Pangenoma

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El pangenoma (o supragenoma) en biología molecular describe la colección de todos los genes en una especie (aplicado típicamente a bacterias y arqueas, que pueden presentar una gran variación de contenido genético entre cepas estrechamente relacionadas). Es un superconjunto de todos los genes de todas las cepas de una especie.[1] El pangenoma adquiere importancia en un contexto evolutivo, especialmente con referencia a la metagenómica,[2] pero es usado también en un contexto genómico más amplio.[3]

El pangenoma incluye el genoma-núcleo que contiene genes presentes en todas las cepas, un "genoma prescindible" que contiene genes presentes en dos o más cepas, y finalmente "genes únicos" específicos de cepas partículares.[1]

Véase también[editar]

Referencias[editar]

  1. a b Medini D, Donati C, Tettelin H, Masignani V, Rappuoli R (Diciembre 2005). «The microbial pan-genome». Curr. Opin. Genet. Dev. 15 (6):  pp. 589–94. doi:10.1016/j.gde.2005.09.006. PMID 16185861. 
  2. Reno ML, Held NL, Fields CJ, Burke PV, Whitaker RJ (Mayo 2009). «Biogeography of the Sulfolobus islandicus pan-genome». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (21):  pp. 8605–10. doi:10.1073/pnas.0808945106. PMID 19435847. 
  3. Reinhardt JA, Baltrus DA, Nishimura MT, Jeck WR, Jones CD, Dangl JL (Febrero 2009). «De novo assembly using low-coverage short read sequence data from the rice pathogen Pseudomonas syringae pv. oryzae». Genome Res. 19 (2):  pp. 294–305. doi:10.1101/gr.083311.108. PMID 19015323.