Karissa Sanbonmatsu

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Karissa Sanbonmatsu
Información personal
Nacimiento Rochester (Estados Unidos) Ver y modificar los datos en Wikidata
Nacionalidad Estadounidense
Educación
Educada en
Supervisor doctoral Martin Goldman Ver y modificar los datos en Wikidata
Información profesional
Ocupación Structural biologist Ver y modificar los datos en Wikidata
Área Biología estructural, ARN no codificante y ribosoma Ver y modificar los datos en Wikidata
Empleador Laboratorio Nacional de Los Álamos Ver y modificar los datos en Wikidata
Distinciones
  • Presidential Early Career Award for Scientists and Engineers (2006) Ver y modificar los datos en Wikidata
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Karissa Y. Sanbonmatsu es una bióloga estructural estadounidense transgénero del Laboratorio Nacional de Los Álamos. Trabaja en el mecanismo de los complejos de ARN no codificante, incluidos el ribosoma, los riboswitches, los ARN largos no codificantes y la cromatina. Fue la primera persona en realizar una simulación atomística del ribosoma, determinar la estructura secundaria de un lncRNA intacto y publicar una simulación de mil millones de átomos de un complejo biomolecular.[1]​

Educación y carrera[editar]

Sanbonmatsu nació en Rochester, Nueva York, hija de Joan Loveridge-Sanbonmatsu y Akira Loveridge-Sanbonmatsu, quienes son profesores de comunicación oral en la Universidad Estatal de Nueva York. Asistió a la escuela secundaria de Oswego y fue la mejor estudiante. Ganó el Concurso de Conferencias Científicas de la Sociedad Stokes de Pembroke College en la Universidad de Cambridge. Sanbonmatsu estudió física en la Universidad de Columbia, donde utilizó el radiotelescopio Very Large Array para estimar la distancia al remanente de supernova G27.4 + 0.0 y su fuente central de rayos X,[2]​ que ahora se sabe que es una magnetar.[3]​[4]​ La primera investigación de Sanbonmatsu fue en física del plasma. Obtuvo su doctorado en ciencias astrofísicas en la Universidad de Colorado Boulder con Martin V. Goldman (estudiante de Donald F. Dubois). Su disertación implicó tratamientos analíticos de interacciones onda-onda no lineales en plasmas, aclarando la competencia entre los efectos onda-onda y onda-partícula de Langmuir en la ionosfera auroral.[5]​[6]​[7]​ En 1997, después de obtener su doctorado, Sanbonmatsu se unió al Laboratorio Nacional de Los Álamos como becaria postdoctoral[8]​ bajo Donald F. Dubois (un estudiante de Murray Gell-Mann), determinando el efecto de los procesos cinéticos en las ondas de Langmuir en plasmas.[9]​[10]​ Se interesó por lo que distingue la vida de la materia.[11]​ En 2002, Los Álamos construyó Q-machine, una de las supercomputadoras más rápidas del mundo. La máquina Q permitió a Sanbonmatsu ejecutar la simulación más grande del mundo en biología, publicando la primera simulación del ribosoma en 2005, donde identificó el "corredor de alojamiento" del ribosoma.[12]​

Investigación[editar]

En 2006, Sanbonmatsu fue la primera persona transgénero del Laboratorio Nacional de Los Álamos en recibir el Premio Presidencial de Carrera Temprana para Científicos e Ingenieros.[13]​ En ese momento, la epigenética estaba comenzando a desarrollarse y Sanbonmatsu se dio cuenta de que el ARN podría estar involucrado en cómo se activan y desactivan los genes.[11]​

El Laboratorio Sanbonmatsu en el Laboratorio Nacional de Los Álamos se estableció en 2001.[4]​ Usan una variedad de técnicas computacionales y de laboratorio húmedo para estudiar ribosomas, ARN largo no codificante (lncRNAs), riboswitches[14]​[15]​ y cromatina. Sanbonmatsu ha sido una figura destacada en los estudios estructurales de ARN largos no codificantes en epigenética. Estudió COOLAIR, un tramo de ARN que controla el tiempo y la floración de las plantas.[16]​ Funciona controlando los desencadenantes internos que le dicen a una planta que deje de florecer, que funcionan en combinación con una proteína represora llamada Flowering Locus C. Cuando Sanbonmatsu estudió la estructura del ARN, encontró características que son similares a los ribosomas. En 2012, su grupo fue el primero en describir la estructura secundaria en un lncRNA ; el activador del receptor de hormonas esteroides (SRA).[17]​ Continuó observando cómo la estructura del ARN afectaba el destino de una célula.[18]​ Utiliza la secuenciación de illumina para el sondeo SHAPE de alto rendimiento.[19]​

La primera simulación de mil millones de átomos de un gen completo (GATA4).[1]​

Sanbonmatsu desarrolla simulaciones por computadora para comprender la translocación del ARNt, combinando la fluorescencia de una sola molécula con microscopía electrónica criogénica. Los ribosomas experimentan un cambio dramático en la estructura cuando pasa el ARN de transferencia, y esto fue simulado computacionalmente por Sanbonmatsu.[19]​ Sanbonmatsu también ha escrito sobre ginandromorfismo y cómo el ADN influye en las hormonas, pero las hormonas pueden reprogramar el ADN.[20]​ Fue elegida miembro de la American Physical Society en 2012. Más recientemente, su grupo estableció el récord de la simulación biomolecular publicada más grande del mundo con mil millones de átomos, la primera simulación de un gen completo .

Comunicación científica[editar]

Sanbonmatsu describió su trabajo con la epigenética y se declaró transgénero en un TEDxTalk de 2014.[21]​ Sanbonmatsu pronunció una charla TED en TEDWomen sobre la biología del género, desde el ADN hasta el cerebro, en noviembre de 2018.[22]​[23]​ En la charla, cubrió la epigenética, cómo el ADN puede cambiar debido al trauma y la dieta, y cómo su transición de género la llevó a estudiar el papel de la epigenética en la identidad de género. Sanbonmatsu se ha desempeñado en la junta de Equality New Mexico.[24]​

Referencias[editar]

  1. ↑ a b Jung, Jaewoon; Nishima, Wataru; Daniels, Marcus; Bascom, Gavin; Kobayashi, Chigusa; Adedoyin, Adetokunbo; Wall, Michael; Lappala, Anna et al. (17 de abril de 2019). «Scaling molecular dynamics beyond 100,000 processor cores for large‐scale biophysical simulations». Journal of Computational Chemistry 40 (21): 1919-1930. PMC 7153361. PMID 30994934. doi:10.1002/jcc.25840. 
  2. ↑ Sanbonmatsu, K. Y.; Helfand, D. J. (8 de diciembre de 1992). «A distance determination for the supernova remnant G27.4+0.0 and its central X-ray source». The Astronomical Journal 104: 2189. Bibcode:1992AJ....104.2189S. doi:10.1086/116393. 
  3. ↑ Gao, Z. F.; Peng, Q. H.; Wang, N.; Yuan, J. P. (9 de noviembre de 2012). «Magnetic field decay of magnetars in supernova remnants». Astrophysics and Space Science (en inglés) 342 (1): 55-71. Bibcode:2012Ap&SS.342...55G. ISSN 0004-640X. arXiv:1312.2679. doi:10.1007/s10509-012-1139-x. 
  4. ↑ a b «Keynotes - ACM SIGSOFT 2010 / FSE 18». fse18.cse.wustl.edu. Archivado desde el original el 17 de enero de 2020. Consultado el 11 de abril de 2019. 
  5. ↑ Sanbonmatsu, K. Y.; Newman, D. L.; Goldman, M. V. (1 de junio de 2001). «Quasi-linear Zakharov simulations of Langmuir turbulence at rocket altitudes in the auroral ionosphere». Journal of Geophysical Research: Space Physics (en inglés) 106 (A6): 10519-10535. Bibcode:2001JGR...10610519S. doi:10.1029/2000JA000270. 
  6. ↑ Sanbonmatsu, K. Y.; Doxas, I.; Goldman, M. V.; Newman, D. L. (1 de abril de 1997). «Non-Markovian electron diffusion in the auroral ionosphere at high Langmuir-wave intensities». Geophysical Research Letters (en inglés) 24 (7): 807-810. Bibcode:1997GeoRL..24..807S. doi:10.1029/97GL00669. 
  7. ↑ Sanbonmatsu, K. Y.; Goldman, M. V.; Newman, D. L. (1 de septiembre de 1995). «Nonlinear coupling of lower hybrid waves to the kinetic low-frequency plasma response in the auroral ionosphere». Geophysical Research Letters (en inglés) 22 (17): 2397-2400. Bibcode:1995GeoRL..22.2397S. doi:10.1029/95GL02227. 
  8. ↑ Appel, Susanna (29 de agosto de 2017). «Fellows seminar series: New cryo-EM tools and new biochemical studies of long non-coding RNAs». SciLifeLab (en inglés). Archivado desde el original el 11 de abril de 2019. Consultado el 11 de abril de 2019. 
  9. ↑ Sanbonmatsu, K. Y.; Vu, H. X.; Bezzerides, B.; DuBois, D. F. (2 de mayo de 2000). «The effect of kinetic processes on Langmuir turbulence». Physics of Plasmas (en inglés) 7 (5): 1723-1731. Bibcode:2000PhPl....7.1723S. ISSN 1070-664X. doi:10.1063/1.873991. 
  10. ↑ Sanbonmatsu, K.; Vu, H.; DuBois, D.; Bezzerides, B. (3 de febrero de 1999). «New Paradigm for the Self-Consistent Modeling of Wave-Particle and Wave-Wave Interactions in the Saturation of Electromagnetically Driven Parametric Instabilities». Physical Review Letters (en inglés) 82 (5): 932-935. Bibcode:1999PhRvL..82..932S. ISSN 0031-9007. doi:10.1103/PhysRevLett.82.932. 
  11. ↑ a b Giorgi, Elena E. (15 de febrero de 2016). «Decoding the Dark Matter of the Human Genome». HuffPost (en inglés). Consultado el 11 de abril de 2019. 
  12. ↑ Sanbonmatsu, K. Y.; Joseph, S.; Tung, C.-S. (1 de noviembre de 2005). «Simulating movement of tRNA into the ribosome during decoding». Proceedings of the National Academy of Sciences (en inglés) 102 (44): 15854-15859. Bibcode:2005PNAS..10215854S. ISSN 0027-8424. PMC 1266076. PMID 16249344. doi:10.1073/pnas.0503456102. 
  13. ↑ Energy, Los Alamos National Laboratory, Operated by Los Alamos National Security, LLC, for the U. S. Department of. «Presidential Early Career Awards for Scientists and Engineers (PECASE)». www.lanl.gov (en inglés). Consultado el 11 de abril de 2019. 
  14. ↑ «Sanbonmatsu Team: Models». www.lanl.gov (en inglés). Consultado el 11 de abril de 2019. 
  15. ↑ «Sanbonmatsu Team: People». www.lanl.gov. Consultado el 11 de abril de 2019. 
  16. ↑ «New insights into 'plant memories'». ScienceDaily (en inglés). Consultado el 11 de abril de 2019. 
  17. ↑ Chi, Kelly Rae (20 de enero de 2016). «Finding function in mystery transcripts». Nature (en inglés) 529 (7586): 423-425. Bibcode:2016Natur.529..423C. ISSN 1476-4687. PMID 26791729. doi:10.1038/529423a. 
  18. ↑ «Linking RNA structure and function». MIT News. Consultado el 11 de abril de 2019. 
  19. ↑ a b «Research Objectives». Research Features. Consultado el 12 de abril de 2019. 
  20. ↑ Weintraub, Karen (25 de febrero de 2019). «Split-Sex Animals Are Unusual, Yes, but Not as Rare as You'd Think» (en inglés estadounidense). ISSN 0362-4331. Consultado el 12 de abril de 2019. 
  21. ↑ Sanbonmatsu, Karissa. «How You Know You're in Love: Epigenetics, Stress & Gender Identity». YouTube. Consultado el 13 de abril de 2019. 
  22. ↑ Sanbonmatsu, Karissa, The biology of gender, from DNA to the brain (en inglés), consultado el 11 de abril de 2019 .
  23. ↑ «La biología del género, desde el ADN al cerebro | En la red». Mujeres con ciencia. 10 de marzo de 2019. Consultado el 5 de junio de 2021. 
  24. ↑ «EQNM Board». Equality New Mexico (en inglés estadounidense). Consultado el 29 de mayo de 2021. 

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