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Las '''firmas mutacionales''' del cáncer son los procesos de [[mutación]] en el ADN de las células que siguen un patrón característico y fijo. La teoría mutacional del [[cáncer]] propone que las denominadas mutaciones "conductoras", confieren una ventaja proliferativa en una célula, lo que provoca una activación del proceso tumoral. Algunas mutaciones “conductoras” se heredan en la línea germinal, pero la mayoría se presentan en las células somáticas durante la vida del paciente con cáncer, junto con muchas mutaciones "pasajeras" no implicadas en el desarrollo del cáncer. Múltiples procesos mutacionales, como exposiciones mutágenas endógenas y exógenas, edición de ADN aberrante, errores de replicación y mantenimiento defectuoso del ADN, son responsables de generar estas mutaciones. Dentro de esta teoría mutacional, encontramos patrones fijos y estables que se encuentran en un número elevado de cánceres del mismo tipo, referiéndose así a las firmas mutacionales. Dentro de las firmas mutacionales encontramos distintos tipos de firmas, por ejemplo, las firmas debidas a sustitución de bases o a reordenamientos, las cuales estan interrelacionadas.<ref name=":0">{{Cita publicación|url=http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nature17676|título=Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences|apellidos=Nik-Zainal|nombre=Serena|apellidos2=Davies|nombre2=Helen|publicación=Nature|volumen=534|número=7605|páginas=47–54|doi=10.1038/nature17676|pmc=PMC4910866|pmid=27135926|apellidos3=Staaf|nombre3=Johan|apellidos4=Ramakrishna|nombre4=Manasa|apellidos5=Glodzik|nombre5=Dominik|apellidos6=Zou|nombre6=Xueqing|apellidos7=Martincorena|nombre7=Inigo|apellidos8=Alexandrov|nombre8=Ludmil B.|apellidos9=Martin|nombre9=Sancha}}</ref> |
Las '''firmas mutacionales''' del cáncer son los procesos de [[mutación]] en el ADN de las células que siguen un patrón característico y fijo. La teoría mutacional del [[cáncer]] propone que las denominadas mutaciones "conductoras", confieren una ventaja proliferativa en una célula, lo que provoca una activación del proceso tumoral. Algunas mutaciones “conductoras” se heredan en la línea germinal, pero la mayoría se presentan en las células somáticas durante la vida del paciente con cáncer, junto con muchas mutaciones "pasajeras" no implicadas en el desarrollo del cáncer. Múltiples procesos mutacionales, como exposiciones mutágenas endógenas y exógenas, edición de ADN aberrante, errores de replicación y mantenimiento defectuoso del ADN, son responsables de generar estas mutaciones. Dentro de esta teoría mutacional, encontramos patrones fijos y estables que se encuentran en un número elevado de cánceres del mismo tipo, referiéndose así a las firmas mutacionales. Dentro de las firmas mutacionales encontramos distintos tipos de firmas, por ejemplo, las firmas debidas a sustitución de bases o a reordenamientos, las cuales estan interrelacionadas.<ref name=":0">{{Cita publicación|url=http://www.nature.com/doifinder/10.1038/nature17676|título=Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences|apellidos=Nik-Zainal|nombre=Serena|apellidos2=Davies|nombre2=Helen|publicación=Nature|volumen=534|número=7605|páginas=47–54|doi=10.1038/nature17676|pmc=PMC4910866|pmid=27135926|apellidos3=Staaf|nombre3=Johan|apellidos4=Ramakrishna|nombre4=Manasa|apellidos5=Glodzik|nombre5=Dominik|apellidos6=Zou|nombre6=Xueqing|apellidos7=Martincorena|nombre7=Inigo|apellidos8=Alexandrov|nombre8=Ludmil B.|apellidos9=Martin|nombre9=Sancha}}</ref> La <nowiki>'''nomenclatura'''</nowiki> que determina cada una de estas firmas viene establecida por el Catálogo de Mutaciones Somáticas en Cáncer ([[COSMIC (base de datos)]])<ref>{{Cita publicación|url=http://science.sciencemag.org/content/354/6312/618|título=Mutational signatures associated with tobacco smoking in human cancer|apellidos=Alexandrov|nombre=Ludmil B.|apellidos2=Ju|nombre2=Young Seok|fecha=2016-11-04|publicación=Science|volumen=354|número=6312|páginas=618–622|fechaacceso=2017-02-18|idioma=en|issn=0036-8075|doi=10.1126/science.aag0299|pmid=27811275|apellidos3=Haase|nombre3=Kerstin|apellidos4=Loo|nombre4=Peter Van|apellidos5=Martincorena|nombre5=Iñigo|apellidos6=Nik-Zainal|nombre6=Serena|apellidos7=Totoki|nombre7=Yasushi|apellidos8=Fujimoto|nombre8=Akihiro|apellidos9=Nakagawa|nombre9=Hidewaki}}</ref>. |
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== Firmas mutacionales de sustitución de bases == |
== Firmas mutacionales de sustitución de bases == |
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Revisión del 20:04 18 feb 2017
Las firmas mutacionales del cáncer son los procesos de mutación en el ADN de las células que siguen un patrón característico y fijo. La teoría mutacional del cáncer propone que las denominadas mutaciones "conductoras", confieren una ventaja proliferativa en una célula, lo que provoca una activación del proceso tumoral. Algunas mutaciones “conductoras” se heredan en la línea germinal, pero la mayoría se presentan en las células somáticas durante la vida del paciente con cáncer, junto con muchas mutaciones "pasajeras" no implicadas en el desarrollo del cáncer. Múltiples procesos mutacionales, como exposiciones mutágenas endógenas y exógenas, edición de ADN aberrante, errores de replicación y mantenimiento defectuoso del ADN, son responsables de generar estas mutaciones. Dentro de esta teoría mutacional, encontramos patrones fijos y estables que se encuentran en un número elevado de cánceres del mismo tipo, referiéndose así a las firmas mutacionales. Dentro de las firmas mutacionales encontramos distintos tipos de firmas, por ejemplo, las firmas debidas a sustitución de bases o a reordenamientos, las cuales estan interrelacionadas.[1] La '''nomenclatura''' que determina cada una de estas firmas viene establecida por el Catálogo de Mutaciones Somáticas en Cáncer (COSMIC (base de datos))[2].
Firmas mutacionales de sustitución de bases
Las firmas mutacionales de este tipo son debidas a mutaciones por sustitución de base. En el cáncer de mama encontramos un espectro de 12 firmas de sustitución de bases. Estas se ordenan de acuerdo con amplios grupos biológicos: las firmas 1 y 5 se correlacionan con la edad del diagnóstico; Las firmas 2 y 13 están relacionadas con la proteína APOBEC; las firmas 6, 20 y 26 están asociadas con una deficiencia de reparación por mal apareamiento; las firmas 3 y 8 están asociadas con una deficiencia de recombinación homóloga; las firmas 18, 17 y 30 tienen etiología desconocida.[1]
Firmas mutacionales de reordenamiento
Las firmas de procesos de mutación de reordenamiento no han sido previamente investigadas formalmente. Se aplica un marco matemático utilizado para las firmas de sustitución de bases. En el cáncer de mama se encuentran 6 firmas mutacionales de reordenamiento. La firma de reordenamiento 1 y 3 se caracterizan predominantemente por duplicaciones en tándem. Más del 95% de las duplicaciones en tándem de la firma 3 se concentran en el 15% de los cánceres. Casi todos los cánceres (91%) con mutaciones BRCA1 o hipermetilación del promotor se encuentran en este grupo. Por lo tanto, la inactivación de este gen puede ser responsable de las pequeñas duplicaciónes en tándem de la firma 3. La firma 5 se caracteriza por deleciones <100 kb. Se asocia fuertemente con la presencia de mutaciones de BRCA1 o de hipermetilación del promotor y mutaciones de BRCA2. La firma 2 se caracteriza por deleciones no agrupadas, inversiones y translocaciones intercromasómicas, está presente en la mayoría de los cánceres de mama, pero sobretodo en los cánceres de mama ER positivos. La firma 4 se caracteriza por translocaciones intercromosómicas agrupadas, mientras que la firma 6 presenta inversiones agrupadas y deleciones.
Estas 6 firmas están divididas en siete (A-G) subgrupos que muestran asociaciones distintas con otras características genómicas, histológicas o de expresión génica.[1]
- ↑ a b c Nik-Zainal, Serena; Davies, Helen; Staaf, Johan; Ramakrishna, Manasa; Glodzik, Dominik; Zou, Xueqing; Martincorena, Inigo; Alexandrov, Ludmil B. et al.. «Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences». Nature 534 (7605): 47-54. PMC 4910866. PMID 27135926. doi:10.1038/nature17676.
- ↑ Alexandrov, Ludmil B.; Ju, Young Seok; Haase, Kerstin; Loo, Peter Van; Martincorena, Iñigo; Nik-Zainal, Serena; Totoki, Yasushi; Fujimoto, Akihiro et al. (4 de noviembre de 2016). «Mutational signatures associated with tobacco smoking in human cancer». Science (en inglés) 354 (6312): 618-622. ISSN 0036-8075. PMID 27811275. doi:10.1126/science.aag0299. Consultado el 18 de febrero de 2017.