Genoma de la leucemia linfática crónica

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Un linfocito sano visto mediante microscopio electrónico de barrido. En la leucemia linfática crónica los linfocitos dejan de cumplir su función inmunitaria.

El genoma de la leucemia linfática crónica, de manera completa en 4 pacientes, fue secuenciado por primera vez en el año 2010 y publicado en la revista Nature el 5 de mayo de 2011.[1] [2] La secuenciación del genoma completo de la leucemia linfática crónica permite conocer los genes mutados -en relación con los genes normales de células no modificadas que afectan a los distintos enfermos-, y establecer cuales son comunes o frecuentes lo que permitirá diseñar tratamientos específicos para cada paciente.[3]

La secuenciación del genoma de la LLC ha sido llevada a cabo por el Proyecto español para la secuenciación del genoma de la LlC -con la participación de más de 60 investigadores de diversas instituciones investigadoras y sanitarias- dirigidos por Elías Campo y Carlos López Otín dentro del Proyecto Internacional del Genoma del Cáncer (International Cancer Genome Consortium).[4] [5]

Proyecto Internacional de Genoma del Cáncer - ICGC[editar]

El Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer (ICGC) es el encargado de organizar y coordinar un gran número de proyectos de investigación que tienen el objetivo común de esclarecer exhaustivamente los cambios genéticos presentes en muchos de los cánceres que afectan a personas en todo el mundo.

El objetivo principal es generar bases de datos globales de carácter público y abierto accesibles a investigadores, médicos y otros especialistas sobre las anomalías genómicas (mutaciones somáticas, expresión anormal de genes, modificaciones epigenéticas) en los tumores de 50 tipos diferentes de cáncer o subtipos de cáncer que son de gran importancia clínica y social en todo el mundo. Los datos se pondrán a disposición de toda la comunidad investigadora con la mayor rapidez posible, y con restricciones mínimas, para acelerar la investigación sobre las causas y el control del cáncer. El ICGC pretende facilitar la comunicación entre los miembros y proporciona un espacio para la coordinación con el objetivo de maximizar la eficiencia entre los científicos que trabajan para entender, tratar y prevenir estas enfermedades.[6]

Proyecto genoma de la LLC (2009 - 2012)[editar]

Frote sanguíneo mostrando linfocitos (morados) en una LLC.

Dentro del proyecto mundial para la secuenciación del genoma del cáncer gestionado por el Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer (ICGC) España es la encargada de la secuencia genómica de la leucemia linfática crónica[7] a través del Proyecto genoma Leucemia linfática crónica - España. El objetivo es secuenciar el genoma en numerosos pacientes y poder establecer las homogeneidades, las variabilidades y, en su caso, un diagnóstico más personalizado y eficaz.[8] El 15 de abril de 2010 fueron publicados en Nature los avances de los primeros resultados de los primeros 5 genomas completos de pacientes con LLC.[9] [10]

Organismos participantes[editar]

El organismo director y financiero es el Instituto de Salud Carlos III (organismo público dependiente del Ministerio de Ciencia e Innovación de España).[11] La dirección científica del proyecto corre a cargo del Dr. Elías Campo y del Dr. Carlos López Otín.[12] [13] Dos de las instituciones que participan y que tienen más tradición y reconocimiento en LLC son el Hospital Clínico y Provincial de Barcelona y el Hospital clínico de Salamanca. También participan la Universidad de Oviedo, el Centro de Regulación Genómica de Barcelona, el Instituto Catalán de Oncología, la Universidad de Deusto, el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas, el Banco Nacional de ADN y la Universidad de Barcelona, con el apoyo técnico para la investigación de la Red Temática en Investigación Cooperativa en Cáncer (RTICC).[14]

Publicación en Nature del genoma de la LLC el 5 junio de 2011[editar]

El 5 de junio de 2011 fue publicado en la revista Nature el artículo -remitido en diciembre de 2010-[15] fruto del trabajo del equipo español responsable del genoma de la LLC[16] y miembro del International Cancer Genome Consortium.[17] [18] [19]

Contenido de la publicación en Nature[editar]

En el artículo Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia (Secuenciación completa del genoma de la leucemia linfática crónica con identificación de las mutaciones recurrentes) puede leerse:[17]

La leucemia linfocítica crónica (LLC), la leucemia más frecuente en adultos en los países occidentales, es una enfermedad heterogénea con diagnóstico y evolución clínica variable. Se pueden distinguir dos subtipos moleculares principales, caracterizados, respectivamente, por un número alto o bajo de hipermutaciones somáticas en la región variable de los genes implicados en la inmunoglobulina. Los cambios moleculares que conducen a la patogénesis de la enfermedad son aún poco conocidos. La publicación presenta la realización de la secuenciación del genoma completo de cuatro casos de leucemia linfática crónica (LLC o CLL) así como la identificación de 46 mutaciones somáticas que pueden afectar la función del gen. Un análisis más detallado de estas mutaciones en 363 pacientes con LLC ha identificado cuatro genes que están mutados de manera recurrente: notch 1 (NOTCH1), exportina 1 (XPO1), diferenciación mieloide del gen de respuesta primaria 88 (MYD88) y Kelch-like 6 (KLHL6). Las mutaciones en MYD88 y KLHL6 predominan en los casos de LLC con los genes de inmunoglobulina mutado, mientras que las mutaciones NOTCH1 y XPO1 se detectaron principalmente en pacientes con inmunoglobulinas sin mutación. Los patrones de mutación somática, con el apoyo de los análisis funcionales y clínicos, indican claramente que las mutaciones recurrentes NOTCH1, MYD88 y XPO1 son cambios oncogénicos que contribuyen a la evolución clínica de la enfermedad. Hasta donde sabemos, este es el primer análisis exhaustivo de la LLC que combina la secuenciación del genoma completo de características clínicas y los resultados clínicos. Es destacable la utilidad de este enfoque para la identificación de mutaciones clínicamente relevantes en el cáncer.[17]

Autores[editar]

Instituciones[editar]

Instituciones españolas
Instituciones británicas

Referencias[editar]

  1. Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia, Nature (2011) doi:10.1038/nature10113 5 de junio de 2011,
  2. CLL Genome, Ministerio de Ciencia e Innovación, España
  3. España pone cerco al tipo de leucemia más común. Un consorcio de 60 investigadores secuencia por primera vez el genoma de cuatro enfermos con la variante crónica de cáncer sanguíneo más frecuente en países desarrollados. Señalan cuatro genes que podrían causar la dolencia, 5/6/2011, Nuño Domínguez - Público (España)
  4. ICG - Consortium CLL
  5. International Cancer Genome ConsortiumConsorcio Internacional del Genoma del Cáncer ICGC
  6. About ICGC - Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer
  7. Chronic Lymphocytic Leukemia - CLL with mutated and unmutated IgVH
  8. Secuenciado el primer genoma de un español, 14/4/2010, Público, España
  9. Los primeros cinco genomas de leucemia linfática crónica, El País, 14/4/2010
  10. Spain - Chronic Lymphocytic Leukemia - CLL with mutated and unmutated IgVH, en ICGC
  11. Ciencia e Innovación financia con 10 M€ a científicos españoles para una importante investigación sobre leucemia
  12. Scientific Directors: Dr. Elías Campo and Dr. Carlos López-Otín - Genome Project CLL
  13. Noticia Genoma LLC - Elías Campo y Carlos López Otín, en Hospital Clínic de Barcelona
  14. Investigadores españoles comienzan a secuenciar el genoma de la leucemia, HC
  15. Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia (Secuenciación completa del genoma de la leucemia linfática crónica con identificación de las mutaciones recurrentes)
  16. Chronic Lymphocytic Leukemia - CLL with mutated and unmutated IgVH
  17. a b c Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia, Nature (2011) doi:10.1038/nature10113 5 de junio de 2011,
  18. CLL Genome, Ministerio de Ciencia e Innovación, España
  19. España pone cerco al tipo de leucemia más común, 5/6/2011 Público (España)
  20. dentifying Structural Rearrangements via Local Assembly of Next-Generation Sequence Data, 2010, videoconferencia, Wellcome Trust Sanger Institute
  21. a b Oncomorfologia funcional humana i experimental, IDIBPAS
  22. Ciencia e Innovación financia con 10 M€ a científicos españoles para una importante investigación sobre leucemia
  23. CNAG -UB, Universidad de Barclona
  24. CNAG - Centro Nacional de Análisis Genómico, Barcelona
  25. CNIO - Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas

Véase también[editar]

Enlaces externos[editar]

Artículo en Nature
Páginas web de ICGC e ICGC-CLL-España
Otras páginas
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