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Modelo de trombón (replicación del ADN)

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Definición

El modelo del trombón es un modelo diseñado para explicar la forma de elongacion de la hebra rezagada de ADN. Este modelo se utiliza para explicar como estando las dos ADN polimerasas III unidas por medio del los complejos T pueden elongar en dos direcciones opuestas.

Complejo de replicación

Holoenzima ADN Pol III de E. coli.

La replicación de ADN está dada por un complejo que tiene varias enzimas unidas entre si.

Estas enzimas son:[1]

ADN polimerasa III (2-una para cada sentido de replicación):Encargada de agregar nucleotidos en el sentido 5´ a 3´

Helicasa: Encargada de abrir las dos cadenas molde

ADN primasa: Sintetiza los cebadores para proveer el primer extremo 3´ libre

• Clamp: Aumentra la procesividad de la ADN polimerasa III manteniéndola pegada a la hebra molde

• Sigle-strand DNA binding protein (Proteínas SSB) Mantiene separadas las hebras molde ( no es precisamente parte del complejo pues no esta unida a las otras enzimas)

Explicación del modelo

Enzimas que participan en la replicación de E. coli: helicasa, proteínas SSB, topoisomerasa, ARN primasa, Holoenzima ADN Pol III

Para lograr la elongación de la cadena rezagada se hace por medio de fragmentos de Okazaki. Contrario a lo que se creía en un principio entre la terminación de un fragmento de Okazaki y la formación del siguiente la ADN polimerasa III no salta sino que esta al estar ligada al complejo de genera un arco de replicación.[2]

Este arco se forma gracias al ensamblaje y desemsamblaje de la del "clamp". Esto genera que al ensamblarse empiece una elongación y crezca el arco, luego cuando llega a un cebador este fragmento acaba y la ADN polimerasa se desensambla, dejando que la cadena pase derecho hasta encontrar el siguiente cebador . En este punto el "clamp" vuelve a sujetar la a la cadena y vuelve a comenzar la elongación.[3]

Se compara con un trombón pues en cada punto donde se forma y agranda el arco parece la horquilla de un trombón . Luego al soltrse el clamp deja de crecer y es como si se recogiera. Este modelo perite explicar como el complejo de replicación se mueve a través de la hebra molde de ADN sin dejar atrás proteínas y con una mayor procesividad.

Enlaces externos

http://www.youtube.com/watch?v=KUbmLw84CvU&feature=related

http://www.youtube.com/watch?v=PM3D1U0MVPM

Notas y referencias

  1. Chastain, Paul.D (2003). «Architecture of the Replication Complex and DNA Loops at the Fork Generated by the Bacteriophage T4 Proteins». The American Society for Biochemistry and Molecular Biologyhttp. 
  2. Alberts, Bruce et. al (1994). «6». Molecular biology of the cell (en inglés) (tercera edicion edición). New York: Garland. p. 258. 
  3. Chastain, Paul.D (2003). «Architecture of the Replication Complex and DNA Loops at the Fork Generated by the Bacteriophage T4 Proteins». The American Society for Biochemistry and Molecular Biologyhttp.