Chemotion ELN[editar]

Chemotion ELN, es un SAAS (Software as a Service) desarrollado como cuaderno de laboratorio electrónico de código abierto (Open notebook science) para investigadores en el ámbito de las ciencias químicas. Este ELN (cuaderno de laboratorio electrónico) ofrece grandes soluciones a investigadores del mundo de la química, ofreciéndoles funcionalidades necesarias para la adquisición y procesamiento de datos químicos, como cálculos de propiedades moleculares o trabajar con estructuras de moléculas.

Esta aplicación basada en la web, permite la adquisición, gestión, almacenamiento, procesamiento e intercambio de datos de investigación química. Permitiendo de manera sencilla comunicar y compartir los datos registrados de la investigación.

Está desarrollado por el grupo de trabajo Bräse en el Instituto de Química Orgánica (IOC) del Instituto de Tecnología de Karlsruhe (KIT). El proyecto ha sido financiado desde 2015 por la Fundación de Investigación Alemana (Deutsche Forschungsgemeinschaft o DFG).

El código fuente del cliente y servidor web de Chemotion Repository tiene actualmente la licencia GNU Affero General Public License v3.0 . El código se puede encontrar en github .

Historia[editar]

El proyecto Chemotion ELN se inició para reemplazar un ELN básico (proyecto dial-a-device) programado en el Instituto de Tecnología de Karlsruhe por Dominic Lütjohann desde 2012 hasta 2014. El código base de Chemotion está siendo desarrollado por miembros del Stefan Bräse group (ComPlat) en el Instituto de Tecnología de Karlsruhe (KIT) [5] y NinjaConcept GmbH (Karlsruhe). En junio de 2015, Florian Hübsch de NinjaConcept subió las primeras confirmaciones iniciales al proyecto Chemotion ELN en GitHub.

Se programó en Ruby, Javascript, HTML y CSS. El servidor backend se basa en el marco Ruby on Rails con la base de datos relacional PostgreSQL, mientras que la interfaz de usuario frontal se construye principalmente con el marco ReactJS para servir una aplicación de una sola página. Ruby on Rails adopta Ruby, un lenguaje de script, que permite un desarrollo rápido con una estructura clara modelo-vista-controlador (MVC). Por otro lado, ReactJS separa las manipulaciones del modelo de objetos de documento (DOM) del flujo de datos, descompone estructuras entrelazadas para interacciones sofisticadas del usuario. Las personas que deseen ampliar las funciones de Chemotion ELN o iniciar un nuevo proyecto relacionado pueden comprender las lógicas con una curva de aprendizaje menos pronunciada. La gestión de paquetes Ruby permite implementar fácilmente paquetes externos desde un repositorio de código público. El ELN se programó de manera que se pueda personalizar a través de esta práctica gestión de paquetes. Los complementos específicos del ELN también se pueden escribir como motor RAILS para extender el ELN DB, las funciones del lado del servidor, pero también la interfaz de usuario.

Se cargó una versión 0.1.0 inicial en GitHub el 31 de mayo de 2016, seguida de una versión 0.2.0 en octubre. En septiembre de 2017 se publicó un artículo de revista sobre el sistema. Las actualizaciones del código parecen estar en curso, con una actualización 0.3.0 que llegó a mediados de noviembre de 2017, incluida una actualización de la interfaz de usuario de informes y la interfaz de usuario de muestra / reacción. Durante el año 2019 y 2020 se realizaron múltiples versiones, siendo su última versión la 1.0.3 lanzada el 21 de octubre de 2019.

Características[editar]

Este ELN ofrece las características necesarias para la documentación de proyectos químicos, incluido el procesamiento de moléculas y reacciones. Los elementos del ELN están organizados en listas separadas, por ejemplo, para moléculas o reacciones, asignadas a colecciones. Esto permite una estructura clara y ordenada a un bajo nivel de información.

La vista de lista se complementa con un resumen de la información disponible sobre los elementos individuales, como la disponibilidad de datos en bases de datos externas, la asignación a colecciones particulares y el estado de los archivos adjuntos almacenados. Además, la vista de lista admite una navegación rápida a las actividades asignadas a los elementos de la lista.

Otro panel con un nivel de información detallado es visible al seleccionar un elemento. Este panel permite al usuario visualizar información y editarla. Las descripciones textuales, los valores adicionales, los datos analíticos complementarios, los enlaces a fuentes externas y las referencias se incluyen en varios paneles con pestañas. Las listas de elementos y las vistas detalladas de los elementos seleccionados se construyen con las funcionalidades de una moderna aplicación basada en web que facilita la organización rápida de los datos de investigación a través de diversas acciones, como arrastrar y soltar, clasificación automática de elementos y notificaciones. La información disponible y la ocurrencia de los elementos en otros proyectos del ELN se proporcionan como enlace.

Las características de Chemotion ELN incluyen: