Poribacteria

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Poribacteria
Poribacteria localisation using correlative microscopy.gif
Taxonomía
Dominio: Bacteria
(sin rango) Gracilicutes
Filo: Poribacteria
Fieseler et al. 2004

Poribacteria es un filo candidato de bacterias descubierto en 2004, dominante en las comunidades microbianas que residen dentro de las esponjas marinas. Así, el nombre Poribacteria deriva de Porifera, el nombre científico del grupo de las esponjas. Se ha propuesto que los miembros de Poribacteria presentan una compartimentación celular en forma de microcompartimientos bacterianos. Por otra parte, el estudio de los genomas reveló diversas proteínas de la familia phyH, algunas de los cuales pueden estar relacionadas con la captación del fósforo orgánico disuelto en el agua.[1]​ Los análisis genéticos sugieren que puede estar relacionado con el grupo PVC o con el grupo FCB.

La genómica unicelular y los enfoques de secuenciación de escopeta metagenómica revelan un rango de tamaño del genoma es de entre 4,2 y 6,5 megabases que codifican 4254 genes codificadores de proteínas, de los cuales un 24% inusualmente alto no tienen homología a genes conocidos. Entre los genes de homología identificable, las vías reconstruidas sugieren que el metabolismo central poribacteriano es capaz de glucólisis, ciclo del ácido tricarboxílico, vías de pentosa de fosfato, fosforilación oxidativa, la vía de Entner-Doudoroff y fijación de carbono autótrofo a través de la vía de Wood-Ljungdahl. Además, las poribacterias parecen participar en la desnitrificación asimilatoria y la eliminación de amoníaco con una relevancia potencial en el reciclaje de nitrógeno dentro de las esponjas. También se informa que el genoma poribacteriano contiene un número inusualmente alto de sistemas de defensa contra bacteriófagos, incluidos CRISPR-CAS y sistemas de modificación de restricción.[2][3]

Referencias[editar]

  1. Kamke, J., Rinke, C., Schwientek, P., Mavromatis, K., Ivanova, N., Sczyrba, A., ... & Hentschel, U. (2014). The candidate phylum Poribacteria by single-cell genomics: new insights into phylogeny, cell-compartmentation, eukaryote-like repeat proteins, and other genomic features. PloS one, 9(1), e87353.
  2. Siegl, A; Kamke, J; Hochmuth, T; Piel, J; Richter, M; Liang, C; Dandekar, T; Hentschel, U (January 2011). «Single-cell genomics reveals the lifestyle of Poribacteria, a candidate phylum symbiotically associated with marine sponges». The ISME Journal 5 (1): 61-70. PMC 3105677. PMID 20613790. doi:10.1038/ismej.2010.95. 
  3. Kamke, Janine; Sczyrba, Alexander; Ivanova, Natalia; Schwientek, Patrick; Rinke, Christian; Mavromatis, Kostas; Woyke, Tanja; Hentschel, Ute (December 2013). «Single-cell genomics reveals complex carbohydrate degradation patterns in poribacterial symbionts of marine sponges». The ISME Journal (en inglés) 7 (12): 2287-2300. ISSN 1751-7362. PMC 3834845. PMID 23842652. doi:10.1038/ismej.2013.111.