Brain Imaging Data Structure

Brain Imaging Data Structure
	https://bids.neuroimaging.io
Información general
Lanzamiento inicial	2014
Última versión	1.4.0 ; Junio 2020
Tipo de formato	Neuroimagen
Contenedor para	NIfTI, JSON, TSV
Formato abierto
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La estructura para datos de imagen cerebral (en inglés Brain Imaging Data Structure, BIDS) es un estándar para organizar, anotar, y describir los datos recogidos mediante pruebas de neuroimagen. Está basado en una estructura definida de archivos y carpetas, junto con documentación de los metadatos correspondientes en ficheros JSON con vocabulario controlado.^[1] Este estándar ha sido adoptado por un multitud de laboratorios de todo el mundo, así como bases de datos, y está siendo cada vez más utilizado en los estudios científicos.^[2]^[3]^[4]

Originalmente se desarrollaron especificaciones para resonancia magnética IRM, y pronto el estándar BIDS ha sido extendido a muchas otras modalidades de neuroimagen, como magnetoencefalografía (MEG),^[5] electroencefalografía (EEG)^[6] y EEG intracraneal.^[7]

Enlaces externos

Referencias

↑ Krzysztof J (2016). «The brain imaging data structure, a format for organizing and describing outputs of neuroimaging experiments». Scientific Data 3: 160044. PMC 4978148. PMID 27326542. doi:10.1038/sdata.2016.44.
↑ Poldrack, R. A., et al. "A phenome-wide examination of neural and cognitive function." Scientific data 3 (2016): 160110.
↑ Bigdely-Shamlo, Nima, Scott Makeig, and Kay A. Robbins. "Preparing laboratory and real-world EEG data for large-scale analysis: a containerized approach." Frontiers in neuroinformatics 10 (2016): 7.
↑ Nichols, Thomas E., et al. "Best practices in data analysis and sharing in neuroimaging using MRI." Nature neuroscience 20.3 (2017): 299.
↑ Niso, Guiomar; Gorgolewski, Krzysztof J.; Bock, Elizabeth; Brooks, Teon L.; Flandin, Guillaume; Gramfort, Alexandre; Henson, Richard N.; Jas, Mainak et al. (19 de junio de 2018). «MEG-BIDS, the brain imaging data structure extended to magnetoencephalography». Scientific Data 5: 180110. PMC 6007085. PMID 29917016. doi:10.1038/sdata.2018.110.
↑ Pernet, Cyril R.; Appelhoff, Stefan; Gorgolewski, Krzysztof J.; Flandin, Guillaume; Phillips, Christophe; Delorme, Arnaud; Oostenveld, Robert (December 2019). «EEG-BIDS, an extension to the brain imaging data structure for electroencephalography». Scientific Data 6 (1): 103. ISSN 2052-4463. PMC 6592877. PMID 31239435. doi:10.1038/s41597-019-0104-8.
↑ Holdgraf, Christopher; Appelhoff, Stefan; Bickel, Stephan; Bouchard, Kristofer; D’Ambrosio, Sasha; David, Olivier; Devinsky, Orrin; Dichter, Benjamin et al. (December 2019). «iEEG-BIDS, extending the Brain Imaging Data Structure specification to human intracranial electrophysiology». Scientific Data 6 (1). ISSN 2052-4463. doi:10.1038/s41597-019-0105-7.

Datos: Q49001355

[1] Krzysztof J (2016). «The brain imaging data structure, a format for organizing and describing outputs of neuroimaging experiments». Scientific Data 3: 160044. PMC 4978148. PMID 27326542. doi:10.1038/sdata.2016.44.

[2] Poldrack, R. A., et al. "A phenome-wide examination of neural and cognitive function." Scientific data 3 (2016): 160110.

[3] Bigdely-Shamlo, Nima, Scott Makeig, and Kay A. Robbins. "Preparing laboratory and real-world EEG data for large-scale analysis: a containerized approach." Frontiers in neuroinformatics 10 (2016): 7.

[4] Nichols, Thomas E., et al. "Best practices in data analysis and sharing in neuroimaging using MRI." Nature neuroscience 20.3 (2017): 299.

[5] Niso, Guiomar; Gorgolewski, Krzysztof J.; Bock, Elizabeth; Brooks, Teon L.; Flandin, Guillaume; Gramfort, Alexandre; Henson, Richard N.; Jas, Mainak et al. (19 de junio de 2018). «MEG-BIDS, the brain imaging data structure extended to magnetoencephalography». Scientific Data 5: 180110. PMC 6007085. PMID 29917016. doi:10.1038/sdata.2018.110.

[6] Pernet, Cyril R.; Appelhoff, Stefan; Gorgolewski, Krzysztof J.; Flandin, Guillaume; Phillips, Christophe; Delorme, Arnaud; Oostenveld, Robert (December 2019). «EEG-BIDS, an extension to the brain imaging data structure for electroencephalography». Scientific Data 6 (1): 103. ISSN 2052-4463. PMC 6592877. PMID 31239435. doi:10.1038/s41597-019-0104-8.

[7] Holdgraf, Christopher; Appelhoff, Stefan; Bickel, Stephan; Bouchard, Kristofer; D’Ambrosio, Sasha; David, Olivier; Devinsky, Orrin; Dichter, Benjamin et al. (December 2019). «iEEG-BIDS, extending the Brain Imaging Data Structure specification to human intracranial electrophysiology». Scientific Data 6 (1). ISSN 2052-4463. doi:10.1038/s41597-019-0105-7.

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