Las Elecciones estatales de Morelos de 2006 se llevaron a cabo el domingo 2 de julio, y en ellas fueron renovados los titulares de los siguientes cargos de elección popular del estado mexicano de Morelos:
Gobernador de Morelos. Titular del Poder Ejecutivo del estado, electo para un periodo de seis años no reelegibles en ningún caso, el candidato electo fue Marco Adame Castillo.
33 Ayuntamientos. Formados por un Presidente Municipal y regidores, electos para un periodo de tres años, no reelegibles de manera consecutiva.
30 Diputados al Congreso del Estado. 18 electos por mayoría relativa en cada uno de los Distritos Electorales y 12 por el principio de Representación proporcional mediante un sistema de listas.
Huitzilac,Tepoztlan,Jiutepec,Yautepec,Miacatlan,Xochitepec,Tlaltizapan,Jojutla,Amacuzac,Jantetelco,Puente de Ixtla,Temixco,Temoac,Tlalnepantla y Tlayacapan.