Usuario:Dipiert/Taller

Esta página describe la minería de datos aplicada a moléculas. Dado que las moléculas pueden ser representadas por grafos moleculares están pueden relacionarse fuertemente con el minado de grafos y el minado de estructuras. El principal problema es como representar moléculas mientras se discriminan las instancias de los datos. Una manera de hacer esto es usando métricas de similaridad química, las cua´les tienen una larga tradición en el campo de la Quimioinformática.

Los enfoques típicos para calcular similaridades químicas usan huellas químicas pero esto hace que se pierda la información subyacente respecto a la topología molecular. La minería de grafos moleculares evita este problema.

Codificación (Moleculai,Moleculaji) Métodos de kernel

Gráfo de kernel marginalizado

Kernel de asignación óptima

Kernel de farmacóforo

Implementación en C++ y R combinando:

El grafo de kérnel marginalizado entre grafos etiquetados

Extensiones al kernel marginalizado

Kernels Tanimoto