Ensayo de cambio en la corrida electroforética

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El ensayo de cambio en la corrida electroforética o EMSA por sus iniciales en inglés (electrophoretic mobility shift assay) es un técnica utilizada para investigar interacciones entre proteínas y ADN o ARN. La técnica se basa en una corrida electroforética entre fragmentos de DNA o RNA marcados y la presencia de extractos celulares. El ensayo básico para el ADN consiste en un carril sólo con el fragmento de ADN de interés marcado, un segundo carril con el mismo ADN mas proteínas que, en las condiciones dadas, no interaccionan con el mismo, y el tercer carril conteniendo el mismo fragmento de ADN mas las proteínas con supuesta interacción con esa secuencia. Dependiendo del resultado del tercer carril se puede determinar si existió o no interacción. Un fragmento de ADN interaccionando con proteínas tiende a recorrer menos distancia a través del gel en el mismo tiempo que en los carriles 1 o 2, y por lo tanto se debería ver retrasado. Esta técnica está basada en los trabajos de Garner y Revzin[1] y Fried y Crothers[2]

Referencias[editar]

  1. Garner MM, Revzin A (July 1981). «A gel electrophoresis method for quantifying the binding of proteins to specific DNA regions: application to components of the Escherichia coli lactose operon regulatory system». Nucleic Acids Res. 9 (13):  pp. 3047–60. doi:10.1093/nar/9.13.3047. PMID 6269071. PMC 327330. http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=6269071. 
  2. Fried M, Crothers DM (December 1981). «Equilibria and kinetics of lac repressor-operator interactions by polyacrylamide gel electrophoresis». Nucleic Acids Res. 9 (23):  pp. 6505–25. doi:10.1093/nar/9.23.6505. PMID 6275366. PMC 327619. http://nar.oxfordjournals.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=6275366.