En esa oportunidad los Canales privados tomaron la batuta de transmitir los partidos del campeonato estos se les concedieron a Caracol Televisión y RCN Televisión
Sistema de juego
En los torneos Apertura y Finalización se dividieron los 16 equipos en dos octogonales, disputándose siete fechas. Posteriormente se llevaron a cabo 15 fechas bajo el sistema de todos contra todos. Los ganadores de cada torneo clasificaban directamente para definir al campeón del año y a la fase de grupos de la Copa Libertadores 2000. El otro mejor equipo en la reclasificación también clasificaba al torneo continental.
Cabe destacar que en el Torneo Finalización se definió al ganador por medio del sistema de cuadrangulares semifinales y final, mientras que el ganador del Apertura clasificó a la final del año mediante el sistema de todos contra todos.
Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; Dif=Diferencia de gol
Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; DIF=Diferencia de gol
Clasificado para los cuadrangulares semifinales.
Eliminado
Cuadrangulares semifinales
La segunda fase del Torneo Finalización de 1999 consiste en los cuadrangulares semifinales. Estos los disputan los ocho mejores equipos del torneo distribuidos en dos grupos de cuatro equipos. Los ganadores de cada grupo se enfrentan en la final del segundo semestre .
R=Clasificación en la fase de todos contra todos; Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; DIF=Diferencia de gol
R=Clasificación en la fase de todos contra todos; Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; DIF=Diferencia de gol
Fecha 1 - 17 de noviembre de 1999
Local
Resultado
Visitante
Atlético Junior
1 - 2
Atlético Nacional
Cortuluá
2 - 1
Deportivo Pasto
Fecha 2 - noviembre 21 de 1999
Local
Resultado
Visitante
Atlético Nacional
3 - 2
Cortuluá
Deportivo Pasto
2 - 3
Atlético Junior
Fecha 3 - 24 de noviembre de 1999
Local
Resultado
Visitante
Atlético Nacional
3 - 2
Deportivo Pasto
Cortuluá
1 - 1
Atlético Junior
Fecha 4 - 28 de noviembre de 1999
Local
Resultado
Visitante
Atlético Junior
2 - 1
Cortuluá
Deportivo Pasto
0 - 1
Atlético Nacional
Fecha 5 - 1 de diciembre de 1999
Local
Resultado
Visitante
Atlético Nacional
2 - 1
Atlético Junior
Deportivo Pasto
0 - 0
Cortuluá
Fecha 6 - 5 de diciembre de 1999
Local
Resultado
Visitante
Atlético Junior
3 - 2
Deportivo Pasto
Cortuluá
4 - 3
Atlético Nacional
R=Clasificación en la fase de todos contra todos; Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; DIF=Diferencia de gol
Atlético Nacional es el ganador del finalización con el marcador global de 1-0.
Reclasificación
En la tabla de reclasificación se resumen todos los partidos jugados por los 16 equipos entre los meses de febrero y noviembre en los torneos Apertura y Finalización.
Pts=Puntos; PJ=Partidos jugados; G=Partidos ganados; E=Partidos empatados; P=Partidos perdidos; GF=Goles a favor; GC=Goles en contra; DIF=Diferencia de gol