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La transcriptómica de células individuales permite estudiar la expresión génica de un gran número de células al mismo tiempo. Gracias a su resolución superior respecto a las técnicas transcriptómicas tradicionales puede detectar cambios en los niveles de expresión que serían enmascarados cuando se analiza el material genético de múltiples células en conjunto.[1]
Métodos
Existen diferentes técnicas analíticas que se pueden emplear para medir la expresión génica de células individuales, como la hibridación fluorescente in-situ de ARNm, PCR cuantitativa de células individuales o la secuenciación de ARN de células individuales. [1]
Secuenciación de ARN de células individuales
Las técnicas de secuenciación de ARN de células individuales (llamada single-cell RNA sequencing o scRNA-seq en inglés) involucran la separación de las células, su lisis, la retrotranscripción del ARN a ADNc, su preamplificación por PCR, la creación de librerías y secuenciación de los ADNc.[2][3] Su desarrollo está vinculado a la necesidad de una técnica de secuenciación de ARN aplicable a situaciones en las que hay poco material biológico disponible.[4]
- ↑ a b Kanter, Itamar; Kalisky, Tomer (10 de marzo de 2015). «Single Cell Transcriptomics: Methods and Applications». Frontiers in Oncology 5. ISSN 2234-943X. PMC 4354386. PMID 25806353. doi:10.3389/fonc.2015.00053. Consultado el 20 de enero de 2024.
- ↑ Liu, Serena; Trapnell, Cole (17 de febrero de 2016). «Single-cell transcriptome sequencing: recent advances and remaining challenges». F1000Research (en inglés) 5: 182. ISSN 2046-1402. PMC 4758375. PMID 26949524. doi:10.12688/f1000research.7223.1. Consultado el 20 de enero de 2024.
- ↑ Kolodziejczyk, Aleksandra A.; Kim, Jong Kyoung; Svensson, Valentine; Marioni, John C.; Teichmann, Sarah A. (2015-05). «The Technology and Biology of Single-Cell RNA Sequencing». Molecular Cell 58 (4): 610-620. ISSN 1097-2765. doi:10.1016/j.molcel.2015.04.005. Consultado el 20 de enero de 2024.
- ↑ Tang, Fuchou; Barbacioru, Catalin; Wang, Yangzhou; Nordman, Ellen; Lee, Clarence; Xu, Nanlan; Wang, Xiaohui; Bodeau, John et al. (2009-05). «mRNA-Seq whole-transcriptome analysis of a single cell». Nature Methods (en inglés) 6 (5): 377-382. ISSN 1548-7091. doi:10.1038/nmeth.1315. Consultado el 20 de enero de 2024.