Factor de transcripción

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Esquema de un activador

En biología molecular y genética, un factor de transcripción (a veces llamado factor de unión a una secuencia específica de ADN) es una proteína que une secuencias específicas de ADN, controlando así la transcripción de la información genética de ADN a ARN mensajero.[1] [2] Los factores de transcripción hacen esto solos o en conjunto a otros complejos proteicos promoviendo (como un activador) o silenciando (como un represor) el reclutamiento de la RNA polimerasa (la enzima que hace la transcripción de información genética de ADN a RNA) a genes específicos.[3] [4] [5]

Una característica determinante de los factores de transcripción es que contienen uno o más dominios de unión al ADN (DBD por sus siglas en inglés, DNA-binding domains), los cuales se unen a secuencias específicas de ADN adyacentes a los genes que regulan.[6] [7] Proteínas adicionales como coactivadores, remodeladores de cromatina, histona acetiltransferasas, deacetilasas, cinasas y metiltransferasas, también juegan papeles cruciales en la regulación genética, pero carecen de DBDs y, por lo tanto, no son clasificados como factores de transcripción.[8]

Conservación en diferentes organismos[editar]

Los factores de transcripción son esenciales para la regulación de la expresión genética y son, como consecuencia, encontrados en todos los organismos vivos. La cantidad de factores de transcripción en un organismo se incrementa con el tamaño de su genoma, y genomas más grandes tienden a tener más factores de transcripción por gen.[9]

Hay aproximadamente 2600 proteínas en el genoma humano que contienen dominios de unión al ADN, y se cree que muchos de estos funcionan como factores de transcripción,[10] aunque otros estudios indican que son menos.[11] Por lo tanto, aproximadamente el 10% de los genes en el genoma codifican para factores de transcripción, lo que hace a esta familia la más grande de las familias de proteínas humanas. Además, los genes son normalmente rodeados por varios sitios de unión para diferentes factores de transcripción, y la expresión eficiente de cada uno de estos genes requiere la acción cooperativa de varios factores de transcripción (ver, por ejemplo, los factores de transcripción nuclear del hepatocito). Por lo tanto, el uso combinacional de un grupo de aproximadamente 200 factores de transcripción humanos explica fácilmente la regulación única para cada gen en el genoma humano durante el desarrollo.[8]

Mecanismo[editar]

Los factores de transcripción se unen a regiones potenciadoras (enhancers) o promotoras adyacentes a los genes que regulan. Dependiendo del factor de transcripción, la transcripción del gen adyacente es regulada positiva o negativamente. Los factores de transcripción usan una variedad de mecanismos para regular la expresión genética.[12] Estos mecanismos incluyen:

  • estabilizar o impedir la unión de la ARN polimerasa al ADN
  • catalizar la acetilación o deacetilación de las histonas. El factor de transcripción puede hacer esto directamente o reclutando otras proteínas con esta actividad catalítica. Muchos factores de transcripción usan uno de estos dos mecanismos para regular la transcripción:[13]
    • histona acetiltransferasa (HAT por sus siglas en inglés, histone acetyltransferase) – acetila las histonas, lo que provoca que la asociación del ADN con las histonas se debilite haciendo más accesible al ADN para la transcripción y por lo tanto regulando la transcripción positivamente
    • histona deacetilasa (HDAC por sus siglas en inglés, histone deacetylase) – deacetila las histonas fortaleciendo la asociación del ADN con las histonas y vuelve al ADN menos accesible a la transcripción, por lo tanto regulando la transcripción negativamente
  • reclutamiento de proteínas coactivadoras o correpresor al complejo de factores de transcripción del ADN[14]

Función[editar]

Los factores de transcripción son uno de los grupos de proteínas que leen e interpretan los "planos" genéticos del ADN. Se unen al ADN y ayudan a iniciar un programa de transcripción genética aumentado o disminuido. Como tal, son vitales para muchos procesos celulares. A continuación se describen algunas funciones importantes y papeles biológicos que ivolucran a los factores de transcripción.

Regulación de la transcripción basal[editar]

En eucariontes, una clase importante de los factores de transcripción son los llamados factores generales de transcripción (GTFs por sus siglas en inglés, general transcription factors), los cuales son necesarios para que ocurra la transcripción.[15] [16] [17] Muchos de estos GTFs no se unen al ADN, sino que son parte del complejo de preinicio que interactúa directamente con la ARN polimerasa. Los GTFs más comunes son TFIIA, TFIIB, TFIID (ver también proteína de unión a TATA), TFIIE, TFIIF, and TFIIH.[18] El complejo de preiniciación une las regiones promotoras de ADN río arriba al gen que regulan.

Potenciación diferencial de la transcripción[editar]

Otros factores de transcripción regulan diferencialmente la expresión de varios genes uniéndose las regiones potenciadoras de ADN adyacente a los genes regulados. Estos factores de transcripción son cruciales para garantizar que los genes sean expresados en la célula correcta en el momento indicado y en la cantidad necesaria, dependiendo de los requerimientos del organismo.

Desarrollo[editar]

Muchos factores de transcripción de organismos pluricelulares están involucrados en el desarrollo.[19] Respondiendo al ambiente (estímulos), estos factores de transcripción prenden o apagan la transcripción de los genes apropiados, lo que, como respuesta, permite cambios en la morfología de la célula o actividades necesarias para la determinación del destino de la célula y la diferenciación celular. La familia de factores de transcripción de los genes Hox, por ejemplo, es importante para la formación adecuada de patrones corporales en organismos tan diversos como la mosca de la fruta o humanos.[20] [21] Otro ejemplo es el factor de transcripción codificado por el gen de la región determinate del sexo Y (SRY), el cual juega un papel importante en la determinación del sexo en humanos.[22]

Respuesta a señales intercelulares[editar]

Las células se pueden comunicar entre ellas liberando moléculas que producen cascadas de señalización en otra célula receptora. Si la señal requiere de una regulación positiva o negativa de los genes de la célula receptora, normalmente los factores de transcripción estarán río abajo en la cascada de señalización.[23] La señalización de estrógeno es un ejemplo de una cascada de señales cortas que involucra al factor de transcripción receptor de estrógeno: el estrógeno es secretado por tejidos como ovarios y placenta, cruza la membrana celular de la célula receptora y se une al receptor de estrógeno en el citoplasma de la célula. El receptor de estrógeno viaja al núcleo y se une a su sitio de unión al ADN, cambiando la regulación de la transcripción de los genes asociados.[24]

Respuesta al ambiente[editar]

Los factores de transcripción no solamente actúan río abajo de las cascadas de señalización relacionadas a estímulos biológicos sino que también pueden estar río abajo de las cascadas de señalización involucradas en estímulos ambientales. Ejemplos incluyen al factor de choque de calor (HSF), para el cual genes positivamente regulados son necesarios para sobrevivir a altas temperaturas,[25] al factor de hipoxia inducibe (HIF), para el cual genes positivamente regulados son necesarios para la supervivencia de la célula en ambientes con bajos niveles de oxígeno,[26] y proteína de unión al elemento regulador de esterol (SREBP), el cual ayuda a mantener los niveles de lípidos apropiados en la célula.[27]

Control del ciclo celular[editar]

Muchos factores de transcripción, especialmente algunos que son proto-oncogenes o supresores de tumores, ayudan a regular el ciclo celular y determinar qué tan grande debe ser una célula para dividirse en dos células hijas.[28] [29] Un ejemplo es el oncogén Myc, el cual tiene papeles importantes en el crecimiento celular y apoptosis.[30]

Patogénesis[editar]

Los factores de transcripción también pueden ser utilizados para alterar la expresión genética en una célula huésped para promover patogénesis. Un ejemplo bien estudiado de esto son los efectores TAL secretados por bacterias Xanthomonas. Cuando se le inyecta a las plantas, estas proteínas pueden entrar al núcleo celular, unirse a secuencias promotoras y activar la transcripción de genes de plantas que ayudan en infecciones bacteriales.[31] Los efectores TAL contienen una región central repetida en la cual hay una simple relación entre la identidad de dos residuos críticos en repeticiones secuenciales y bases de ADN secuenciales en el sitio de ataque de los efectores TAL.[32] [33] Esta propiedad posiblemente facilita que estas proteínas evolucionen para poder competir mejor con los mecanismos de defensa de la célula huésped.[34]

Regulación[editar]

Es común en biología que procesos importantes tengan múltiples niveles de regulación y control. Esto también es cierto para los factores de transcripción: los factores de transcripción no solamente controlan la velocidad de transcripción para regular la cantidad de productos genéticos (ARN y proteínas) disponibles a la célula, sino también a los mismos factores de transcripción (normalmente a través de otros factores de transcripción). A continuación se resumen algunas de las formas en que puede ser regulada la actividad de los factores de transcripción.

Síntesis[editar]

Los factores de transcripción (como todas las proteínas) son transcritos de un gen en un cromosoma a ARN y luego el ARN es traducido a proteína. Cualquiera de estos pasos puede ser regulado para afectar la producción (y por lo tanto la actividad) de un factor de transcripción. Una implicación interesante es que los factores de transcripción se pueden regular a sí mismos. Por ejemplo, en una retroalimentación negativa, el factor de transcripción actúa como su propio represor: si la proteína del factor de transcripción se une al ADN de su mismo gen, disminuirá la producción de más de sí mismo. Este es un mecanismo que mantiene estables los niveles de un factor de transcripción en una célula.

Localización nuclear[editar]

En eucariontes, los factores de transcripción (como la mayoría de las proteínas) son transcritos en el núcleo pero son traducidos en el citoplasma celular. Muchas proteínas que son activas en el núcleo contienen señales de localización nuclear que las dirigen directamente al núcleo. Pero, para muchos factores de transcripción, esto es una parte clave en su regulación.[35] Clases importantes de factores de transcripción, como algunos receptores nucleares, primero deben unirse a un ligando en el citoplasma antes de que puedan trasladarse al núcleo.[35]

Activación[editar]

Los factores de transcripción pueden ser activados (o desactivados) a través de su dominio de detección de señales por varios mecanismos, que incluyen:

  • unión de ligandos – La unión de ligandos no solamente es capaz de influenciar dónde se encuentra un factor de transcripción en la célula sino que también afecta si el factor de transcripción está en estado activo y capaz de unirse al ADN u otros cofactores (ver, por ejemplo, receptores nucleares).
  • fosforilación[36] [37] – Muchos factores de transcripción como las proteínas STAT deben ser fosforiladas antes de unirse al ADN.
  • interacción con otros factores de transcripción (ej. homo o heterodimerización) o proteínas correguladoras.

Accesibilidad al sitio de unión a ADN[editar]

En eucariontes, el ADN está organizado con la ayuda de histonas en partículas compactas llamadas nucleosomas, donde secuencias de cerca de 147 bases de ADN hacen ~1.65 vueltas alrededor de los octámeros proteicos de histonas. El ADN en los nucleosomas es inaccesible a muchos de los factores de transcripción. Algunos factores de transcripción, llamados factores pioneros, sí son capaces de unirse a sus sitios de unión al ADN en el ADN nucleosomal. Para la mayoría del resto de los factores de transcripción, el nucleosoma debe ser activamente desenredado por motores moleculares como remodeladores de cromatina.[38] Alternativamente, el nucleosoma puede ser parcialmente abierto por fluctuaciones térmicas, permitiendo un acceso temporal al sitio de unión del factor de transcripción. En muchos casos, para unirse a sus sitios de unión al ADN, un factor de transcripción necesita competir contra otros factores de transcripción o histonas y otras proteínas de la cromatina.[39] Ciertos pares de factores de transcripción y otras proteínas pueden desempeñar funciones antagónicas (activadores contra represores) en la regulación del mismo gen.

Disponibilidad de otros cofactores/factores de transcripción[editar]

La mayoría de los factores de transcripción no funcionan solos. Por lo general, para que ocurra la transcripción de un gen, una cierta cantidad de factores de transcripción se deben unir a las secuencias de ADN reguladoras. Este grupo de factores de transcripción reclutan proteínas intermediarias como cofactores que permiten un reclutamiento eficiente del complejo de preinicio y la ARN polimerasa. Por lo tanto, para que un factor de transcripción inicie la transcripción, el resto de las proteínas deben estar presentes y el factor de transcripción debe estar en el estado en que se puede unir a ellas si es necesario. Los cofactores son proteínas que modulan los efectos de los factores de transcripción. Estos son intercambiables entre promotores específicos de genes; el complejo proteico que ocupa el promotor de ADN y la secuencia de aminoácidos del cofactor determinan su conformación espacial. Por ejemplo, ciertos receptores esteroideos pueden intercambiar cofactores con NF-κB, el cual es un interruptor entre inflamación y diferenciación celular, por lo que los esteroides pueden afectar la respuesta inflamatoria y función de ciertos tejidos.[40]

Estructura[editar]

Diagrama esquemático de la secuencia de aminoácidos (amino terminal a la izquiera y carboxílico a la derecha) de una factor de transcripción prototípico que contiene (1) un dominio de unión a ADN (DBD), (2) un dominio de detección de señal (SSD) y un dominio de transactivación (TAD). El orden de posicionamiento y el número de dominios pueden variar en diferentes tipos de factores de transcripción. Además, las funciones de trasnactivación y detección de señal son frecuentemente contenidos bajo el mismo dominio.

Los factores de transcripción son modulares en estructura y contienen los siguientes dominios:[1]

  • Dominio de unión a ADN (DBD), el cual se une a secuencias específicas de ADN (potenciadores o promotores) adyacentes a los genes regulados. Es un componente necesario para todos los vectores. Se utiliza para dirigir la transcripción de las secuencias promotoras de transgen del vector. Las secuencias de ADN que unen factores de transcripción se llaman elementos de respuesta.
  • Dominio de transactivación (TAD), el cual contiene sitios de unión para otras proteínas como correguladoras de transcripción. Estos sitios de unión se conocen como funciones activadoras (AFs).[41]
  • Un dominio de detección de señal (SSD) opcional (ej. un dominio de unión de ligando), el cual detecta señales externas y, como respuesta, transmite estas señales al resto del complejo de la transcripción, resultando en la regulación positiva o negativa de la expresión genética. También, el DBD y SSD pueden residir en proteínas diferentes que se asocian en el complejo de la transcripción para regular la expresión genética.

Dominio de transactivación[editar]

TAD es el dominio del factor de transcripción que une proteínas como las correguladoras de la transcripción. Las proteínas que contienen TAD son Gal4, Gcn4, Oaf1, Leu3, Rtg3, Pho4, Gln3 en levaduras y p53, NFAT, NF-κB y VP16 en mamíferos.[42] Muchos TADs son de 9 aminoácidos (presentes por ejemplo en p53, VP16, MLL, E2A, HSF1, NF-IL6, NFAT1 y NF-κB Gal4, Pdr1, Oaf1, Gcn4, VP16, Pho4, Msn2, Ino2 y P201).

Dominio de unión al ADN[editar]

Ejemplo de arquitectura del dominio: Represor de Lactosa (LacI). El extremo N terminal del dominio de unión al ADN (marcado) del represor lac se une a su objetivo secuencia de ADN (amarillo) en el surco mayor usando el motivo hélice-giro-hélice. La unión de la molécula efectora (verde) ocurre en el centro del domino (marcado), una señal del dominio de sentido. Este ocasiona una respuesta alostérica mediada por la región de unión (marcada).

La parte (dominio) del factor de transcripción que se une al ADN se llama dominio de unión al ADN. A continuación está una lista parcial de algunas de las familias más importantes de los dominios de unión al ADN/factores de transcripción:

Familia InterPro Pfam SCOP
hélice-bucle-hélice básico[43] IPR001092 PF00010 47460
zipper de leucina básico (bZIP)[44] IPR004827 PF00170 57959
dominio efector del extremo C de los reguladores de la respuesta bipartita IPR001789 PF00072 46894
caja GCC 54175
hélice-giro-hélice[45]
proteínas de homeodominio, las cuales son codificados por los genes homeobox, son factores de transcripción. Proteínas de homeodominios son críticas en la regulación del desarrollo.[46] [47] IPR009057 PF00046 46689
represor tipo lambda IPR010982 47413
srf-like (factor de respuesta al suero) IPR002100 PF00319 55455
genes Pax[48]
hélice alada IPR013196 PF08279 46785
dedos de zinc[49]
* multi-dominios Cys2His2 dedos de zinc[50] IPR007087 PF00096 57667
* Zn2/Cys6 57701
* Zn2/Cys8 receptor nuclear de dedo de zinc IPR001628 PF00105 57716

Elementos de respuesta[editar]

La secuencia de ADN a la que se une un factor de transcripción se conoce como el sitio de unión del factor de transcripción o elemento de respuesta.[51]

Los factores de transcripción interactúan con su sitio de unión utilizando una combinación de fuerzas electrostáticas (de las cuales los puentes de hidrógeno son un caso especial) y de Van der Waals. Debido a la naturaleza de estas interacciones químicas, la mayoría de los factores de transcripción se unen al ADN de manera secuencial específica. Sin embargo, no todas las bases en el sitio de unión del factor de transcripción tienen que interactuar con el factor de transcripción. Además, algunas de estas interacciones pueden ser más débiles que otras. Por lo tanto, los factores de transcripción no se unen a solamente una secuencia sino que son capaces de unirse a un grupo de secuencias relacionadas, cada una con una fuerza de interacción diferente.

Por ejemplo, aunque el sitio de unión consenso para la proteína de unión a TATA (TBP) es TATAAAA, el factor de transcripción TBP se puede unir a secuencia similares como TATATAT o TATATAA.

Como los factores de transcripción se pueden unir a secuencias semejantes y estas secuencias tienden a ser cortas, sitios potenciales de unión de los factores de transcripción pueden ocurrir al azar si el ADN es lo suficientemente largo. Es raro, de todos modos, que un factor de transcripción se una a todas las secuencias compatibles en el genoma de una célula. Otras restricciones, como las accesibilidad al ADN en la célula o la disponibilidad de los cofactores, pueden dictar dónde se unirá un factor de transcripción. Así, dada la secuencia del genoma, permanece siendo difícil predecir dónde se unirá un factor de transcripción en una célula viva.

La especificidad adicional de reconocimiento puede ser obtenido a través del uso de más de un dominio de unión al ADN (por ejemplo, DBDs en tándem en el mismo factor de transcripción o a través de la dimerización de dos factores de transcripción) que una dos o más secuencias adyacentes de ADN.

Importancia clínica[editar]

Los factores de transcripción son de relevancia clínica por al menos dos razones: (1) mutaciones pueden ser asociadas con enfermedades específicas y (2) pueden ser objetivos de medicamentos.

Enfermedades[editar]

Debido a su importancia en el desarrollo, la señalización intercelular y el ciclo celular, algunas enfermedades humanas han sido asociadas a mutaciones en los factores de transcripción.[52]

Muchos factores de transcripción son oncogenes o supresores de tumores y, por lo tanto, mutaciones o regulaciones anormales son asociadas al cáncer. Se conocen tres grupos de factores de transcripción que son impotantes en el cáncer humano: (1) familias NF-κB y AP-1, (2) la familia STAT y (3) los receptores esteroideos.[53]

A continuación hay otros ejemplos estudiados:

Condición Descripción Locus
Síndrome de Rett Mutaciones en el factor de transcripción MECP2 están asociadas al síndrome de Rett, una enfermedad del neurodesarrollo.[54] [55] Xq28
Diabetes Una forma rara de diabetes llamada MODY (por sus siglas en inglés, Maturity Onset Diabetes of the Young) puede ser causada por mutaciones en los factores nucleares de hepatocitos (HNFs)[56] o del factor-1 del promotor de insulina (IPF1/Pdx1).[57] múltiple
Dispraxia verbal del desarrollo Mutaciones en el factor de transcripción FOXP2 se asocian a la dispraxia verbal del desarrollo, una enfermedad donde los individuos son incapaces de producir movimientos finamente coordinados requeridos para el habla.[58] 7q31
Enfermedades autoimmunes Mutaciones en el factor de transcripción FOXP3 causan una forma rara de enfermedades autoinmunes conocida como IPEX.[59] Xp11.23-q13.3
Síndrome de Li-Fraumeni Causada por mutaciones en el supresor de tumores p53.[60] 17p13.1
Cáncer de mama La familia STAT es relevante en el cáncer de mama.[61] múltiple
Múltiples cánceres La familia HOX es involucrada en una variedad de cánceres.[62] múltiple

Objetivos potenciales de los medicamentos[editar]

Aproximadamente el 10% de los medicamentos actualmente prescritos tienen como objetivo al receptor nuclear.[63] Otros ejemplos son tamoxifeno y bicalutamida para el tratamiento de cáncer de mama y próstata, respectivamente, y varios tipos de esteroides antiinflamatorios y anabólicos.[64] Además, los factores de transcripción son comúnmente modulados indirectamente por medicamnetos a través de cascadas de señalización. Se cree que es posible afectar otros factores de transcripción menos investigados como NF-κB con medicamentos.[65] [66] [67] [68] Los factores de transcripción fuera de la familia de receptores nucleares son pensados que son objetivos más dificíles con terapias de moléculas pequeñas ya que no es claro que sean "medicables" pero se ha hecho progreso en la ruta de señalización Notch.[69]

Papel en la evolución[editar]

Duplicaciones genéticas han sido cruciales para la evolución de la especie. Esto se aplica particularmente a los factores de transcripción. Una vez que ocurren duplicados, las mutaciones acumuladas que codifican para una copia puede ocurrir sin afectar negativamente la regulación de objetivos río abajo. Sin embargo, cambios de las especificidades de unión al ADN de la única copia del factor de transcripción LEAFY, que ocurre en la mayoría de las plantas terrestres, han sido explicadas. En ese aspecto, una única copia del factor de transcripción puede experimentar un cambio de especificidad a través de intermediarios promiscuos sin perder su función. Mecanismo similares han sido propuestos en el contexto de todas la hipótesis filogenéticas alternativas, y el papel de los factores de transcripción en la evolución de todas las especies.[70] [71]

Análisis[editar]

Hay diferentes tecnologías disponibles para analizar los factores de transcripción. A nivel genómico, secuenciación de ADN[72] e investigación por bases de datos se utilizan comúnmente.[73] La versión proteica del factor de transcripción es detectable por anticuerpos específicos. La muestra se detecta con un western blot. Utilizando un EMSA (electrophoretic mobility shift assay),[74] se puede detectar el perfil de activación de los factores de transcripción. Un enfoque múltiple para el perfil de activación es un microarreglo de factored de transcripción donde varios de estos pueden ser detectados en paralelo. Esta tecnología se basa en microarreglos de ADN, proporcionando la secuencia específica de unión al ADN para la proteína del factor de transcripción en la superficie del arreglo.[75]

Clases[editar]

Como es descrito a ás detalle a continuación, los factores de transcripción pueden ser clasificados por su (1) mecanismo de acción, (2) función regulatoria o (3) homología de secuencia (y por lo tanto, similaridad estructural) en sus dominios de unión al ADN.

Mecanística[editar]

Hay tres clases mecanísticas de los factores de transcripción:

  • Factores generales de la transcripción: involucrados en la formación del complejo de preinico. Los más comunes son TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF y TFIIH. Son ubicuos e interactúan con su la región del promotor basal alrededor del sitio de inicio de la transcripción de odas las clases II de genes.[76]
  • Los factores de transcripción río arriba son proteínas que se unen en algún lugar río arriba del sitio de inicio para estimular o reprimir la transcripción. Son casi sinónimos con los factores de transcripción específicos, porque varían considerablemente dependiendo de la secuencia de reconocimiento presente en la proximidad del gen.[77]
Ejemplos de factores de transcripción específicos[77]
Factor Tipo estructural Secuencia de reconocimiento Se une como
SP1 Dedo de zinc 5'-GGGCGG-3' Monómero
AP-1 Cremallera básica 5'-TGA(G/C)TCA-3' Dímero
C/EBP Cremallera básica 5'-ATTGCGCAAT-3' Dímero
HSF Cremallera básica 5'-XGAAX-3' Trímero
ATF/CREB Cremallera básica 5'-TGACGTCA-3' Dímero
c-Myc Hélice-giro-hélice básico 5'-CACGTG-3' Dímero
Oct-1 Hélice-giro-hélice 5'-ATGCAAAT-3' Monómero
NF-1 Nuevo 5'-TTGGCXXXXXGCCAA-3' Dímero
(G/C) = G or C
X = A, T, G o C

Funcional[editar]

Los factores de transcripción han sido clasificados acorde a su función regulatoria:[8]

  • I. constitutivamente activo – presentes en todas las células todo el tiempo – factores generales de la transcripción, Sp1, NF1, CCAAT
  • II. condicionalmente activo – requiere activación
    • II.A de desarrollo (específico de la célula) – la expresión es controlada fuertemente, pero una vez expresados, no requiere de activación adicional – GATA, HNF, PIT-1, MyoD, Myf5, Hox, Hélice alada
    • II.B dependiente de señal – requiere una señal externa para su activación
      • II.B.1 dependiente de ligando extracelular (endócrino o parácrino) – receptores nucleares
      • II.B.2 dependiente de ligando intracelular (autócrino) - activado por pequeñas moléculas intercelulares – SREBP, p53, receptores nucleares húerfanos
      • II.B.3 dependeitne de membrana celular – cascadas de señalización de segundo mensajero que resultan en la fosforilación del factor de transcripción
        • II.B.3.a factores residentes nucleares – residen en el núcleo independientemente de su estado de activación – CREB, AP-1, Mef2
        • II.B.3.b factores latentes citoplásmicos – la forma inactiva reside en el citoplasma, pero activados se trnaslocan al núcleo – STAT, R-SMAD, NF-κB, Notch, TUBBY, NFAT

Etructural[editar]

Los factores de transcripción son normalmente clasificados basados en su similaridad de la secuencia y por lo tanto la estructura terciaria de sus dominios de unión a ADN:[78] [79] [80]

  • 1 Súperclase: Dominios básicos
    • 1.1 Clase: factores de cremallera de leucina factors (bZIP)
      • 1.1.1 Familia: Componentes (tipo) AP-1; incluye (c-Fos/c-Jun)
      • 1.1.2 Familia: CREB
      • 1.1.3 Familia: Factores tipo C/EBP
      • 1.1.4 Familia: bZIP / PAR
      • 1.1.5 Familia: Factores de unión G-box de planta
      • 1.1.6 Familia: ZIP solo
    • 1.2 Clase: Factores hélice-giro-hélice (bHLH)
      • 1.2.1 Familia: Factores ubicuos (Clase A)
      • 1.2.2 Familia: Factores de transcripción myogénica (MyoD)
      • 1.2.3 Familia: Achaete-Scute
      • 1.2.4 Familia: Tal/Twist/Atonal/Hen
    • 1.3 Clase: Factores hélice-giro-hélice / cremallera de leucina (bHLH-ZIP)
      • 1.3.1 Familia: Factore ubicuos bHLH-ZIP; incluye USF (USF1, USF2); SREBP (SREBP)
      • 1.3.2 Familia: Factores del control del ciclo celular; incluye c-Myc
    • 1.4 Clase: NF-1
      • 1.4.1 Familia: NF-1 (A, B, C, X)
    • 1.5 Clase: RF-X
      • 1.5.1 Familia: RF-X (1,2,3,4,5, ANK)
    • 1.6 Clase: bHSH
  • 2 Súperclase: Dominio de unión a ADN coordinado por zinc
    • 2.1 Clase: Dedos de zinc Cys4 de tipo receptor nuclear
    • 2.2 Clase: Diversos dedos de zinc Cys4
      • 2.2.1 Familia: Factores GATA
    • 2.3 Clase: Dominio dedo de zinc Cys2His2
      • 2.3.1 Familia: Factores ubicuos, incluye TFIIIA, Sp1
      • 2.3.2 Familia: Reguladores del desarrollo/ ciclo celular; incluye Krüppel
      • 2.3.4 Familia: Factores grandes con propiedades de unión tipo NF-6B
    • 2.4 Clase: Grupo Cys6 cysteina-zinc
    • 2.5 Clase: Composición alternada de dedos de zinc
  • 3 Súperclase: Hélice-giro-hélice
    • 3.1 Clase: Homeodominio
      • 3.1.1 Familia: Solo homeodominio; incluye Ubx
      • 3.1.2 Familia: Factores de dominio POU; incluye Oct
      • 3.1.3 Familia: Homeodominio con la región LIM
      • 3.1.4 Familia: Homeodominio más motivos de dedo se zinc
    • 3.2 Clase: Caja apareada
      • 3.2.1 Familia: Homeodominio apareado
      • 3.2.2 Familia: Dominio apareado solo
    • 3.3 Clase: Fox / Hélice alada
      • 3.3.1 Familia: Reguladores del desarrollo; incluye a Fox
      • 3.3.2 Familia: Reguladores específicos de tejidos
      • 3.3.3 Familia: Factores de control del ciclo celular
      • 3.3.0 Familia: Otros reguladores
    • 3.4 Clase: Factores de choque de calor
      • 3.4.1 Familia: HSF
    • 3.5 Clase: Cúmulos de triptófano
      • 3.5.1 Familia: Myb
      • 3.5.2 Familia: Tipo Ets
      • 3.5.3 Familia: Factores reguladores de interferón
    • 3.6 Clase: Dominio TEA
      • 3.6.1 Familia: TEA (TEAD1, TEAD2, TEAD3, TEAD4)
  • 4 Súperclase: Factores beta-Andamio con Contactos Menores
    • 4.1 Clase: RHR (Region de homología Rel)
      • 4.1.1 Familia: Rel/ankirin; NF-kappaB
      • 4.1.2 Familia: ankirin solo
      • 4.1.3 Familia: NFAT (Factor Nuclear de células T Activadas) (NFATC1, NFATC2, NFATC3)
    • 4.2 Clase: STAT
      • 4.2.1 Familia: STAT
    • 4.3 Clase: p53
      • 4.3.1 Familia: p53
    • 4.4 Clase: Caja MADS
      • 4.4.1 Familia: Reguladores de diferenciación; incluye a (Mef2)
      • 4.4.2 Familia: Respuest a señales externas, SRF (Factor de respuesta a suero) (HGNC SRF )
      • 4.4.3 Familia: Reguladores metabólicos (ARG80)
    • 4.5 Clase: Factores de transcripción beta-barril alpha-hélice
    • 4.6 Clase: Proteínas de unión a TATA
      • 4.6.1 Familia: TBP
    • 4.7 Clase: HMG-box
      • 4.7.1 Familia: Genes SOX, SRY
      • 4.7.2 Familia: TCF-1 (TCF1)
      • 4.7.3 Familia: Relacionado a HMG2, SSRP1
      • 4.7.4 Familia: UBF
      • 4.7.5 Familia: MATA
    • 4.8 Clase: Factores heteroméricos CCAAT
      • 4.8.1 Familia: Factores heteroméricos CCAAT
    • 4.9 Clase: Grainyhead
      • 4.9.1 Familia: Grainyhead
    • 4.10 Clase: Factores de choque de frío
      • 4.10.1 Familia: csd
    • 4.11 Clase: Runt
      • 4.11.1 Familia: Runt
  • 0 Súperclase: Otros factores de transcripción
    • 0.1 Clase: Proteínas de puño de cobre
    • 0.2 Clase: HMGI(Y) (HMGA1)
      • 0.2.1 Familia: HMGI(Y)
    • 0.3 Clase: Domion de bolsillo
    • 0.4 Clase: Factores tipo E1A
    • 0.5 Clase: Factores relacionados AP2/EREBP
      • 0.5.1 Familia: AP2
      • 0.5.2 Familia: EREBP
      • 0.5.3 Súperfamilia: AP2/B3
        • 0.5.3.1 Familia: ARF
        • 0.5.3.2 Familia: ABI
        • 0.5.3.3 Familia: RAV

Véase también[editar]

Referencias[editar]

  1. a b Latchman DS (Dec 1997). «Transcription factors: an overview». The International Journal of Biochemistry & Cell Biology 29 (12): 1305-12. doi:10.1016/S1357-2725(97)00085-X. PMID 9570129. 
  2. Karin M (Feb 1990). «Too many transcription factors: positive and negative interactions». The New Biologist 2 (2): 126-31. PMID 2128034. 
  3. Roeder RG (Sep 1996). «The role of general initiation factors in transcription by RNA polymerase II». Trends in Biochemical Sciences 21 (9): 327-35. doi:10.1016/0968-0004(96)10050-5. PMID 8870495. 
  4. Nikolov DB, Burley SK (Jan 1997). «RNA polymerase II transcription initiation: a structural view». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 94 (1): 15-22. Bibcode:1997PNAS...94...15N. doi:10.1073/pnas.94.1.15. PMC 33652. PMID 8990153. 
  5. Lee TI, Young RA (2000). «Transcription of eukaryotic protein-coding genes». Annual Review of Genetics 34: 77-137. doi:10.1146/annurev.genet.34.1.77. PMID 11092823. 
  6. Mitchell PJ, Tjian R (Jul 1989). «Transcriptional regulation in mammalian cells by sequence-specific DNA binding proteins». Science 245 (4916): 371-8. Bibcode:1989Sci...245..371M. doi:10.1126/science.2667136. PMID 2667136. 
  7. Ptashne M, Gann A (Apr 1997). «Transcriptional activation by recruitment». Nature 386 (6625): 569-77. Bibcode:1997Natur.386..569P. doi:10.1038/386569a0. PMID 9121580. 
  8. a b c Brivanlou AH, Darnell JE (Feb 2002). «Signal transduction and the control of gene expression». Science 295 (5556): 813-8. Bibcode:2002Sci...295..813B. doi:10.1126/science.1066355. PMID 11823631. 
  9. van Nimwegen E (Sep 2003). «Scaling laws in the functional content of genomes». Trends in Genetics 19 (9): 479-84. doi:10.1016/S0168-9525(03)00203-8. PMID 12957540. 
  10. Babu MM, Luscombe NM, Aravind L, Gerstein M, Teichmann SA (Jun 2004). «Structure and evolution of transcriptional regulatory networks». Current Opinion in Structural Biology 14 (3): 283-91. doi:10.1016/j.sbi.2004.05.004. PMID 15193307. 
  11. List Of All Transcription Factors In Human
  12. Gill G (2001). «Regulation of the initiation of eukaryotic transcription». Essays in Biochemistry 37: 33-43. doi:10.1042/bse0370033. PMID 11758455. 
  13. Narlikar GJ, Fan HY, Kingston RE (Feb 2002). «Cooperation between complexes that regulate chromatin structure and transcription». Cell 108 (4): 475-87. doi:10.1016/S0092-8674(02)00654-2. PMID 11909519. 
  14. Xu L, Glass CK, Rosenfeld MG (Apr 1999). «Coactivator and corepressor complexes in nuclear receptor function». Current Opinion in Genetics & Development 9 (2): 140-7. doi:10.1016/S0959-437X(99)80021-5. PMID 10322133. 
  15. Robert O. J. Weinzierl (1999). Mechanisms of Gene Expression: Structure, Function and Evolution of the Basal Transcriptional Machinery. World Scientific Publishing Company. ISBN 1-86094-126-5. 
  16. Reese JC (Apr 2003). «Basal transcription factors». Current Opinion in Genetics & Development 13 (2): 114-8. doi:10.1016/S0959-437X(03)00013-3. PMID 12672487. 
  17. Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW (2003). «The RNA polymerase II elongation complex». Annual Review of Biochemistry 72: 693-715. doi:10.1146/annurev.biochem.72.121801.161551. PMID 12676794. 
  18. Thomas MC, Chiang CM (2006). «The general transcription machinery and general cofactors». Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology 41 (3): 105-78. doi:10.1080/10409230600648736. PMID 16858867. 
  19. Lobe CG (1992). «Transcription factors and mammalian development». Current Topics in Developmental Biology. Current Topics in Developmental Biology 27: 351-83. doi:10.1016/S0070-2153(08)60539-6. ISBN 978-0-12-153127-0. PMID 1424766. 
  20. Lemons D, McGinnis W (Sep 2006). «Genomic evolution of Hox gene clusters». Science 313 (5795): 1918-22. Bibcode:2006Sci...313.1918L. doi:10.1126/science.1132040. PMID 17008523. 
  21. Moens CB, Selleri L (Mar 2006). «Hox cofactors in vertebrate development». Developmental Biology 291 (2): 193-206. doi:10.1016/j.ydbio.2005.10.032. PMID 16515781. 
  22. Ottolenghi C, Uda M, Crisponi L, Omari S, Cao A, Forabosco A, Schlessinger D (Jan 2007). «Determination and stability of sex». BioEssays 29 (1): 15-25. doi:10.1002/bies.20515. PMID 17187356. 
  23. Pawson T (1993). «Signal transduction--a conserved pathway from the membrane to the nucleus». Developmental Genetics 14 (5): 333-8. doi:10.1002/dvg.1020140502. PMID 8293575. 
  24. Osborne CK, Schiff R, Fuqua SA, Shou J (Dec 2001). «Estrogen receptor: current understanding of its activation and modulation». Clinical Cancer Research 7 (12 Suppl): 4338s-4342s; discussion 4411s-4412s. PMID 11916222. 
  25. Shamovsky I, Nudler E (Mar 2008). «New insights into the mechanism of heat shock response activation». Cellular and Molecular Life Sciences 65 (6): 855-61. doi:10.1007/s00018-008-7458-y. PMID 18239856. 
  26. Benizri E, Ginouvès A, Berra E (Apr 2008). «The magic of the hypoxia-signaling cascade». Cellular and Molecular Life Sciences 65 (7-8): 1133-49. doi:10.1007/s00018-008-7472-0. PMID 18202826. 
  27. Weber LW, Boll M, Stampfl A (Nov 2004). «Maintaining cholesterol homeostasis: sterol regulatory element-binding proteins». World Journal of Gastroenterology 10 (21): 3081-7. doi:10.3748/wjg.v10.i21.3081. PMID 15457548. 
  28. Wheaton K, Atadja P, Riabowol K (1996). «Regulation of transcription factor activity during cellular aging». Biochemistry and Cell Biology = Biochimie Et Biologie Cellulaire 74 (4): 523-34. doi:10.1139/o96-056. PMID 8960358. 
  29. Meyyappan M, Atadja PW, Riabowol KT (1996). «Regulation of gene expression and transcription factor binding activity during cellular aging». Biological Signals 5 (3): 130-8. doi:10.1159/000109183. PMID 8864058. 
  30. Evan G, Harrington E, Fanidi A, Land H, Amati B, Bennett M (Aug 1994). «Integrated control of cell proliferation and cell death by the c-myc oncogene». Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences 345 (1313): 269-75. doi:10.1098/rstb.1994.0105. PMID 7846125. 
  31. Boch J, Bonas U (2010). «Xanthomonas AvrBs3 family-type III effectors: discovery and function». Annual Review of Phytopathology 48: 419-36. doi:10.1146/annurev-phyto-080508-081936. PMID 19400638. 
  32. Moscou MJ, Bogdanove AJ (Dec 2009). «A simple cipher governs DNA recognition by TAL effectors». Science 326 (5959): 1501. Bibcode:2009Sci...326.1501M. doi:10.1126/science.1178817. PMID 19933106. 
  33. Boch J, Scholze H, Schornack S, Landgraf A, Hahn S, Kay S, Lahaye T, Nickstadt A, Bonas U (Dec 2009). «Breaking the code of DNA binding specificity of TAL-type III effectors». Science 326 (5959): 1509-12. Bibcode:2009Sci...326.1509B. doi:10.1126/science.1178811. PMID 19933107. 
  34. Voytas DF, Joung JK (Dec 2009). «Plant science. DNA binding made easy». Science 326 (5959): 1491-2. Bibcode:2009Sci...326.1491V. doi:10.1126/science.1183604. PMID 20007890. 
  35. a b Whiteside ST, Goodbourn S (Apr 1993). «Signal transduction and nuclear targeting: regulation of transcription factor activity by subcellular localisation». Journal of Cell Science 104 (4): 949-55. PMID 8314906. 
  36. Bohmann D (Nov 1990). «Transcription factor phosphorylation: a link between signal transduction and the regulation of gene expression». Cancer Cells 2 (11): 337-44. PMID 2149275. 
  37. Weigel NL, Moore NL (Oct 2007). «Steroid receptor phosphorylation: a key modulator of multiple receptor functions». Molecular Endocrinology 21 (10): 2311-9. doi:10.1210/me.2007-0101. PMID 17536004. 
  38. Teif VB, Rippe K (Sep 2009). «Predicting nucleosome positions on the DNA: combining intrinsic sequence preferences and remodeler activities». Nucleic Acids Research 37 (17): 5641-55. doi:10.1093/nar/gkp610. PMC 2761276. PMID 19625488. 
  39. Teif VB, Rippe K (Oct 2010). «Statistical-mechanical lattice models for protein-DNA binding in chromatin». Journal of Physics. Condensed Matter 22 (41): 414105. arXiv:1004.5514. Bibcode:2010JPCM...22O4105T. doi:10.1088/0953-8984/22/41/414105. PMID 21386588. 
  40. Copland JA, Sheffield-Moore M, Koldzic-Zivanovic N, Gentry S, Lamprou G, Tzortzatou-Stathopoulou F, Zoumpourlis V, Urban RJ, Vlahopoulos SA (Jun 2009). «Sex steroid receptors in skeletal differentiation and epithelial neoplasia: is tissue-specific intervention possible?». BioEssays 31 (6): 629-41. doi:10.1002/bies.200800138. PMID 19382224. 
  41. Wärnmark A, Treuter E, Wright AP, Gustafsson JA (Oct 2003). «Activation functions 1 and 2 of nuclear receptors: molecular strategies for transcriptional activation». Molecular Endocrinology 17 (10): 1901-9. doi:10.1210/me.2002-0384. PMID 12893880. 
  42. Piskacek S, Gregor M, Nemethova M, Grabner M, Kovarik P, Piskacek M (Jun 2007). «Nine-amino-acid transactivation domain: establishment and prediction utilities». Genomics 89 (6): 756-68. doi:10.1016/j.ygeno.2007.02.003. PMID 17467953. 
  43. Littlewood TD, Evan GI (1995). «Transcription factors 2: helix-loop-helix». Protein Profile 2 (6): 621-702. PMID 7553065. 
  44. Vinson C, Myakishev M, Acharya A, Mir AA, Moll JR, Bonovich M (Sep 2002). «Classification of human B-ZIP proteins based on dimerization properties». Molecular and Cellular Biology 22 (18): 6321-35. doi:10.1128/MCB.22.18.6321-6335.2002. PMC 135624. PMID 12192032. 
  45. Wintjens R, Rooman M (Sep 1996). «Structural classification of HTH DNA-binding domains and protein-DNA interaction modes». Journal of Molecular Biology 262 (2): 294-313. doi:10.1006/jmbi.1996.0514. PMID 8831795. 
  46. Gehring WJ, Affolter M, Bürglin T (1994). «Homeodomain proteins». Annual Review of Biochemistry 63: 487-526. doi:10.1146/annurev.bi.63.070194.002415. PMID 7979246. 
  47. Bürglin TR, Affolter M (Oct 2015). «Homeodomain proteins: an update». Chromosoma. Oct 13. doi:10.1007/s00412-015-0543-8. PMID 26464018. 
  48. Dahl E, Koseki H, Balling R (Sep 1997). «Pax genes and organogenesis». BioEssays 19 (9): 755-65. doi:10.1002/bies.950190905. PMID 9297966. 
  49. Laity JH, Lee BM, Wright PE (Feb 2001). «Zinc finger proteins: new insights into structural and functional diversity». Current Opinion in Structural Biology 11 (1): 39-46. doi:10.1016/S0959-440X(00)00167-6. PMID 11179890. 
  50. Wolfe SA, Nekludova L, Pabo CO (2000). «DNA recognition by Cys2His2 zinc finger proteins». Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure 29: 183-212. doi:10.1146/annurev.biophys.29.1.183. PMID 10940247. 
  51. Wang JC (Mar 2005). «Finding primary targets of transcriptional regulators». Cell Cycle 4 (3): 356-8. doi:10.4161/cc.4.3.1521. PMID 15711128. 
  52. Semenza, Gregg L. (1999). Transcription factors and human disease. Oxford [Oxfordshire]: Oxford University Press. ISBN 0-19-511239-3. 
  53. Libermann TA, Zerbini LF (Feb 2006). «Targeting transcription factors for cancer gene therapy». Current Gene Therapy 6 (1): 17-33. doi:10.2174/156652306775515501. PMID 16475943. 
  54. Moretti P, Zoghbi HY (Jun 2006). «MeCP2 dysfunction in Rett syndrome and related disorders». Current Opinion in Genetics & Development 16 (3): 276-81. doi:10.1016/j.gde.2006.04.009. PMID 16647848. 
  55. Chadwick LH, Wade PA (Apr 2007). «MeCP2 in Rett syndrome: transcriptional repressor or chromatin architectural protein?». Current Opinion in Genetics & Development 17 (2): 121-5. doi:10.1016/j.gde.2007.02.003. PMID 17317146. 
  56. Maestro MA, Cardalda C, Boj SF, Luco RF, Servitja JM, Ferrer J (2007). «Distinct roles of HNF1beta, HNF1alpha, and HNF4alpha in regulating pancreas development, beta-cell function and growth». Endocrine Development 12: 33-45. doi:10.1159/0000109603 (inactivo 2015-01-01). PMID 17923767. 
  57. Al-Quobaili F, Montenarh M (Apr 2008). «Pancreatic duodenal homeobox factor-1 and diabetes mellitus type 2 (review)». International Journal of Molecular Medicine 21 (4): 399-404. doi:10.3892/ijmm.21.4.399. PMID 18360684. 
  58. Lennon PA, Cooper ML, Peiffer DA, Gunderson KL, Patel A, Peters S, Cheung SW, Bacino CA (Apr 2007). «Deletion of 7q31.1 supports involvement of FOXP2 in language impairment: clinical report and review». American Journal of Medical Genetics Part A 143A (8): 791-8. doi:10.1002/ajmg.a.31632. PMID 17330859. 
  59. van der Vliet HJ, Nieuwenhuis EE (2007). «IPEX as a result of mutations in FOXP3». Clinical & Developmental Immunology 2007: 89017. doi:10.1155/2007/89017. PMC 2248278. PMID 18317533. 
  60. Iwakuma T, Lozano G, Flores ER (Jul 2005). «Li-Fraumeni syndrome: a p53 family affair». Cell Cycle 4 (7): 865-7. doi:10.4161/cc.4.7.1800. PMID 15917654. 
  61. "Roles and Regulation of Stat Family Transcription Factors in Human Breast Cancer" 2004Uso incorrecto de la plantilla enlace roto (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial y la última versión).
  62. "Transcription factors as targets and markers in cancer" Workshop 2007
  63. Overington JP, Al-Lazikani B, Hopkins AL (Dec 2006). «How many drug targets are there?». Nature Reviews. Drug Discovery 5 (12): 993-6. doi:10.1038/nrd2199. PMID 17139284. 
  64. Gronemeyer H, Gustafsson JA, Laudet V (Nov 2004). «Principles for modulation of the nuclear receptor superfamily». Nature Reviews. Drug Discovery 3 (11): 950-64. doi:10.1038/nrd1551. PMID 15520817. 
  65. Bustin SA, McKay IA (Jun 1994). «Transcription factors: targets for new designer drugs». British Journal of Biomedical Science 51 (2): 147-57. PMID 8049612. 
  66. Butt TR, Karathanasis SK (1995). «Transcription factors as drug targets: opportunities for therapeutic selectivity». Gene Expression 4 (6): 319-36. PMID 7549464. 
  67. Papavassiliou AG (Aug 1998). «Transcription-factor-modulating agents: precision and selectivity in drug design». Molecular Medicine Today 4 (8): 358-66. doi:10.1016/S1357-4310(98)01303-3. PMID 9755455. 
  68. Ghosh D, Papavassiliou AG (2005). «Transcription factor therapeutics: long-shot or lodestone». Current Medicinal Chemistry 12 (6): 691-701. doi:10.2174/0929867053202197. PMID 15790306. 
  69. Moellering RE, Cornejo M, Davis TN, Del Bianco C, Aster JC, Blacklow SC, Kung AL, Gilliland DG, Verdine GL, Bradner JE (Nov 2009). «Direct inhibition of the NOTCH transcription factor complex». Nature 462 (7270): 182-8. Bibcode:2009Natur.462..182M. doi:10.1038/nature08543. PMC 2951323. PMID 19907488. Resumen divulgativoThe Scientist. 
  70. Sayou C, Monniaux M, Nanao MH, Moyroud E, Brockington SF, Thévenon E, Chahtane H, Warthmann N, Melkonian M, Zhang Y, Wong GK, Weigel D, Parcy F, Dumas R (2014). «A promiscuous intermediate underlies the evolution of LEAFY DNA binding specificity». Science (New York, N.Y.) 343 (6171): 645-8. doi:10.1126/science.1248229. PMID 24436181. 
  71. Jin J, He K, Tang X, Li Z, Lv L, Zhao Y, Luo J, Gao G (2015). «An Arabidopsis Transcriptional Regulatory Map Reveals Distinct Functional and Evolutionary Features of Novel Transcription Factors». Molecular Biology and Evolution 32 (7): 1767-73. doi:10.1093/molbev/msv058. PMC 4476157. PMID 25750178. 
  72. EntrezGene database
  73. Grau J, Ben-Gal I, Posch S, Grosse I (2006). «VOMBAT: prediction of transcription factor binding sites using variable order Bayesian trees». Nucleic Acids Research 34 (Web Server issue): W529-33. doi:10.1093/nar/gkl212. PMC 1538886. PMID 16845064. 
  74. Wenta N, Strauss H, Meyer S, Vinkemeier U (Jul 2008). «Tyrosine phosphorylation regulates the partitioning of STAT1 between different dimer conformations». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105 (27): 9238-43. Bibcode:2008PNAS..105.9238W. doi:10.1073/pnas.0802130105. PMC 2453697. PMID 18591661. 
  75. Sermeus A, Cosse JP, Crespin M, Mainfroid V, de Longueville F, Ninane N, Raes M, Remacle J, Michiels C (2008). «Hypoxia induces protection against etoposide-induced apoptosis: molecular profiling of changes in gene expression and transcription factor activity». Molecular Cancer 7: 27. doi:10.1186/1476-4598-7-27. PMC 2330149. PMID 18366759. 
  76. Orphanides G, Lagrange T, Reinberg D (Nov 1996). «The general transcription factors of RNA polymerase II». Genes & Development 10 (21): 2657-83. doi:10.1101/gad.10.21.2657. PMID 8946909. 
  77. a b Walter F. Boron (2003). Medical Physiology: A Cellular And Molecular Approaoch. Elsevier/Saunders. pp. 125-126. ISBN 1-4160-2328-3. 
  78. Stegmaier P, Kel AE, Wingender E (2004). «Systematic DNA-binding domain classification of transcription factors». Genome Informatics. International Conference on Genome Informatics 15 (2): 276-86. PMID 15706513. Archivado desde el original el 19 de junio de 2013. 
  79. Matys V, Kel-Margoulis OV, Fricke E, Liebich I, Land S, Barre-Dirrie A, Reuter I, Chekmenev D, Krull M, Hornischer K, Voss N, Stegmaier P, Lewicki-Potapov B, Saxel H, Kel AE, Wingender E (Jan 2006). «TRANSFAC and its module TRANSCompel: transcriptional gene regulation in eukaryotes». Nucleic Acids Research 34 (Database issue): D108-10. doi:10.1093/nar/gkj143. PMC 1347505. PMID 16381825. 
  80. «TRANSFAC database». Consultado el 5 de agosto de 2007. 

Enlaces externos[editar]