Ir al contenido

Genética neandertal

De Wikipedia, la enciclopedia libre
Esta es una versión antigua de esta página, editada a las 19:17 15 oct 2022 por BenjaBot (discusión · contribs.). La dirección URL es un enlace permanente a esta versión, que puede ser diferente de la versión actual.
Genética humana
Subtemas
[editar datos en Wikidata]
Archivo:Reconstruction of Neanderthal woman.jpg
Reconstrucción de una mujer neandertal[1]​

Los estudios genéticos sobre el ADN antiguo de los neandertales se hicieron posibles a fines de la década de 1990.[2]​ El proyecto del genoma neandertal, establecido en 2006, presentó el primer genoma neandertal completamente secuenciado en 2013. Desde 2005, se ha acumulado evidencia de una mezcla sustancial de ADN de los neandertales en las poblaciones modernas.[3]​ El tiempo de divergencia entre el neandertal y los linajes humanos modernos se estima entre 750.000 y 400.000 años atrás.[4]​[5]​[6]​

El 3 de julio de 2020, los científicos informaron haber descubierto que un importante factor de riesgo genético del virus Covid-19 fue heredado de los neandertales arcaicos hace 60.000 años.[7]​[8]​[9]​ Se estima que el 16% de las personas en Europa y el 50% de las personas en el sur de Asia tienen la secuencia particular en el cromosoma III,[10]​ y el 63% de los bangladesíes tienen estas secuencias genéticas. Los africanos, los habitantes del Medio Oriente y los asiáticos del este presentan la presencia del cromosoma en cantidades muy insignificantes.[11]​

Secuenciación del genoma

En 2006, el Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva y 454 Ciencias de la Vida anunciaron que secuenciarían el genoma neandertal durante los próximos dos años. Se esperaba que la comparación expandiera la comprensión de los neandertales, así como la evolución de los humanos y el cerebro humano.[12]​

En 2008, un equipo del Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva en Leipzig, Alemania, publicó la secuencia completa del ADN mitocondrial de los neandertales (ADNmt) y sugirió que "los neandertales tenían un tamaño de población efectivo a largo plazo más pequeño que el de los humanos modernos".[13]​ En la misma publicación, se reveló que "la contaminación era de hecho un problema", y finalmente se dieron cuenta de que el 11% de su muestra era ADN humano moderno.[14]​[15]​ Desde entonces, se ha realizado más trabajo de preparación en áreas limpias y se han agregado 'etiquetas' de 4 pares de bases al ADN tan pronto como se extrae para que se pueda identificar el ADN neandertal.

Genetista del Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva extrayendo ADN antiguo (fotografía de 2005)

El proyecto primero secuenció el genoma completo de un neandertal en 2013 extrayéndolo del hueso de la falange de un neandertal siberiano de 50.000 años.[16]​ Entre los genes que muestran diferencias entre los humanos actuales y los neandertales se encuentran RPTN, SPAG17, CAN15, TTF1 y PCD16.[17]​ Se ha construido un mapa de visualización del humano moderno de referencia que contiene las regiones del genoma con alto grado de similitud o con novedad según un neandertal de hace 50 mil años.[16]​[18]​

Mestizaje con humanos anatómicamente modernos

Los investigadores abordaron la cuestión del posible mestizaje entre los neandertales y los humanos anatómicamente modernos (AMH) a partir de los primeros estudios arqueogenéticos de la década de 1990. En 2006, aún no se había encontrado evidencia de mestizaje. En 2009, se informó que el análisis de aproximadamente un tercio del genoma completo del individuo de Altái todavía no mostraba "signos de mezcla". La variante de microcefalina común fuera de África, que se sugirió  sea de origen neandertal y responsable del rápido crecimiento del cerebro en humanos, no se encontró en los neandertales. Tampoco lo era una variante MAPT muy antigua que se encuentra principalmente en europeos.[14]​

La evidencia positiva de la mezcla se publicó por primera vez en mayo de 2010.[17]​ El material genético heredado de los neandertales se encuentra en todas las poblaciones no africanas y se informó inicialmente que comprendía entre el 1 y el 4 por ciento del genoma. Esta fracción se refinó posteriormente a un 1,5 a un 2,1 por ciento.[16]​

Se estima que el 20 por ciento del ADN neandertal sobrevive actualmente en los humanos modernos.[19]​ Los genes humanos modernos involucrados en la producción de queratina, una proteína que constituye la piel, el cabello y las uñas, tienen niveles especialmente altos de introgresión. Por ejemplo, los genes de aproximadamente el 66% de los asiáticos orientales contienen una variante POUF23L introgresada de los neandertales, mientras que el 70% de los europeos poseen un alelo introgresado de BNC2. Las variantes neandertales afectan el riesgo de desarrollar varias enfermedades, como lupus, cirrosis biliar, enfermedad de Crohn, diabetes tipo 2 y COVID-19 grave.[7]​[20]​ El alelo de MC1R que originalmente estaba vinculado  al pelo rojo en los neandertales no se encuentra en los europeos, pero está presente en los aborígenes taiwaneses con una frecuencia del 70% y con una frecuencia moderadamente alta en otras poblaciones de Asia oriental; por lo tanto, en realidad no hay evidencia de que los neandertales tuvieran el pelo rojo.[21]​ Un estudio de 2010 todavía no podía descartar de manera concluyente un escenario alternativo, en el que la población de origen de humanos modernos no africanos ya estaba más estrechamente relacionada con los neandertales que otros africanos, debido a la antigüedad de las divisiones genéticas dentro de África.[17]​[22]​

Reconstrucción del cráneo de Neanderthal Le Moustier, Neues Museum de Berlín[23]​

La investigación desde 2010 ha refinado la imagen del mestizaje entre neandertales, denisovanos y humanos anatómicamente modernos. El mestizaje parece haber ocurrido de forma asimétrica entre los antepasados de los humanos de hoy en día, y esto puede explicar las diferentes frecuencias de ADN específico de Neanderthal en los genomas de los humanos modernos. Se ha concluido que la cantidad relativamente mayor de ADN específico de neandertal en los genomas de los individuos de ascendencia asiática oriental (en comparación con los de ascendencia europea) no puede explicarse por diferencias en la selección.[24]​ Sugiriendo dos modelos demográficos adicionales, que implican un segundo pulso del flujo de genes neandertales en los antepasados de los asiáticos orientales o una dilución de los linajes neandertales en los europeos por mezcla con una población ancestral desconocida.

Se ha planteado la hipótesis de que la mayor proporción de ascendencia neandertal en los asiáticos orientales que en los europeos se debe al hecho de que la selección purificadora es menos eficaz para eliminar los alelos neandertales débilmente dañinos de las poblaciones asiáticas orientales. Utilizando simulaciones de una amplia gama de modelos de selección y demografía, hemos demostrado que esta hipótesis no puede explicar la mayor proporción de ascendencia neandertal en los asiáticos orientales que en los europeos. En cambio, se requieren escenarios demográficos más complejos, que probablemente involucren múltiples pulsos de mezcla neandertal, para explicar los datos.[25]​

Una colaboración entre Alemania, Rusia y China, compiló un genoma neandertal de consenso basado en el genoma del individuo de Altái y de tres individuos de Vindjia. Esto se comparó con un genoma consensuado de chimpancé como grupo externo y con el genoma de once poblaciones modernas (tres africanas, tres de Asia oriental, tres europeas). Más allá de confirmar la similitud significativamente mayor con el genoma neandertal en no africanos que en africanos, el estudio también encontró una diferencia en la distribución de sitios derivados del neandertal entre europeos y asiáticos orientales, lo que sugiere presiones evolutivas recientes. Las poblaciones asiáticas mostraron agrupaciones en grupos funcionales relacionados con las vías inmunes y hematopoyéticas, mientras que las europeas mostraron agrupaciones en grupos funcionales relacionados con el proceso catabólico lipídico.[26]​

Se ha presentado evidencia de la mezcla de AMH con los neandertales hace aproximadamente 100.000 años.[27]​

Episodios de mestizaje

Ha habido al menos tres episodios de mestizaje. El primero habría ocurrido poco después de que algunos humanos modernos abandonaran África. El segundo habría ocurrido después de que los ancestrales melanesios se hubieran separado; estas personas parecen haberse cruzado a partir de entonces con los denisovanos. El tercero habría involucrado a los neandertales y los antepasados de los asiáticos orientales únicamente.[28]​[29]​[30]​

Un estudio de 2016 presentó evidencia de que los machos neandertales podrían no haber tenido descendencia masculina viable con hembras AMH. Esto podría explicar por qué hasta la fecha no se ha encontrado ningún hombre moderno con un cromosoma Y neandertal.[31]​

Un estudio de 2018 concluyó que el mestizaje entre neandertales y humanos modernos condujo inicialmente a la exposición de cada especie a virus desconocidos. Más tarde, el intercambio de genes también otorgó resistencia a esos virus.[32]​

Epigenética

En 2014 se reconstruyeron mapas completos de metilación del ADN de individuos de neandertal y denisovano.[33]​ La actividad diferencial de los genes del grupo HOX se encuentra detrás de muchas de las diferencias anatómicas entre los neandertales y los humanos modernos, especialmente en lo que respecta a la morfología de las extremidades. En general, los neandertales poseían extremidades más cortas con huesos curvos.[34]​

Véase también

Referencias

  1. ↑ «Cro-Magnons Conquered Europe, but Left Neanderthals Alone». PLOS Biology (en inglés) 2 (12): e449. 30 de noviembre de 2004. ISSN 1545-7885. PMC 532398. doi:10.1371/journal.pbio.0020449. 
  2. ↑ Ovchinnikov, Igor V.; Götherström, Anders; Romanova, Galina P.; Kharitonov, Vitaliy M.; Lidén, Kerstin; Goodwin, William (2000). «Molecular analysis of Neanderthal DNA from the northern Caucasus». Nature 404 (6777): 490-93. Bibcode:2000Natur.404..490O. ISSN 0028-0836. PMID 10761915. doi:10.1038/35006625. 
  3. ↑ Sánchez-Quinto, F; Botigué, LR; Civit, S; Arenas, C; Avila-Arcos, MC; Bustamante, CD; Comas, D; Lalueza-Fox, C (17 de octubre de 2012). «North African Populations Carry the Signature of Admixture with Neandertals». PLOS ONE 7 (10): e47765. Bibcode:2012PLoSO...747765S. PMC 3474783. PMID 23082212. doi:10.1371/journal.pone.0047765.  Fu, Q; Li, H; Moorjani, P; Jay, F; Slepchenko, SM; Bondarev, AA; Johnson, PL; Aximu-Petri, A et al. (23 de octubre de 2014). «Genome sequence of a 45,000-year-old modern human from western Siberia». Nature 514 (7523): 445-49. Bibcode:2014Natur.514..445F. PMC 4753769. PMID 25341783. doi:10.1038/nature13810.  Brahic, Catherine. "Humanity's forgotten return to Africa revealed in DNA", The New Scientist (February 3, 2014).
  4. ↑ 410–440 ka P. Endicott; S.Y.W. Ho; C. Stringer (2010). «Using genetic evidence to evaluate four palaeoanthropological hypotheses for the timing of Neanderthal and modern human origins». Journal of Human Evolution 59 (1): 87-95. PMID 20510437. doi:10.1016/j.jhevol.2010.04.005. Archivado desde el original el 10 de septiembre de 2017. 
  5. ↑ 295–498 ka. A. Rieux (2014). «Improved calibration of the human mitochondrial clock using ancient genomes». Molecular Biology and Evolution 31 (10): 2780-92. PMC 4166928. PMID 25100861. doi:10.1093/molbev/msu222. 
  6. ↑ Rogers, AR; Bohlender, RJ; Huff, CD (2017). «Early history of Neanderthals and Denisovans». Proc Natl Acad Sci U S A 114 (37): 9859-9863. PMC 5604018. PMID 28784789. doi:10.1073/PNAS.1706426114. ; see also: Jordana Cepelewicz, Genetics Spills Secrets From Neanderthals' Lost History, Quanta Magazine, 18 September 2017. "The dating of that schism between the Neanderthals and the Denisovans is surprising because previous research had pegged it as much more recent: a 2016 study, for instance, set it at only 450,000 years ago. An earlier separation means we should expect to find many more fossils of both eventually. It also changes the interpretation of some fossils that have been found. Take the large-brained hominid bones belonging to a species called Homo heidelbergensis, which lived in Europe and Asia around 600,000 years ago. Paleoanthropologists have disagreed about how they relate to other human groups, some positing they were ancestors of both modern humans and Neanderthals, others that they were a nonancestral species replaced by the Neanderthals, who spread across Europe."
  7. ↑ a b Zimmer, Carl (4 de julio de 2020). «DNA Linked to Covid-19 Was Inherited From Neanderthals, Study Finds - The stretch of six genes seems to increase the risk of severe illness from the coronavirus.». Consultado el 5 de julio de 2020. 
  8. ↑ Zeberg, Hugo; Pääbo, Svante (3 de julio de 2020). «The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neandertals». bioRxiv. doi:10.1101/2020.07.03.186296. Consultado el 5 de julio de 2020. 
  9. ↑ «Neanderthal genes may be liability for Covid19 patients». Fairfax_AP. 1 de octubre de 2020. 
  10. ↑ Zeberg, Hugo; Pääbo, Svante (30 de septiembre de 2020). «The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neandertals». Nature 587 (7835): 610-612. PMID 32998156. doi:10.1038/s41586-020-2818-3. «[...] the risk is conferred by a genomic segment of around 50 kilobases in size that is inherited from Neanderthals and is carried by around 50% of people in south Asia and around 16% of people in Europe.» 
  11. ↑ Sample, Ian (30 de septiembre de 2020). «Neanderthal genes increase risk of serious Covid-19, study claims» (en inglés británico). ISSN 0261-3077. Consultado el 30 de septiembre de 2020. 
  12. ↑ Moulson, Geir (20 de julio de 2006). «Neanderthal genome project launches». NBC News. Consultado el 22 de agosto de 2006. 
  13. ↑ Green, RE; Malaspinas, AS; Krause, J; Briggs, Aw; Johnson, PL; Uhler, C; Meyer, M; Good, JM et al. (2008). «A complete Neandertal mitochondrial genome sequence determined by high-throughput sequencing». Cell 134 (3): 416-26. PMC 2602844. PMID 18692465. doi:10.1016/j.cell.2008.06.021. 
  14. ↑ a b Elizabeth Pennisi (2009). «Tales of a Prehistoric Human Genome». Science 323 (5916): 866-71. PMID 19213888. doi:10.1126/science.323.5916.866. 
  15. ↑ «The Neandertal genome and ancient DNA authenticity». EMBO J. 28 (17): 2494-502. 2009. PMC 2725275. PMID 19661919. doi:10.1038/emboj.2009.222. 
  16. ↑ a b c K. Prüfer (2014). «The complete genome sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains». Nature 505 (7481): 43-49. Bibcode:2014Natur.505...43P. PMC 4031459. PMID 24352235. doi:10.1038/nature12886. 
  17. ↑ a b c Green, Richard E.; Krause, Johannes; Briggs, Adrian W.; Maricic, Tomislav; Stenzel, Udo; Kircher, Martin; Patterson, Nick; Li, Heng et al. (2010). «A Draft Sequence of the Neandertal Genome». Science 328 (5979): 710-22. Bibcode:2010Sci...328..710G. PMC 5100745. PMID 20448178. doi:10.1126/science.1188021. 
  18. ↑ Pratas, D; Hosseini, M; Silva, R; Pinho, A; Ferreira, P (June 20–23, 2017). Visualization of Distinct DNA Regions of the Modern Human Relatively to a Neanderthal Genome. Lecture Notes in Computer Science 10255. pp. 235-42. ISBN 978-3-319-58837-7. doi:10.1007/978-3-319-58838-4_26. 
  19. ↑ «Surprise! 20 Percent of Neanderthal Genome Lives On in Modern Humans, Scientists Find». National Geographic. Consultado el 7 de octubre de 2016. 
  20. ↑ Zeberg, Hugo; Pääbo, Svante (3 de julio de 2020). «The major genetic risk factor for severe COVID-19 is inherited from Neandertals». bioRxiv. doi:10.1101/2020.07.03.186296. Consultado el 5 de julio de 2020. 
  21. ↑ Ding, Q (31 de agosto de 2014). «Neanderthal origin of the haplotypes carrying the functional variant Val92Met in the MC1R in modern humans.». Molecular Biology and Evolution 31 (8): 1994-2003. PMID 24916031. doi:10.1093/molbev/msu180. 
  22. ↑ Lowery, Robert K.; Uribe, Gabriel; Jimenez, Eric B.; Weiss, Mark A.; Herrera, Kristian J.; Regueiro, Maria; Herrera, Rene J. (2013). «Neanderthal and Denisova genetic affinities with contemporary humans: Introgression versus common ancestral polymorphisms». Gene 530 (1): 83-94. ISSN 0378-1119. PMID 23872234. doi:10.1016/j.gene.2013.06.005. 
  23. ↑ Bekker, Henk (23 de octubre de 2017). «Neues Museum in Berlin 1175». 
  24. ↑ Vernot, Benjamin; Akey, Joshua M (2015). «Complex History of Admixture between Modern Humans and Neandertals». American Journal of Human Genetics 96 (3): 454-61. PMC 4375686. PMID 25683119. doi:10.1016/j.ajhg.2015.01.006. 
  25. ↑ Kim, BY; Lohmueller, KE (2015). «Selection and Reduced Population Size Cannot Explain Higher Amounts of Neandertal Ancestry in East Asian than in European Human Populations». American Journal of Human Genetics 96 (3): 448-53. PMC 4375557. PMID 25683122. doi:10.1016/j.ajhg.2014.12.029. 
  26. ↑ "Specifically, genes in the LCP [lipid catabolic process] term had the greatest excess of NLS in populations of European descent, with an average NLS frequency of 20.8±2.6% versus 5.9±0.08% genome wide (two-sided t-test, P<0.0001, n=379 Europeans and n=246 Africans). Further, among examined out-of-Africa human populations, the excess of NLS [Neanderthal-like genomic sites] in LCP genes was only observed in individuals of European descent: the average NLS frequency in Asians is 6.7±0.7% in LCP genes versus 6.2±0.06% genome wide." Khrameeva, Ekaterina E.; Bozek, Katarzyna; He, Liu; Yan, Zheng; Jiang, Xi; Wei, Yuning; Tang, Kun; Gelfand, Mikhail S. et al. (2014). «Neanderthal ancestry drives evolution of lipid catabolism in contemporary Europeans». Nature Communications 5: 3584. Bibcode:2014NatCo...5.3584K. PMC 3988804. PMID 24690587. doi:10.1038/ncomms4584.  .
  27. ↑ Kuhlwilm, Martin; Gronau, Ilan; Hubisz, Melissa J.; de Filippo, Cesare; Prado-Martinez, Javier; Kircher, Martin; Fu, Qiaomei; Burbano, Hernán A. et al. (2016). «Ancient gene flow from early modern humans into Eastern Neanderthals». Nature 530 (7591): 429-33. Bibcode:2016Natur.530..429K. PMC 4933530. PMID 26886800. doi:10.1038/nature16544. 
  28. ↑ S. Sankararaman; S. Mallick; M. Dannemann; K. Prüfer; J. Kelso; N. Patterson; D. Reich (2014). «The landscape of Neandertal ancestry in present-day humans». Nature 507 (7492): 354-57. Bibcode:2014Natur.507..354S. PMC 4072735. PMID 24476815. doi:10.1038/nature12961. 
  29. ↑ Sankararaman, Sriram; Mallick, Swapan; Patterson, Nick; Reich, David (2016). «The Combined Landscape of Denisovan and Neanderthal Ancestry in Present-Day Humans». Current Biology 26 (9): 1241-47. ISSN 0960-9822. PMC 4864120. PMID 27032491. doi:10.1016/j.cub.2016.03.037. 
  30. ↑ «Neanderthals mated with modern humans much earlier than previously thought, study finds: First genetic evidence of modern human DNA in a Neanderthal individual». ScienceDaily. 17 de febrero de 2016. Consultado el 6 de marzo de 2016. 
  31. ↑ Mendez, Fernando L. (7 de abril de 2016). «The Divergence of Neandertal and Modern Human Y Chromosomes». The American Journal of Human Genetics 98 (4): 728-34. PMC 4833433. PMID 27058445. doi:10.1016/j.ajhg.2016.02.023. 
  32. ↑ Enard, David; Petrov, Dmitri A. (4 de octubre de 2018). «Evidence that RNA Viruses Drove Adaptive Introgression between Neanderthals and Modern Humans». Cell 175 (2): 360-371. PMC 6176737. PMID 30290142. doi:10.1016/j.cell.2018.08.034. 
  33. ↑ «Reconstructing the DNA methylation maps of the Neandertal and the Denisovan». Science 344 (6183): 523-27. 2014. Bibcode:2014Sci...344..523G. PMID 24786081. doi:10.1126/science.1250368. 
  34. ↑ Tibayrenc, Michel; Ayala, Francisco J. (12 de septiembre de 2016). On Human Nature: Biology, Psychology, Ethics, Politics, and Religion. ISBN 9780127999159. 
Obtenido de «https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Genética_neandertal&oldid=146650823»