Kate Nelligan, cuyo verdadero nombre es Patricia Colleen Nelligan, nació en London, Ontario, Canadá, siendo la cuarta de seis hermanos en total. Su fecha de nacimiento es el 16 de marzo de 1950, aunque algunas fuentes afirman que nació en 1951.[3] Es hija de Patrick Joseph, un empleado municipal que estaba a cargo de las pistas de hielo y los parques recreativos, y de Josephine Alice, una profesora de colegio.[3]
Tuvo problemas con el alcohol y otros problemas psicológicos, por ello recibió ayuda y fue ingresada en una clínica de rehabilitación.[5] Nelligan se casó con Robert Reale, un pianista y compositor, el 19 de febrero de 1989, finalmente se separaron años después, teniendo ambos un hijo en común, Gabriel Joseph, nacido en 1992.[3][6]