La temporada comenzó el 4 de agosto de 2012 y terminó el 26 de mayo de 2013, con un receso de invierno entre diciembre y febrero. El campeón de la temporada pasada Željezničar Sarajevo pudo defender con éxito el título esta temporada, Este es el sexto campeonato de Bosnia y Herzegovina en la historia del club, el tercero en cuatro temporadas.
Los dieciséis mejores clubes del país se agrupan en un solo grupo donde compiten dos veces en casa y fuera, con un total de treinta partidos disputados por club. Al final de la temporada, los dos últimos de la clasificación son relegados y sustituidos por el ganador de cada uno de los grupos de la segunda división, la Primera Liga de la República Srpska y la Primera Liga de Bosnia y Herzegovina.
Los clubes Borac Banja Luka, Čelik Zenica, Olimpik Sarajevo, Slavija Sarajevo y Leotar Trebinje no pudierón obtener una licencia de la UEFA con el fin de clasificarse para la Europa League 2013-14 por motivos económicos o de infraestructura. El noveno clasificado el club Zrinjski Mostar recibe un boleto para la primera ronda de clasificación de la competición europea.