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Ribozima del virus de hepatitis delta

De Wikipedia, la enciclopedia libre
Representación de la estructura 3D de la ribozima del virus de hepatitis delta.[1]

La ribozima del virus de hepatitis delta (VHD) es una secuencia de ARN no codificante en el virus de hepatitis delta necesaria para la replicación viral y es el único ejemplo de un ARN catalítico asociado a un virus animal. La ribozima actúa procesando secuencias transcritas de ARN en unidades con el largo necesario en una reacción de autoescisión.[2]

La estructura del cristal de esta ribozima ha sido resuelta utilizando cristalografía de rayos X y muestra cinco segmentos conectados por un pseudonudo doble.[3]

La replicación del ADN viral produce multímeros lineales de ARN genómico y antigenómico, los cuales también poseen la actividad de autoescisión. La versión antigenómica no es una secuencia complementaria exacta, pero adopta la misma estructura que la hebra genómica. La única diferencia significativa entre las dos es un pequeño abultamiento en el tallo P4 y una unión J4/2 más corta.

La estructura de la ribozima del virus de hepatitis delta está estructuralmente y bioquímicamente relacionada con la ribozima mamífera CPEB3. Secuencias no relacionadas con alta similitud a la ribozima VHD han evolucionado mediante evolución convergente en algunos retrotransposones (por ejemplo, en el elemento de ARN R2 en insectos y en el L1Tc y probablemente otros retrotransposones en tripanosomátidos).[4][5][6][7]

Referencias

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  1. Ferré-D'Amaré AR; Zhou K; Doudna JA (1998). «Crystal structure of a hepatitis delta virus ribozyme». Nature 395 (6702): 567-74. PMID 9783582. doi:10.1038/26912. 
  2. Nishiyori, Michiko; Uchida, Hitoshi; Nagai, Jun; Araki, Kohei; Mukae, Takehiro; Kishioka, Shiroh; Ueda, Hiroshi (21 de septiembre de 2011). «Permanent relief from intermittent cold stress-induced fibromyalgia-like abnormal pain by repeated intrathecal administration of antidepressants». Molecular Pain 7: 69. ISSN 1744-8069. PMC 3184270. PMID 21933442. doi:10.1186/1744-8069-7-69. Consultado el 10 de marzo de 2016. 
  3. Doudna, Jennifer A.; Ferré-D'Amaré, Adrian R.; Zhou, Kaihong. «http://www.nature.com/doifinder/10.1038/26912». Nature 395 (6702): 567-574. doi:10.1038/26912. 
  4. Eickbush, Danna G.; Eickbush, Thomas H. (1 de julio de 2010). «R2 Retrotransposons Encode a Self-Cleaving Ribozyme for Processing from an rRNA Cotranscript». Molecular and Cellular Biology (en inglés) 30 (13): 3142-3150. ISSN 0270-7306. PMC 2897577. PMID 20421411. doi:10.1128/MCB.00300-10. Consultado el 10 de marzo de 2016. 
  5. Webb, Chiu-Ho T.; Riccitelli, Nathan J.; Ruminski, Dana J.; Lupták, Andrej (13 de noviembre de 2009). «Widespread Occurrence of Self-Cleaving Ribozymes». Science (en inglés) 326 (5955): 953-953. ISSN 0036-8075. PMC 3159031. PMID 19965505. doi:10.1126/science.1178084. Consultado el 10 de marzo de 2016. 
  6. Webb, Chiu-Ho T.; Lupták, Andrej (1 de septiembre de 2011). «HDV-like self-cleaving ribozymes». RNA Biology 8 (5): 719-727. ISSN 1547-6286. PMC 3256349. PMID 21734469. doi:10.4161/rna.8.5.16226. Consultado el 10 de marzo de 2016. 
  7. Sánchez-Luque, Francisco J.; López, Manuel C.; Macias, Francisco; Alonso, Carlos; Thomas, M. Carmen (1 de octubre de 2011). «Identification of an hepatitis delta virus-like ribozyme at the mRNA 5′-end of the L1Tc retrotransposon from Trypanosoma cruzi». Nucleic Acids Research (en inglés) 39 (18): 8065-8077. ISSN 0305-1048. PMC 3185411. PMID 21724615. doi:10.1093/nar/gkr478. Consultado el 10 de marzo de 2016. 

Enlaces externos

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