RBM14
La proteína de unión al ARN 14 es una proteína que en humanos está codificada por el gen RBM14.[1][2]
Interacciones[editar]
Se ha demostrado que RBM14 interactúa con TARBP2.[3]
Organismos modelo[editar]
Se han utilizado organismos modelo en el estudio de la función RBM14. Se generó una línea de ratón knockout condicional llamada Rbm14tm1a(KOMP)Wtsi en el Wellcome Trust Sanger Institute.[4] Se sometieron a animales machos y hembras a una prueba de cribado fenotípica estandarizada[5] para determinar los efectos de la eliminación del gen.[6][7][8][9] También se realizó un fenotipado inmunológico en profundidad.[10]
| Características | Fenotipo |
|---|---|
| Todos los datos disponibles en[5] y[10] | |
| Leucocitos en sangre periférica 6 semanas | Normal |
| Insulina | Normal |
| Hematología 6 semanas | Normal |
| Viabilidad homocigótica en P14 | Normal |
| Fertilidad homocigótica | Normal |
| Peso corporal | Normal |
| Evaluación neurológica | Normal |
| Fuerza de prensión | Normal |
| Dismorfología | Normal |
| Calorimetría indirecta | Normal |
| Prueba de tolerancia a la glucosa | Normal |
| Respuesta auditiva del tronco cerebral | Normal |
| DEXA | Normal |
| Radiografía | Normal |
| Morfología ocular | Normal |
| Química clínica | Normal |
| Hematología 16 semanas | Normal |
| Leucocitos en sangre periférica 16 semanas | Normal |
| Peso del corazón | Normal |
| Función citotóxica de células T | Normal |
| Inmunofenotipado del bazo | Normal |
| Inmunofenotipado de ganglios linfáticos mesentéricos | Normal |
| Inmunofenotipado de médula ósea | Normal |
| Composición inmune epidérmica | Normal |
Referencias[editar]
- ↑ «The SYT protein involved in the t(X;18) synovial sarcoma translocation is a transcriptional activator localised in nuclear bodies». Human Molecular Genetics 6 (9): 1559-64. Sep 1997. PMID 9285794. doi:10.1093/hmg/6.9.1559.
- ↑ «Entrez Gene: RBM14 RNA binding motif protein 14».
- ↑ «Identification and characterization of RRM-containing coactivator activator (CoAA) as TRBP-interacting protein, and its splice variant as a coactivator modulator (CoAM)». The Journal of Biological Chemistry 276 (36): 33375-83. Sep 2001. PMID 11443112. doi:10.1074/jbc.M101517200.
- ↑ Gerdin, A. K. (2010). «The Sanger Mouse Genetics Programme: high throughput characterisation of knockout mice». Acta Ophthalmologica 88: 925-7. doi:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x.
- ↑ a b «International Mouse Phenotyping Consortium».
- ↑ «A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function». Nature 474 (7351): 337-42. Jun 2011. PMC 3572410. PMID 21677750. doi:10.1038/nature10163.
- ↑ «Mouse library set to be knockout». Nature 474 (7351): 262-3. junio de 2011. PMID 21677718. doi:10.1038/474262a.
- ↑ «A mouse for all reasons». Cell 128 (1): 9-13. enero de 2007. PMID 17218247. doi:10.1016/j.cell.2006.12.018.
- ↑ «Genome-wide generation and systematic phenotyping of knockout mice reveals new roles for many genes». Cell 154 (2): 452-64. Jul 2013. PMC 3717207. PMID 23870131. doi:10.1016/j.cell.2013.06.022.
- ↑ a b «Infection and Immunity Immunophenotyping (3i) Consortium».
Bibliografía[editar]
- Maruyama, K., Sugano, S. (Jan 1994). «Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides». Gene 138 (1-2): 171-4. PMID 8125298. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8.
- Suzuki, Y., Yoshitomo-Nakagawa, K., Maruyama, K., Suyama, A., Sugano, S. (Oct 1997). «Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library». Gene 200 (1-2): 149-56. PMID 9373149. doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3.
- Iwasaki, T., Chin, W. W., Ko, L. (Sep 2001). «Identification and characterization of RRM-containing coactivator activator (CoAA) as TRBP-interacting protein, and its splice variant as a coactivator modulator (CoAM)». The Journal of Biological Chemistry 276 (36): 33375
-83. PMID 11443112. doi:10.1074/jbc.M101517200.
- Andersen, J. S., Lyon, C. E., Fox, A. H., Leung, A. K., Lam, Y. W., Steen, H., Mann, M., Lamond, A. I. (Jan 2002). «Directed proteomic analysis of the human nucleolus». Current Biology 12 (1): 1-11. PMID 11790298. doi:10.1016/S0960-9822(01)00650-9.
- Brill, L. M., Salomon, A. R., Ficarro, S. B., Mukherji, M., Stettler-Gill, M., Peters, E. C. (May 2004). «Robust phosphoproteomic profiling of tyrosine phosphorylation sites from human T cells using immobilized metal affinity chromatography and tandem mass spectrometry». Analytical Chemistry 76 (10): 2763-72. PMID 15144186. doi:10.1021/ac035352d.
- Beausoleil, S. A., Jedrychowski, M., Schwartz, D., Elias, J. E., Villén, J., Li, J., Cohn, M. A., Cantley, L. C., Gygi, S. P. (agosto de 2004). «Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 101 (33): 12130-5. PMC 514446. PMID 15302935. doi:10.1073/pnas.0404720101.
- Perani, M., Antonson, P., Hamoudi, R., Ingram, C. J., Cooper, C. S., Garrett, M. D., Goodwin, G. H. (Dec 2005). «The proto-oncoprotein SYT interacts with SYT-interacting protein/co-activator activator (SIP/CoAA), a human nuclear receptor co-activator with similarity to EWS and TLS/FUS family of proteins». The Journal of Biological Chemistry 280 (52): 42863-76. PMID 16227627. doi:10.1074/jbc.M502963200.
- Nousiainenm M., Silljém H. H., Sauerm G., Nigg E. A., Körnerm R, (Apr 2006). «Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 103 (14): 5391-6. PMC 1459365. PMID 16565220. doi:10.1073/pnas.0507066103.
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (May 2006). «A protein-protein interaction network for human inherited ataxias and disorders of Purkinje cell degeneration». Cell 125 (4): 801-14. PMID 16713569. doi:10.1016/j.cell.2006.03.032.
- Sui, Y., Yang, Z., Xiong, S., Zhang, L., Blanchard, K. L., Peiper, S. C., Dynan, W. S., Tuan, D., Ko, L. (Feb 2007). «Gene amplification and associated loss of 5' regulatory sequences of CoAA in human cancers». Oncogene 26 (6): 822-35. PMID 16878147. doi:10.1038/sj.onc.1209847.
- Beausoleil, S. A., Villén, J., Gerber, S. A., Rush, J., Gygi, S. P. (Oct 2006). «A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization». Nature Biotechnology 24 (10): 1285-92. PMID 16964243. doi:10.1038/nbt1240.
- Olsen, J. V., Blagoev, B., Gnad, F., Macek, B., Kumar, C., Mortensen, P., Mann, M. (Nov 2006). «Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks». Cell 127 (3): 635-48. PMID 17081983. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026.
- Yang, Z., Sui, Y., Xiong, S., Liour, S. S., Phillips, A. C., Ko, L. (2007). «Switched alternative splicing of oncogene CoAA during embryonal carcinoma stem cell differentiation». Nucleic Acids Research 35 (6): 1919-32. PMC 1874587. PMID 17337438. doi:10.1093/nar/gkl1092.
Datos: Q18035379