Diferencia entre revisiones de «Familia de motivos tripartitos»
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Revisión del 23:15 9 feb 2010
La familia de motivos tripartitos es una familia de proteínas que se caracterizan por contener motivos tripartitos en su estructura. Todas las proteínas de esta familia se denominan TRIM seguido de un número.[1]
Función
Muchas proteínas TRIM son inducidas por interferón, ya que son un componente importante en la resistencia contra patógenos, y muchas proteínas TRIM son conocidas por ser necesarias para la restricción de infecciones causadas por lentivirus. Estas proteínas está implicadas en el reconocimiento del patógeno y, por regulación de rutas transcripcionales, en la defensa del hospedador.[2]
Estructura
Los motivos tripartitos siempre se encuentran presentes en el dominio N-terminal de las proteínas TRIM. Los motivos tripartitos incluyen los siguientes tres dominios:[1]
- (1) Un dominio de dedos RING.
- (2) Uno o dos dominios de dedos de zinc B-box.
- Si sólo hay una B-box presente, siempre será de tipo 2.
- Si hay dos B-box presentes, la de tipo 1 siempre precede a la de tipo 2.
- (3) Una región de hélice superenrollada.
Por su parte, el dominio C-terminal de las proteínas TRIM puede contener:
- Proteínas del grupo 1: un extremo C-terminal que incluye alguno de los siguientes dominios:
- Dominio NHL y dominio IGFLMN, asociados o solos.
- Dominio PHD asociado con un bromodominio.
- [[Dominio MATH (por ejemplo, TRIM37).
- Dominio ARF (por ejemplo, TRIM23).
- Dominio EXOIII (por ejemplo, TRIM19).
- Proteínas del grupo 2: dominio SPRY.
Miembros de la familia
La familia TRIM se divide en dos grupos que difieren en la estructura de los dominios y en la organización genómica:[3]
- Los miembros del grupo 1 poseen diversos dominios posibles en el extremo C-terminal y se encuentran tanto en vertebrados como en invertebrados.
- Los miembros del grupo 2 se encuentran ausentes en invertebrados y poseen siempre en el extremo C-terminal un dominio SPRY.[4]
A continuación se muestran los miembros de cada grupo descritos hasta ahora:
- Grupo 1:
- Con dominios PHD-BROMO: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ) (actúan como correpresores)
- 1-10: TRIM1, TRIM2, TRIM3, TRIM8, TRIM9
- 11-20: TRIM12, TRIM13, TRIM14, TRIM16, TRIM18, TRIM19
- 21-30: TRIM23, TRIM25, TRIM29, TRIM30
- 31-40: TRIM32, TRIM36, TRIM37
- 41-50: TRIM42, TRIM44, TRIM45, TRIM46, TRIM47
- 51-60: TRIM51, TRIM53, TRIM54, TRIM55, TRIM56, TRIM57, TRIM59
- 61-70: TRIM62, TRIM63, TRIM65, TRIM66, TRIM67, TRIM69, TRIM70
- 71-75: TRIM71
- Grupo 2:
- 1-10: TRIM4, TRIM5, TRIM6, TRIM7, TRIM10
- 11-20: TRIM11, TRIM12, TRIM15, TRIM17, TRIM20
- 21-30: TRIM21, TRIM22, TRIM26, TRIM27, TRIM30
- 31-40: TRIM31, TRIM34, TRIM35, TRIM38, TRIM39, TRIM40
- 41-50: TRIM41, TRIM43, TRIM48, TRIM49, TRIM50
- 51-60: TRIM51, TRIM52, TRIM53, TRIM57, TRIM58, TRIM60
- 61-70: TRIM61, TRIM64, TRIM68, TRIM69, TRIM70
- 71-75: TRIM72, TRIM73, TRIM74, TRIM75
Referencias
- ↑ a b Reymond A, Meroni G, Fantozzi A, et al. (2001). «The tripartite motif family identifies cell compartments». Embo J. 20 (9): 2140-51. PMID 11331580. doi:10.1093/emboj/20.9.2140. Error en la cita: Etiqueta
<ref>
no válida; el nombre «pmid11331580» está definido varias veces con contenidos diferentes - ↑ Ozato K, Shin DM, Chang TH, Morse HC (November de 2008). «TRIM family proteins and their emerging roles in innate immunity». Nat. Rev. Immunol. 8 (11): 849-60. PMID 18836477. doi:10.1038/nri2413.
- ↑ Sardiello M, Cairo S, Fontanella B, Ballabio A, Meroni G (2008). «Genomic analysis of the TRIM family reveals two groups of genes with distinct evolutionary properties». BMC Evol. Biol. 8: 225. PMC 2533329. PMID 18673550. doi:10.1186/1471-2148-8-225.
- ↑ Ponting C, Schultz J, Bork P (June de 1997). «SPRY domains in ryanodine receptors (Ca(2+)-release channels)». Trends Biochem. Sci. 22 (6): 193-4. PMID 9204703. doi:10.1016/S0968-0004(97)01049-9.