ARID1A

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ARID1A

Estructura tridimensional de la proteína ARID1A.
Fuente: PDB.
Estructuras disponibles
PDB Búsqueda en Ortholog: PDBeRCSB
Identificadores
Símbolos ARID1A (HUGO: 11110); ; B120; BAF250; BAF250a; BM029; C1orf4; ELD; MRD14; OSA1; P270; SMARCF1; hELD; hOSA1
Identificadores externos OMIM603024 MGI1935147 HomoloGene21216 GeneCardsGen ARID1A
Locus Cr. 1 p35.3
Patrones de expresión RNA
PBB GE ARID1A 210649 s at tn.png
PBB GE ARID1A 212152 x at tn.png
PBB GE ARID1A 218917 s at tn.png
Mayor información
Ortología
Especies Humano Ratón
Entrez 8289 93760
Ensembl Véase HS Véase MM
UniProt O14497 A2BH40
RefSeq (mRNA) NM_006015 NM_001080819
RefSeq (proteína) NCBI NP_006006 NP_001074288
Ubicación (UCSC) Chr 1:
27.02 – 27.11 Mb
Chr 4:
133.68 – 133.76 Mb
PubMed (búsqueda) [1] [2]

La proteína ARID1A ("dominio de interacción rico en AT de la proteína A1", del inglés "AT-rich interactive domain-containing protein 1A") es una proteína humana codificada por el gen arid1A.[1] [2] [3] Este gen codifica una proteína de la familia SWI/SNF, cuyos miembros tienen actividades de tipo helicasa y ATPasa, y están implicados en la regulación de la transcripción de determinados genes por medio de alteraciones en la estructura de la cromatina en la región que alberga dichos genes. La proteína codificada forma parte del complejo SNF/SWI de remodelación de la cromatina dependiente de ATP, el cual es necesario para la activación transcripcional de genes normalmente reprimidos por la estructura de la cromatina. ARID1A posee al menos dos dominios conservados que podrían ser cruciales para esta función. El primero de ellos, es un dominio de unión a ADN que puede unirse específicamente a regiones del ADN ricas en AT. El segundo de ellos, es el dominio C-terminal de la proteína el cual es capaz de estimular la activación de la transcripción de glucocorticoides dependientes de receptor. Parece ser que esta proteína confiere especificidad al complejo SNF/SWI y podría ser la responsable de reclutar y dirigir el complejo a sus dianas correspondientes por medio de interacciones proteína-ADN o proteína-proteína. Cabe destacar que han sido descritos dos transcritos diferentes provenientes del mismo gen, que dan lugar a dos isoformas de la proteína.[3]

Interacciones[editar]

La proteína ARID1A ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

Referencias[editar]

  1. Takeuchi T, Furihata M, Heng HH, Sonobe H, Ohtsuki Y (Aug 1998). «Chromosomal mapping and expression of the human B120 gene». Gene 213 (1-2):  pp. 189–93. PMID 9630625. 
  2. Takeuchi T, Chen BK, Qiu Y, Sonobe H, Ohtsuki Y (Feb 1998). «Molecular cloning and expression of a novel human cDNA containing CAG repeats». Gene 204 (1-2):  pp. 71–7. PMID 9434167. 
  3. a b «Entrez Gene: ARID1A AT rich interactive domain 1A (SWI-like)».
  4. Kato, Hiroyuki; Tjernberg Agneta, Zhang Wenzhu, Krutchinsky Andrew N, An Woojin, Takeuchi Tamotsu, Ohtsuki Yuji, Sugano Sumio, de Bruijn Diederik R, Chait Brian T, Roeder Robert G (Feb. 2002). «SYT associates with human SNF/SWI complexes and the C-terminal region of its fusion partner SSX1 targets histones». J. Biol. Chem. (United States) 277 (7):  pp. 5498–505. doi:10.1074/jbc.M108702200. ISSN 0021-9258. PMID 11734557. 
  5. a b Wang, W; Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari P A, Biggar S R, Muchardt C, Kalpana G V, Goff S P, Yaniv M, Workman J L, Crabtree G R (Oct. 1996). «Purification and biochemical heterogeneity of the mammalian SWI-SNF complex». EMBO J. (ENGLAND) 15 (19):  pp. 5370–82. ISSN 0261-4189. PMID 8895581. 
  6. Zhao, K; Wang W, Rando O J, Xue Y, Swiderek K, Kuo A, Crabtree G R (Nov. 1998). «Rapid and phosphoinositol-dependent binding of the SWI/SNF-like BAF complex to chromatin after T lymphocyte receptor signaling». Cell (UNITED STATES) 95 (5):  pp. 625–36. ISSN 0092-8674. PMID 9845365. 

Enlaces externos[editar]