Tissue-based map of the human proteome». Science 347 (6220): 1260419. January 2015. PMID 25613900. doi:10.1126/science.1260419. 
  8. ↑ «Extracellular vesicle isolation and characterization: toward clinical application». The Journal of Clinical Investigation 126 (4): 1152-62. April 2016. PMC 4811150. PMID 27035807. doi:10.1172/JCI81129. 
  9. ↑ «Methodologies to decipher the cell secretome». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1834 (11): 2226-32. November 2013. PMC 3652893. PMID 23376189. doi:10.1016/j.bbapap.2013.01.022. 

Enlaces externos

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