Dominio proteico

De Wikipedia, la enciclopedia libre
Saltar a: navegación, búsqueda
Proteína con tres dominios (PDB 1pkn ).

Un dominio proteico es la zona de la proteína donde se halla mayor densidad. Es decir, donde hay mas plegamientos. Una cadena polipéptidica puede tener uno o más dominios. Si una proteína está formada por más de una cadena polipeptidica, los dominios de cada cadena de polipéptidos son sus dominios. Inclusive una proteína formada por más de una cadena polipéptidica puede tener un solo dominio, compartido por las cadenas de polipéptidos.

Un dominio proteico puede ser funcional si es una unidad modular de la proteína que lleva a cabo una función bioquímica determinada, y estructural si se refiere a un componente estable de la estructura.[1]

Métodos[editar]

El método de Wodak y Janin[2] se fundamenta en las zonas de interfaz calcula entre dos segmentos de la cadena con varias incidencias en posiciones diferentes de residuos. Las áreas de interfaz se calculan mediante la comparación de las superficies de los segmentos troceados con el de la estructura nativa. Dominio de los límites potenciales pueden ser identificados en un sitio donde la zona de interfase se encontraba en un mínimo. Otros métodos han utilizado medidas de accesibilidad disolvente para calcular la compacidad.3

Referencias[editar]

  1. Nelson, Peter (2006). Bioquímica ilustrada. Ed. Elsevier España. ISBN 84-458-1604-7. 
  2. Wodak, S. J. and Janin, J (1981). Location of structural domains in protein. Biochemistry. pp. 6544–6552. ISBN 84-458-1604-7. 

Enlaces externos[editar]