Desde su fundación en 1901, cuando un grupo de trabajadores y empleados de la carbonera "Wilson" pensaron en crear un nuevo club de fútbol en Buenos Aires, hasta el año 2021 han sido 25 los presidentes encargados de ejercer el máximo cargo dirigencial de la institución.[2] El primero en el mando fue Leopoldo Bard, quien fuera uno de los fundadores del club.[3] El presidente que más tiempo se mantuvo en el cargo fue Rafael Aragón Cabrera llegando a permanecer 10 años consecutivos, aunque Antonio Vespucio Liberti logró a estar a cargo de la presidencia por 19 años pero en diferentes mandatos.[4]
El presidente actual del club es Jorge Brito, quien cumple su primer mandato tras ser elegido en las elecciones de 2021.[5] Está acompañado en la vicepresidencia por Matías Patanian y Ignacio Villarroel.
El presidente más exitoso del club es Rodolfo D'Onofrio, quien durante sus dos mandatos obtuvo un total de quince títulos oficiales, ocho nacionales y siete internacionales.[6]