KEGG

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El KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) (Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto) es una colección de bases de datos en línea de genomas, rutas enzimáticas, y químicos biológicos. La base de datos PATHWAY registra las redes de interacciones moleculares dentro de las células, y variantes de ellas específicas a organismos particulares. A partir de julio de 2011, KEGG ha cambiado a un modelo de suscripción y el acceso a través de FTP ya no es gratis.

Introducción[editar]

El KEGG, el Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, fue iniciado por el programa del genoma humano japonés en 1995.[1] Los desarrolladores consideran a KEGG de ser una "representación informática" del sistema biológico.[2] La base de datos KEGG puede ser utilizada para la modelización y la simulación, la navegación y extracción de datos. Es parte del enfoque biología de sistemas.

KEGG mantiene cinco bases de datos principales:[3]

  • KEGG Atlas
  • KEGG Pathway
  • KEGG Genes
  • KEGG Ligand
  • KEGG BRITE

Referencias[editar]

  1. Kanehisa M (1997). «A database for post-genome analysis.». Trends Genet 13 (9): 375–6. PMID 9287494. 
  2. Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S et al. (2006). «From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG.». Nucleic Acids Res 34 (Database issue): D354–7. doi:10.1093/nar/gkj102. PMC 1347464. PMID 16381885. 
  3. Kanehisa M, Goto S, Kawashima S, Okuno Y, Hattori M (2004). «The KEGG resource for deciphering the genome.». Nucleic Acids Res 32 (Database issue): D277–80. doi:10.1093/nar/gkh063. PMC 308797. PMID 14681412.