Se funda en 1962 con el nombre de Club Deportivo Bidasoa de Irun por Jose Miguel Arana. Según fue pasando el tiempo, el equipo se fue asentando poco a poco en la División de Honor, hasta que a finales de los años 80, el equipo empezó a tener resultados destacables antes rivales de mayor entidad. Este periodo, de la mano del patrocinador Chocolates Elgorriaga, se culminó con la consecución del campeonato de Liga de la temporada 86/87.
La liga conseguida en 1986 inició un período muy fructífero, consiguiendo otra liga (94/95), dos Copas del Rey (90/91 y 95/96), una copa ASOBAL (92/93). A nivel europeo, cabe destacar la consecución de la Copa de Europa (94/95), que junto con la Recopa de Europa (96/97) llevaron al equipo a ser un referente en Europa y un rival a batir en la máxima competición europea.Todo ello se consiguió teniendo de patrocinador a la firma irunesa "Chocolates Elgorriaga".
A principios del siglo XXI, vino el declive del equipo, donde los objetivos del equipo se limitaron a obtener la clasificación para alguna competición europea. Finalmente, en la temporada 2006/2007, el equipo desciende a División de Honor Plata. Al finalizar la temporada 2012/2013, disputa el ascenso en casa frente al Ángel Ximénez Puente Genil, perdiendo el partido por escasa renta. A pesar de todo, la desaparición del BM Atlético de Madrid, unida a la estabilidad económica del Club Deportivo Bidasoa, permiten que la temporada 2013/2014 sea la del deseado retorno a la División de Honor.
Gurutz Aginagalde
Dan Racoțea
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Thomas Tesoriere
Nicolás Bonanno
Rodrigo Salinas
Donát Bartók
Matheus Francisco
Julen Aguinagalde (PI) (del 
PGE Kielce)
Nicolás Bonanno (LI) (del 
Dan Racoțea (LI) (del 
Chartres MHB)
Paco Barthe (LI) (al 
Esteban Salinas (PI) (al 
Rangel Luan (PO) (al 
Milos Orbovic (LD) (al 
Motor Zaporiyia)
Datos: Q856918