Pangenoma
El pangenoma (o supragenoma) en biología molecular describe la colección de todos los genes en una especie (aplicado típicamente a bacterias y arqueas, que pueden presentar una gran variación de contenido genético entre cepas estrechamente relacionadas). Es un superconjunto de todos los genes de todas las cepas de una especie.[1] El pangenoma adquiere importancia en un contexto evolutivo, especialmente con referencia a la metagenómica,[2] pero es usado también en un contexto genómico más amplio.[3]
El pangenoma incluye el genoma-núcleo que contiene genes presentes en todas las cepas, un "genoma prescindible" que contiene genes presentes en dos o más cepas, y finalmente "genes únicos" específicos de cepas partículares.[1]
Véase también
- Quasispecie, concepto similar definido por John Maynard Smith.
Referencias
- ↑ a b Medini D, Donati C, Tettelin H, Masignani V, Rappuoli R (Diciembre de 2005). «The microbial pan-genome». Curr. Opin. Genet. Dev. 15 (6): 589-94. PMID 16185861. doi:10.1016/j.gde.2005.09.006.
- ↑ Reno ML, Held NL, Fields CJ, Burke PV, Whitaker RJ (mayo de 2009). «Biogeography of the Sulfolobus islandicus pan-genome». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (21): 8605-10. PMC 2689034. PMID 19435847. doi:10.1073/pnas.0808945106.
- ↑ Reinhardt JA, Baltrus DA, Nishimura MT, Jeck WR, Jones CD, Dangl JL (Febrero de 2009). «De novo assembly using low-coverage short read sequence data from the rice pathogen Pseudomonas syringae pv. oryzae». Genome Res. 19 (2): 294-305. PMC 2652211. PMID 19015323. doi:10.1101/gr.083311.108.
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Datos: Q3037930