Tetrabucle

Un tetrabucle es un motivo estructural del tipo "bucle en horquilla" formado por cuatro bases, que se presenta en la estructura secundaria del ARN, donde puede encapuchar muchas doble hélices.^[2] Hay tres tipos de tetrabucles comunes en el ARN ribosomal: GRNA, UNCG y CUUG. El tetrabucle GRNA posee un par de bases guanina-adenina donde la guanina se encuentra en dirección 5' en relación a la hélice y la adenina en la dirección 3'. Los tetrabucles con la secuencia UMAC poseen esencialmente el mismo esqueleto que el tetrabucle GRNA,^[3] pero puede ser menos afín a formar interacciones del tipo tetrabucle-receptor. Por lo tanto puede haber mejores elecciones para acercar extremos cuando se diseñan ARNs artificiales.

Véase también

Estructura terciaria del ARN

Referencias

↑ Cate, J.H., Gooding, A.R., Podell, E., Zhou, K., Golden, B.L., Kundrot, C.E., Cech, T.R., Doudna, J.A. (1996). «Crystal structure of a group I ribozyme domain: principles of RNA packing.». Science 273 (5282): 1676-1685. PMID 8781224. doi:10.1126/science.273.5282.1678.
↑ Woese, C.R., Winkers, S., Gutell, R.R. (1990). «Architecture of ribosomal RNA: Constraints on the sequence of "tetra-loops"». Proc. Nati. Acad. Sci. USA 87 (21): 8467-71. PMC 54977. PMID 2236056. doi:10.1073/pnas.87.21.8467.
↑ Zhao, Q., Huang, H-C., Nagaswamy, U., Xia, Y., Gao, X., Fox, G.E. (2012). «UNAC tetraloops: To what extent do they mimic GNRA tetraloops?». Biopolymers 97 (8): 617-628. PMID 22605553. doi:10.1002/bip.22049.

Datos: Q3546848

[Cate96-1] Cate, J.H., Gooding, A.R., Podell, E., Zhou, K., Golden, B.L., Kundrot, C.E., Cech, T.R., Doudna, J.A. (1996). «Crystal structure of a group I ribozyme domain: principles of RNA packing.». Science 273 (5282): 1676-1685. PMID 8781224. doi:10.1126/science.273.5282.1678.

[Woese90-2] Woese, C.R., Winkers, S., Gutell, R.R. (1990). «Architecture of ribosomal RNA: Constraints on the sequence of "tetra-loops"». Proc. Nati. Acad. Sci. USA 87 (21): 8467-71. PMC 54977. PMID 2236056. doi:10.1073/pnas.87.21.8467.

[Zhao12-3] Zhao, Q., Huang, H-C., Nagaswamy, U., Xia, Y., Gao, X., Fox, G.E. (2012). «UNAC tetraloops: To what extent do they mimic GNRA tetraloops?». Biopolymers 97 (8): 617-628. PMID 22605553. doi:10.1002/bip.22049.

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