Marco abierto de lectura

Esquema de un marco abierto de lectura, que incluye el codón de inicio (o start) y de parada (o stop).

En genética se llama marco abierto de lectura (siglas ORF del inglés Open reading frame) a cada una de las secuencias de ADN comprendida entre un codón de inicio (AUG) de la traducción y un codón de terminación, descontando las secuencias que corresponden a los intrones en caso de haberlas. Se encuentra acotado por los UTRs, o secuencias no traducidas.

En una secuencia de ADN cualquiera hay, a priori, 6 posibles sentidos en los que pueden aparecer marcos abiertos de lectura; dado que cada codón toma 3 nucleótidos, existen 3 posibles lugares de inicio para tomar los nucleótidos de 3 en 3, si se tomara un cuarto nucleótido como lugar de inicio, haría coincidir el marco abierto de lectura con el mismo que si se toma el primer nucleótido. A lo que hay que sumar los otros 3 posibles marcos abiertos de lectura si el ADN es traducido tomando como molde la hebra complementaria, dando el sentido de lectura opuesto.

Estos marcos abiertos de lectura se denominan +1, +2, +3, -1, -2 y -3.

En un ejemplo con la secuencia 5' aactgcagtacgtaacgtca 3'

+3 5'   a act gca gta cgt aac gtc a 3'
+2 5'  aa ctg cag tac gta acg tca   3'
+1 5' aac tgc agt acg taa cgt ca    3'
-1 3' ttg acg tca tgc att gca gt    5'
-2 3'  tt gac gtc atg cat tgc agt   5'
-3 3'   t tga cgt cat gca ttg cag t 5'

Cada uno de los 6 posibles marcos abiertos de lectura dará lugar a una secuencia proteica absolutamente diferente.

Véase también

• Codón
• Código genético
• Alineamiento de secuencias
• Bioinformática
• Predicción de genes
• Secuenciación de ADN
• UTR

Enlaces externos

• StarORF Un multi-plataforma, basada en Java, la herramienta de interfaz gráfica de usuario para predecir y analizar ORFs y la obtención de revertir secuencia del complemento.